Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G321200.1
Synonym Sb02g034940
Functional annotation vrga1, putative, expressed
UniProt C5XA16
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF636
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14470 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g33740.1 : vrga1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G053500 bile acid sodium symporter family protein, putative, expressed K03453: bile acid:Na+ symporter, BASS family
2 Sobic.002G075300 receptor kinase, putative, expressed -
3 Sobic.006G199601 - -
4 Sobic.001G325100 DUF623 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G075400 receptor kinase, putative, expressed -
6 Sobic.010G055900 - -
7 Sobic.002G365200 - -
8 Sobic.001G449300 LYK, putative, expressed -
9 Sobic.008G138850 - -
10 Sobic.002G074700 receptor kinase, putative, expressed -
11 Sobic.001G288500 expressed protein K10756: replication factor C subunit 3/5
12 Sobic.009G195100 NLI interacting factor-like phosphatase, putative, expressed K17496: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50
13 Sobic.006G094900 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.010G045966 - -
15 Sobic.001G251750 - K03935: NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 2
16 Sobic.005G024500 expressed protein -
17 Sobic.002G149600 - -
18 Sobic.001G279800 lecithin cholesterol acyltransferase, putative, expressed -
19 Sobic.009G078401 - -
20 Sobic.003G012750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G321200 Sobic002G321200 Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic002G321200--Sobic008G053500 Sobic002G075300 Sobic002G075300 Sobic002G321200--Sobic002G075300 Sobic006G199601 Sobic006G199601 Sobic002G321200--Sobic006G199601 Sobic001G325100 Sobic001G325100 Sobic002G321200--Sobic001G325100 Sobic002G075400 Sobic002G075400 Sobic002G321200--Sobic002G075400 Sobic010G055900 Sobic010G055900 Sobic002G321200--Sobic010G055900 Sobic002G365200 Sobic002G365200 Sobic002G321200--Sobic002G365200 Sobic001G449300 Sobic001G449300 Sobic002G321200--Sobic001G449300 Sobic008G138850 Sobic008G138850 Sobic002G321200--Sobic008G138850 Sobic008G053500--Sobic002G365200 Sobic008G053500--Sobic006G199601 Sobic008G053500--Sobic001G325100 Sobic010G045966 Sobic010G045966 Sobic008G053500--Sobic010G045966 Sobic003G012750 Sobic003G012750 Sobic008G053500--Sobic003G012750 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic008G053500--Sobic002G074700 Sobic010G025600 Sobic010G025600 Sobic008G053500--Sobic010G025600 Sobic001G288500 Sobic001G288500 Sobic008G053500--Sobic001G288500 Sobic008G053500--Sobic008G138850 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic002G075300--Sobic002G018200 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic002G075300--Sobic003G263450 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic002G075300--Sobic007G079901 Sobic002G075300--Sobic002G074700 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic002G075300--Sobic002G149600 Sobic002G075300--Sobic008G053500 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic002G075300--Sobic004G334501 Sobic004G159866 Sobic004G159866 Sobic002G075300--Sobic004G159866 Sobic002G075300--Sobic002G365200 Sobic005G110517 Sobic005G110517 Sobic006G199601--Sobic005G110517 Sobic006G199601--Sobic001G288500 Sobic006G199601--Sobic008G053500 Sobic006G199601--Sobic003G012750 Sobic006G199601--Sobic001G325100 Sobic006G199601--Sobic010G055900 Sobic006G199601--Sobic010G025600 Sobic010G167700 Sobic010G167700 Sobic006G199601--Sobic010G167700 Sobic010G127700 Sobic010G127700 Sobic006G199601--Sobic010G127700 Sobic001G325100--Sobic008G053500 Sobic001G325100--Sobic008G138850 Sobic001G325100--Sobic002G075400 Sobic001G325100--Sobic010G045966 Sobic001G325100--Sobic006G199601 Sobic009G078401 Sobic009G078401 Sobic001G325100--Sobic009G078401 Sobic001G279800 Sobic001G279800 Sobic001G325100--Sobic001G279800 Sobic001G325100--Sobic010G055900 Sobic009G255400 Sobic009G255400 Sobic001G325100--Sobic009G255400 Sobic002G075400--Sobic009G078401 Sobic002G075400--Sobic008G138850 Sobic002G075400--Sobic001G325100 Sobic009G078300 Sobic009G078300 Sobic002G075400--Sobic009G078300 Sobic002G325000 Sobic002G325000 Sobic002G075400--Sobic002G325000 Sobic002G075400--Sobic010G045966 Sobic002G075400--Sobic009G255400 Sobic003G244850 Sobic003G244850 Sobic002G075400--Sobic003G244850 Sobic004G278800 Sobic004G278800 Sobic002G075400--Sobic004G278800 Sobic010G055900--Sobic006G199601 Sobic003G441301 Sobic003G441301 Sobic010G055900--Sobic003G441301 Sobic010G055900--Sobic001G325100 Sobic010G055900--Sobic008G053500 Sobic010G055900--Sobic008G138850 Sobic010G055900--Sobic001G288500 Sobic010G055900--Sobic001G279800 Sobic003G068200 Sobic003G068200 Sobic010G055900--Sobic003G068200 Sobic003G270650 Sobic003G270650 Sobic010G055900--Sobic003G270650 Sobic002G365200--Sobic008G053500 Sobic002G365200--Sobic003G012750 Sobic002G365200--Sobic002G074700 Sobic002G365200--Sobic006G199601 Sobic002G365200--Sobic003G263450 Sobic002G365200--Sobic001G325100 Sobic002G365200--Sobic007G079901 Sobic004G140900 Sobic004G140900 Sobic002G365200--Sobic004G140900 Sobic002G365200--Sobic002G149600 Sobic001G449300--Sobic002G074700 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic001G449300--Sobic003G172000 SobicK043600 SobicK043600 Sobic001G449300--SobicK043600 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic001G449300--Sobic002G121050 Sobic001G449300--Sobic002G149600 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic001G449300--Sobic001G154450 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic001G449300--Sobic004G127350 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic001G449300--Sobic006G094900 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic001G449300--Sobic004G272950 Sobic008G138850--Sobic009G078401 Sobic008G138850--Sobic009G078300 Sobic008G138850--Sobic009G255400 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic008G138850--Sobic005G024500 Sobic008G138850--Sobic001G325100 Sobic008G138850--Sobic004G278800 Sobic005G019300 Sobic005G019300 Sobic008G138850--Sobic005G019300 Sobic008G138850--Sobic002G075400 Sobic008G138850--Sobic003G441301
Octagon: transcription factors


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