Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G330600.1
Synonym Sb02g035710
Functional annotation eukaryotic translation initiation factor-related, putative, expressed
UniProt C5XAU5
Pfam PF06273
Panther DB PTHR32091 PTHR32091:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G11480 : eukaryotic translation initiation factor-related
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g36200.1 : eukaryotic translation initiation factor-related, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014859 , Zm00025a048325
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2A02G213900 , TraesCS2A02G213900 , TraesCS2B02G238900 , TraesCS2B02G238900 , TraesCS2D02G219700 , TraesCS2D02G219700 , TraesCS2D02G219700
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cDNA sequences
Sobic.002G330600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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9 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
10 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
11 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
12 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
13 Sobic.003G267150 - -
14 Sobic.004G262550 - -
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16 Sobic.009G091940 - -
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18 Sobic.004G313000 leucine rich repeat containing protein, expressed -
19 Sobic.003G389150 - -
20 Sobic.004G102301 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G330600 Sobic002G330600 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic002G330600--Sobic001G489400 Sobic007G049300 Sobic007G049300 Sobic002G330600--Sobic007G049300 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic002G330600--Sobic009G199401 Sobic004G265066 Sobic004G265066 Sobic002G330600--Sobic004G265066 Sobic004G093800 Sobic004G093800 Sobic002G330600--Sobic004G093800 Sobic002G207601 Sobic002G207601 Sobic002G330600--Sobic002G207601 Sobic005G116700 Sobic005G116700 Sobic002G330600--Sobic005G116700 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic002G330600--Sobic002G160500 Sobic001G489400--Sobic009G199401 Sobic003G162600 Sobic003G162600 Sobic001G489400--Sobic003G162600 Sobic001G489400--Sobic004G093800 Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic001G489400--Sobic010G229025 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic001G489400--Sobic002G421100 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic001G489400--Sobic002G307500 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic001G489400--Sobic006G221500 Sobic001G489400--Sobic002G207601 Sobic001G489400--Sobic005G116700 Sobic009G139100 Sobic009G139100 Sobic007G049300--Sobic009G139100 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic007G049300--Sobic007G179100 Sobic003G185000 Sobic003G185000 Sobic007G049300--Sobic003G185000 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic007G049300--Sobic008G041500 Sobic007G049300--Sobic002G330600 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic007G049300--Sobic010G002600 Sobic007G049300--Sobic009G199401 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic007G049300--Sobic002G319900 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic007G049300--Sobic003G282400 Sobic009G199401--Sobic002G421100 Sobic009G199401--Sobic001G489400 Sobic009G199401--Sobic010G229025 Sobic009G199401--Sobic003G162600 Sobic009G199401--Sobic006G221500 Sobic009G199401--Sobic004G093800 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic009G199401--Sobic008G142500 Sobic009G199401--Sobic005G116700 Sobic004G186950 Sobic004G186950 Sobic009G199401--Sobic004G186950 Sobic001G388800 Sobic001G388800 Sobic004G265066--Sobic001G388800 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic004G265066--Sobic010G217001 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic004G265066--Sobic007G124800 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic004G265066--Sobic002G018133 Sobic004G045700 Sobic004G045700 Sobic004G265066--Sobic004G045700 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic004G265066--Sobic008G007200 Sobic004G306700 Sobic004G306700 Sobic004G265066--Sobic004G306700 Sobic002G030001 Sobic002G030001 Sobic004G265066--Sobic002G030001 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic004G265066--Sobic008G086300 Sobic004G093800--Sobic002G307500 Sobic004G093800--Sobic001G489400 Sobic004G093800--Sobic009G199401 Sobic004G173300 Sobic004G173300 Sobic004G093800--Sobic004G173300 Sobic004G093800--Sobic010G002600 Sobic004G093800--Sobic008G142500 Sobic004G093800--Sobic010G229025 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic004G093800--Sobic006G192900 Sobic005G131500 Sobic005G131500 Sobic004G093800--Sobic005G131500 Sobic004G257900 Sobic004G257900 Sobic002G207601--Sobic004G257900 Sobic002G207601--Sobic001G489400 Sobic006G213350 Sobic006G213350 Sobic002G207601--Sobic006G213350 Sobic002G197500 Sobic002G197500 Sobic002G207601--Sobic002G197500 Sobic001G156401 Sobic001G156401 Sobic002G207601--Sobic001G156401 Sobic008G143901 Sobic008G143901 Sobic002G207601--Sobic008G143901 Sobic001G139800 Sobic001G139800 Sobic002G207601--Sobic001G139800 Sobic002G207601--Sobic009G199401 Sobic005G160500 Sobic005G160500 Sobic002G207601--Sobic005G160500 Sobic005G116700--Sobic003G162600 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic005G116700--Sobic005G116800 Sobic003G068150 Sobic003G068150 Sobic005G116700--Sobic003G068150 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic005G116700--Sobic005G187700 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic005G116700--Sobic006G083050 Sobic005G116700--Sobic009G199401 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic005G116700--Sobic001G527550 Sobic005G116700--Sobic001G489400 Sobic001G180950 Sobic001G180950 Sobic005G116700--Sobic001G180950 Sobic002G160500--Sobic002G160500 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic002G160500--Sobic003G267150 Sobic004G262550 Sobic004G262550 Sobic002G160500--Sobic004G262550 Sobic009G091940 Sobic009G091940 Sobic002G160500--Sobic009G091940 Sobic003G389150 Sobic003G389150 Sobic002G160500--Sobic003G389150 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic002G160500--Sobic004G313000
Octagon: transcription factors


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