Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G305900.1
Synonym Sb02g033610
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QEB0
Pfam -
Panther DB PTHR37731
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G09430 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g49510.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014684
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2D02G076800 , TraesCS2D02G076800 , TraesCS2A02G079400 , TraesCS2B02G094200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G097500 - -
2 Sobic.003G436100 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
3 Sobic.009G188200 - -
4 Sobic.003G173200 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, putative, expressed -
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7 Sobic.002G334700 - -
8 Sobic.003G172000 - -
9 Sobic.002G152100 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed -
10 Sobic.006G037800 - -
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14 Sobic.002G400700 - -
15 Sobic.003G059450 - -
16 Sobic.003G268100 - -
17 Sobic.002G121050 - -
18 Sobic.009G094100 - -
19 Sobic.009G215100 jacalin-like lectin domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G149600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G305900 Sobic002G305900 Sobic009G097500 Sobic009G097500 Sobic002G305900--Sobic009G097500 Sobic003G436100 Sobic003G436100 Sobic002G305900--Sobic003G436100 Sobic009G188200 Sobic009G188200 Sobic002G305900--Sobic009G188200 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic002G305900--Sobic003G173200 Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic002G305900--Sobic005G176300 SobicK031400 SobicK031400 Sobic002G305900--SobicK031400 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic002G305900--Sobic002G334700 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic002G305900--Sobic003G172000 Sobic002G152100 Sobic002G152100 Sobic002G305900--Sobic002G152100 Sobic009G097500--Sobic003G173200 Sobic009G097500--Sobic003G172000 Sobic009G097500--Sobic005G176300 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic009G097500--Sobic002G121050 Sobic009G097500--Sobic002G152100 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic009G097500--Sobic003G268100 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic009G097500--Sobic005G024500 Sobic009G097500--SobicK031400 Sobic009G097500--Sobic009G188200 Sobic003G436100--Sobic009G188200 Sobic003G059450 Sobic003G059450 Sobic003G436100--Sobic003G059450 Sobic003G436100--Sobic002G334700 Sobic003G436100--Sobic009G097500 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic003G436100--Sobic002G094100 Sobic007G179266 Sobic007G179266 Sobic003G436100--Sobic007G179266 Sobic006G200650 Sobic006G200650 Sobic003G436100--Sobic006G200650 Sobic003G436100--Sobic005G176300 Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic003G436100--Sobic003G205000 Sobic009G188200--Sobic003G436100 Sobic009G188200--Sobic003G059450 Sobic009G188200--Sobic009G097500 Sobic009G188200--Sobic007G179266 Sobic009G188200--Sobic005G176300 Sobic009G188200--Sobic006G200650 Sobic009G188200--Sobic002G334700 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic009G188200--Sobic004G127350 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic009G188200--Sobic010G052100 Sobic003G173200--Sobic003G268100 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic003G173200--Sobic009G215100 Sobic003G173200--SobicK031400 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic003G173200--Sobic007G116150 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic003G173200--Sobic010G098800 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic003G173200--Sobic010G143700 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic003G173200--Sobic006G053550 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic003G173200--Sobic004G223700 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic003G173200--Sobic002G073000 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic005G176300--Sobic009G094100 Sobic005G176300--Sobic010G052100 Sobic005G176300--Sobic003G268100 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic005G176300--Sobic004G072600 Sobic005G176300--Sobic003G173200 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic005G176300--Sobic003G251000 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic005G176300--Sobic010G247750 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic005G176300--Sobic006G037800 Sobic005G176300--Sobic004G127350 SobicK031400--Sobic003G268100 SobicK031400--Sobic003G173200 SobicK031400--Sobic010G143700 SobicK031900 SobicK031900 SobicK031400--SobicK031900 SobicK031400--Sobic009G215100 Sobic001G224500 Sobic001G224500 SobicK031400--Sobic001G224500 SobicK031400--Sobic007G116150 SobicK031400--Sobic006G053550 SobicK031400--Sobic010G098800 Sobic002G334700--Sobic003G205000 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic002G334700--Sobic002G199300 Sobic002G334700--Sobic009G215100 Sobic002G334700--Sobic006G053550 Sobic002G334700--Sobic003G436100 Sobic002G334700--Sobic003G059450 Sobic002G334700--Sobic009G188200 Sobic002G334700--Sobic002G094100 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic002G334700--Sobic003G031300 Sobic003G172000--Sobic002G121050 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic003G172000--Sobic002G149600 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic003G172000--Sobic004G272950 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic003G172000--Sobic002G074700 Sobic003G172000--Sobic009G094100 Sobic003G172000--Sobic005G024500 Sobic003G172000--Sobic002G152100 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic003G172000--Sobic006G094900 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic003G172000--Sobic003G263450 Sobic002G152100--Sobic004G272950 Sobic002G152100--Sobic003G172000 Sobic002G152100--Sobic002G121050 Sobic002G152100--Sobic003G173200 Sobic002G152100--Sobic004G223700 Sobic002G152100--Sobic007G116150 Sobic002G152100--Sobic003G268100 Sobic002G152100--Sobic009G094100 Sobic002G152100--Sobic010G143700
Octagon: transcription factors


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