Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G076100.1
Synonym Sb08g006840
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PC77
Pfam -
Panther DB PTHR33165 PTHR33165:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17030 : F-box family protein with a domain of unknown function (DUF295)
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g57830.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G036400 Ca exchanger 2(PubMedID : 22196357)@sodium/calcium exchanger protein, putative, expressed K07300: chaA, Ca2+:H+ antiporter
2 Sobic.008G059700 expressed protein -
3 Sobic.001G188100 expressed protein K15191: La-related protein 7
4 Sobic.008G053750 - -
5 Sobic.005G204500 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.008G043300 - -
7 Sobic.008G056700 - -
8 Sobic.009G075400 RALFL17 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, expressed -
9 Sobic.008G119501 - -
10 Sobic.002G066300 expressed protein -
11 Sobic.001G002400 OsSub55 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
12 Sobic.001G097000 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
13 Sobic.007G167000 EF hand family protein, putative, expressed K13448: calcium-binding protein CML
14 Sobic.006G282000 cytochrome c, putative, expressed K08738: cytochrome c
15 Sobic.004G293300 zinc-binding protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G335200 monocopper oxidase, putative, expressed -
17 Sobic.005G023700 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
18 Sobic.009G091300 - -
19 Sobic.002G303500 actin-depolymerizing factor, putative, expressed K05765: cofilin
20 Sobic.003G394801 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G076100 Sobic008G076100 Sobic004G036400 Sobic004G036400 Sobic008G076100--Sobic004G036400 Sobic008G059700 Sobic008G059700 Sobic008G076100--Sobic008G059700 Sobic001G188100 Sobic001G188100 Sobic008G076100--Sobic001G188100 Sobic008G053750 Sobic008G053750 Sobic008G076100--Sobic008G053750 Sobic005G204500 Sobic005G204500 Sobic008G076100--Sobic005G204500 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic008G076100--Sobic008G043300 Sobic008G056700 Sobic008G056700 Sobic008G076100--Sobic008G056700 Sobic009G075400 Sobic009G075400 Sobic008G076100--Sobic009G075400 Sobic008G119501 Sobic008G119501 Sobic008G076100--Sobic008G119501 Sobic004G036400--Sobic001G188100 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic004G036400--Sobic001G409000 Sobic007G001800 Sobic007G001800 Sobic004G036400--Sobic007G001800 Sobic003G445600 Sobic003G445600 Sobic004G036400--Sobic003G445600 Sobic009G016900 Sobic009G016900 Sobic004G036400--Sobic009G016900 Sobic004G036400--Sobic005G204500 Sobic004G217200 Sobic004G217200 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Octagon: transcription factors


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