Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G354300.1
Synonym Sb02g037595, PMT5, Transmembrane transporter, ATPLT5, ATPMT5
Functional annotation "Belonging to the Sdw3 locus, Sbi_sdw3" (PubMedID : 20464438)
polyol transporter 5, putative, expressed
UniProt A0A1B6QF61
Pfam PF07690
Panther DB PTHR23500 PTHR23500:SF95
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18830 : polyol/monosaccharide transporter 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g39400.1 : polyol transporter 5, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048528
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G244800 cell division control protein 2 homolog 3, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
2 Sobic.005G162100 - -
3 Sobic.009G169050 - -
4 Sobic.002G300800 - -
5 Sobic.007G083200 expressed protein -
6 Sobic.004G135600 - -
7 Sobic.010G225950 - -
8 Sobic.002G007300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14962: WDR82, SWD2, COMPASS component SWD2
9 Sobic.001G261700 "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G116000 PHD finger protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G069100 - -
12 Sobic.006G105300 expressed protein -
13 Sobic.005G071200 - -
14 Sobic.004G207500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
15 Sobic.005G227151 - -
16 Sobic.001G029700 ELM2 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G105900 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
18 Sobic.002G101500 OsFBX281 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G319050 - -
20 Sobic.006G142850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G354300 Sobic002G354300 Sobic009G244800 Sobic009G244800 Sobic002G354300--Sobic009G244800 Sobic005G162100 Sobic005G162100 Sobic002G354300--Sobic005G162100 Sobic009G169050 Sobic009G169050 Sobic002G354300--Sobic009G169050 Sobic002G300800 Sobic002G300800 Sobic002G354300--Sobic002G300800 Sobic007G083200 Sobic007G083200 Sobic002G354300--Sobic007G083200 Sobic004G135600 Sobic004G135600 Sobic002G354300--Sobic004G135600 Sobic010G225950 Sobic010G225950 Sobic002G354300--Sobic010G225950 Sobic002G007300 Sobic002G007300 Sobic002G354300--Sobic002G007300 Sobic001G261700 Sobic001G261700 Sobic002G354300--Sobic001G261700 Sobic009G244800--Sobic002G300800 Sobic009G244800--Sobic002G007300 Sobic009G244800--Sobic001G261700 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic009G244800--Sobic002G097100 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic009G244800--Sobic003G319050 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic009G244800--Sobic001G284700 Sobic001G069100 Sobic001G069100 Sobic009G244800--Sobic001G069100 Sobic009G244800--Sobic009G169050 Sobic009G244800--Sobic010G225950 Sobic005G162100--Sobic002G354300 Sobic005G162100--Sobic004G135600 Sobic004G102500 Sobic004G102500 Sobic005G162100--Sobic004G102500 Sobic010G169500 Sobic010G169500 Sobic005G162100--Sobic010G169500 Sobic005G162100--Sobic009G244800 Sobic009G116000 Sobic009G116000 Sobic005G162100--Sobic009G116000 Sobic005G162100--Sobic007G083200 Sobic005G162100--Sobic009G169050 Sobic006G200100 Sobic006G200100 Sobic005G162100--Sobic006G200100 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic009G169050--Sobic005G186250 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic009G169050--Sobic004G207500 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic009G169050--Sobic009G007100 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic009G169050--Sobic005G189000 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic009G169050--Sobic006G142850 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic009G169050--Sobic005G184600 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic009G169050--Sobic007G049000 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic009G169050--Sobic005G184400 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic009G169050--Sobic006G105300 Sobic001G029700 Sobic001G029700 Sobic002G300800--Sobic001G029700 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic002G300800--Sobic007G025100 Sobic002G300800--Sobic002G007300 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic002G300800--Sobic002G300900 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic002G300800--Sobic007G131100 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic002G300800--Sobic001G297700 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic002G300800--Sobic008G184000 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic002G300800--Sobic010G035000 Sobic002G300800--Sobic006G105300 Sobic005G071200 Sobic005G071200 Sobic007G083200--Sobic005G071200 Sobic007G083200--Sobic009G116000 Sobic007G083200--Sobic009G169050 Sobic002G133150 Sobic002G133150 Sobic007G083200--Sobic002G133150 Sobic003G415200 Sobic003G415200 Sobic007G083200--Sobic003G415200 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic007G083200--Sobic009G019700 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic007G083200--Sobic005G148100 Sobic008G144201 Sobic008G144201 Sobic007G083200--Sobic008G144201 Sobic008G181250 Sobic008G181250 Sobic007G083200--Sobic008G181250 Sobic004G135600--Sobic004G102500 Sobic004G135600--Sobic005G162100 Sobic010G133100 Sobic010G133100 Sobic004G135600--Sobic010G133100 Sobic004G135600--Sobic002G354300 Sobic004G135600--Sobic010G169500 Sobic008G043800 Sobic008G043800 Sobic004G135600--Sobic008G043800 Sobic004G135600--Sobic006G200100 Sobic006G134600 Sobic006G134600 Sobic004G135600--Sobic006G134600 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic004G135600--Sobic003G063801 Sobic010G225950--Sobic002G007300 Sobic010G225950--Sobic004G207500 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic010G225950--Sobic005G227151 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic010G225950--Sobic002G358000 Sobic010G225950--Sobic006G105300 Sobic010G225950--Sobic006G142850 Sobic010G225950--Sobic005G186250 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic010G225950--Sobic002G105900 Sobic010G225950--Sobic007G049000 Sobic002G007300--Sobic003G319050 Sobic002G007300--Sobic002G097100 Sobic002G007300--Sobic006G105300 Sobic002G007300--Sobic001G297700 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic002G007300--Sobic004G071100 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic002G007300--Sobic002G015500 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic002G007300--Sobic007G199500 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic002G007300--Sobic009G057100 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic002G007300--Sobic005G033400 Sobic001G261700--Sobic001G284700 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic001G261700--Sobic005G147500 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic001G261700--Sobic006G264800 Sobic001G261700--Sobic009G057100 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic001G261700--Sobic005G188800 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic001G261700--Sobic002G172100 Sobic009G112200 Sobic009G112200 Sobic001G261700--Sobic009G112200 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic001G261700--Sobic001G511400 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic001G261700--Sobic002G172200
Octagon: transcription factors


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