Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G331400.1
Synonym
Functional annotation OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QEU3
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF87
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G35995 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g36520.1 : OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS1B02G101200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G213100 - -
2 Sobic.001G457966 - -
3 Sobic.002G044200 cytochrome P450, putative, expressed -
4 Sobic.007G181801 - -
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6 Sobic.005G144900 expressed protein -
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19 Sobic.008G028850 - -
20 Sobic.002G291850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G331400 Sobic002G331400 Sobic001G213100 Sobic001G213100 Sobic002G331400--Sobic001G213100 Sobic001G457966 Sobic001G457966 Sobic002G331400--Sobic001G457966 Sobic002G044200 Sobic002G044200 Sobic002G331400--Sobic002G044200 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic002G331400--Sobic007G181801 Sobic003G418600 Sobic003G418600 Sobic002G331400--Sobic003G418600 Sobic005G144900 Sobic005G144900 Sobic002G331400--Sobic005G144900 Sobic010G229050 Sobic010G229050 Sobic002G331400--Sobic010G229050 Sobic004G224350 Sobic004G224350 Sobic002G331400--Sobic004G224350 Sobic005G092401 Sobic005G092401 Sobic002G331400--Sobic005G092401 Sobic001G213100--Sobic002G044200 Sobic001G213100--Sobic010G229050 Sobic001G213100--Sobic001G457966 Sobic002G291850 Sobic002G291850 Sobic001G213100--Sobic002G291850 Sobic001G213100--Sobic002G331400 Sobic008G153801 Sobic008G153801 Sobic001G213100--Sobic008G153801 Sobic001G213100--Sobic005G092401 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic001G213100--Sobic006G204850 Sobic001G213100--Sobic003G418600 Sobic001G457966--Sobic002G044200 Sobic001G457966--Sobic002G291850 Sobic009G024166 Sobic009G024166 Sobic001G457966--Sobic009G024166 Sobic001G457966--Sobic003G418600 Sobic003G090100 Sobic003G090100 Sobic001G457966--Sobic003G090100 Sobic005G207900 Sobic005G207900 Sobic001G457966--Sobic005G207900 Sobic001G236950 Sobic001G236950 Sobic001G457966--Sobic001G236950 Sobic008G028850 Sobic008G028850 Sobic001G457966--Sobic008G028850 Sobic007G007250 Sobic007G007250 Sobic001G457966--Sobic007G007250 Sobic001G371500 Sobic001G371500 Sobic002G044200--Sobic001G371500 Sobic002G044200--Sobic003G418600 Sobic007G054300 Sobic007G054300 Sobic002G044200--Sobic007G054300 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic002G044200--Sobic001G018700 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic007G181801--Sobic009G219601 Sobic008G146801 Sobic008G146801 Sobic007G181801--Sobic008G146801 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic007G181801--Sobic004G123801 Sobic004G246950 Sobic004G246950 Sobic007G181801--Sobic004G246950 Sobic007G181801--Sobic001G018700 Sobic001G146450 Sobic001G146450 Sobic003G418600--Sobic001G146450 Sobic010G077275 Sobic010G077275 Sobic003G418600--Sobic010G077275 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic003G418600--Sobic001G183900 Sobic006G176300 Sobic006G176300 Sobic003G418600--Sobic006G176300 Sobic003G072100 Sobic003G072100 Sobic003G418600--Sobic003G072100 Sobic003G418600--Sobic005G207900 Sobic003G418600--Sobic001G018700 Sobic005G144900--Sobic003G090100 Sobic005G144900--Sobic009G024166 Sobic005G144900--Sobic008G028850 Sobic007G086400 Sobic007G086400 Sobic005G144900--Sobic007G086400 Sobic006G257250 Sobic006G257250 Sobic005G144900--Sobic006G257250 Sobic004G056350 Sobic004G056350 Sobic005G144900--Sobic004G056350 Sobic004G311550 Sobic004G311550 Sobic005G144900--Sobic004G311550 Sobic005G144900--Sobic005G207900 Sobic005G144900--Sobic004G123801 Sobic010G229050--Sobic002G044200 Sobic010G229050--Sobic001G213100 Sobic010G229050--Sobic005G092401 Sobic010G229050--Sobic001G457966 Sobic010G229050--Sobic002G291850 Sobic008G044200 Sobic008G044200 Sobic010G229050--Sobic008G044200 Sobic010G229050--Sobic003G418600 Sobic002G034900 Sobic002G034900 Sobic010G229050--Sobic002G034900 Sobic009G037400 Sobic009G037400 Sobic010G229050--Sobic009G037400 Sobic004G224350--Sobic001G183900 Sobic002G032033 Sobic002G032033 Sobic004G224350--Sobic002G032033 Sobic004G224350--Sobic003G090100 Sobic004G224350--Sobic005G207900 Sobic005G216866 Sobic005G216866 Sobic004G224350--Sobic005G216866 Sobic004G224350--Sobic004G246950 Sobic004G224350--Sobic003G072100 Sobic004G224350--Sobic001G018700 Sobic005G092401--Sobic010G229050 Sobic005G092401--Sobic001G213100 Sobic005G092401--Sobic002G044200 Sobic005G092401--Sobic008G044200 Sobic005G092401--Sobic001G457966 Sobic005G092401--Sobic002G291850 Sobic005G092401--Sobic002G331400 Sobic002G291000 Sobic002G291000 Sobic005G092401--Sobic002G291000 Sobic005G092401--Sobic003G418600
Octagon: transcription factors


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