Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G325200.1
Synonym Sb02g035250
Functional annotation harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
UniProt C5XA66
Pfam PF03168
Panther DB PTHR31415 PTHR31415:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G05220 : Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g34720.1 : harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048269 , Zm00025a014829
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G045120.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G218700 pentatricopeptide, putative, expressed -
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19 Sobic.003G169800 - -
20 Sobic.007G116300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G325200 Sobic002G325200 Sobic009G218700 Sobic009G218700 Sobic002G325200--Sobic009G218700 Sobic004G335300 Sobic004G335300 Sobic002G325200--Sobic004G335300 Sobic003G120900 Sobic003G120900 Sobic002G325200--Sobic003G120900 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic002G325200--Sobic003G169700 Sobic005G021400 Sobic005G021400 Sobic002G325200--Sobic005G021400 Sobic001G395600 Sobic001G395600 Sobic002G325200--Sobic001G395600 Sobic003G105200 Sobic003G105200 Sobic002G325200--Sobic003G105200 Sobic008G033800 Sobic008G033800 Sobic002G325200--Sobic008G033800 Sobic003G186066 Sobic003G186066 Sobic002G325200--Sobic003G186066 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic009G218700--Sobic006G206600 Sobic009G218700--Sobic003G169700 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic009G218700--Sobic002G220400 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic009G218700--Sobic006G100150 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic009G218700--Sobic004G303900 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic009G218700--Sobic009G260550 Sobic002G198900 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Octagon: transcription factors


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