Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G397100.1
Synonym Sb02g041210
Functional annotation thiol protease SEN102 precursor, putative, expressed
UniProt C5X409
Pfam PF08246 PF00112
Panther DB PTHR12411
NCBI CDD KOG1543; Cysteine proteinase Cathepsin L
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G50260 : Cysteine proteinases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g39160.1 : thiol protease SEN102 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G397100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G261464 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G397100 Sobic002G397100 Sobic002G397300 Sobic002G397300 Sobic002G397100--Sobic002G397300 Sobic001G448750 Sobic001G448750 Sobic002G397100--Sobic001G448750 Sobic006G026300 Sobic006G026300 Sobic002G397100--Sobic006G026300 Sobic002G153900 Sobic002G153900 Sobic002G397100--Sobic002G153900 Sobic005G048100 Sobic005G048100 Sobic002G397100--Sobic005G048100 Sobic002G384600 Sobic002G384600 Sobic002G397100--Sobic002G384600 Sobic004G358200 Sobic004G358200 Sobic002G397100--Sobic004G358200 Sobic006G147500 Sobic006G147500 Sobic002G397100--Sobic006G147500 Sobic002G100100 Sobic002G100100 Sobic002G397100--Sobic002G100100 Sobic002G397300--Sobic002G397100 Sobic002G397300--Sobic006G026300 Sobic002G397300--Sobic005G048100 Sobic002G397300--Sobic002G153900 Sobic002G397300--Sobic001G448750 Sobic002G397300--Sobic002G384600 Sobic002G397300--Sobic004G358200 Sobic002G397300--Sobic002G100100 Sobic004G243700 Sobic004G243700 Sobic002G397300--Sobic004G243700 Sobic001G448750--Sobic002G397100 Sobic001G448750--Sobic002G397300 Sobic005G218600 Sobic005G218600 Sobic001G448750--Sobic005G218600 Sobic001G343300 Sobic001G343300 Sobic001G448750--Sobic001G343300 Sobic005G183300 Sobic005G183300 Sobic001G448750--Sobic005G183300 Sobic001G379300 Sobic001G379300 Sobic001G448750--Sobic001G379300 Sobic007G009600 Sobic007G009600 Sobic001G448750--Sobic007G009600 Sobic002G397400 Sobic002G397400 Sobic001G448750--Sobic002G397400 Sobic001G336800 Sobic001G336800 Sobic001G448750--Sobic001G336800 Sobic006G026300--Sobic002G100100 Sobic001G261464 Sobic001G261464 Sobic006G026300--Sobic001G261464 Sobic006G026300--Sobic002G153900 Sobic006G026300--Sobic004G243700 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic006G026300--Sobic005G031901 Sobic006G026300--Sobic004G358200 Sobic003G126750 Sobic003G126750 Sobic006G026300--Sobic003G126750 Sobic006G109600 Sobic006G109600 Sobic006G026300--Sobic006G109600 Sobic010G147300 Sobic010G147300 Sobic006G026300--Sobic010G147300 Sobic002G153900--Sobic003G126750 Sobic002G153900--Sobic004G358200 Sobic002G153900--Sobic001G261464 Sobic002G026150 Sobic002G026150 Sobic002G153900--Sobic002G026150 Sobic002G153900--Sobic006G026300 Sobic002G153900--Sobic006G109600 Sobic002G153900--Sobic005G031901 Sobic004G358301 Sobic004G358301 Sobic002G153900--Sobic004G358301 Sobic002G153900--Sobic002G100100 Sobic005G048100--Sobic004G358200 Sobic005G048100--Sobic003G126750 Sobic005G048100--Sobic001G261464 Sobic008G139250 Sobic008G139250 Sobic005G048100--Sobic008G139250 Sobic005G048100--Sobic002G026150 Sobic005G048100--Sobic004G243700 Sobic005G048100--Sobic006G026300 Sobic005G048100--Sobic006G109600 Sobic005G048100--Sobic002G153900 Sobic002G384600--Sobic002G153900 Sobic002G384600--Sobic006G026300 Sobic002G384600--Sobic004G358301 Sobic002G384600--Sobic005G031901 Sobic002G384600--Sobic004G358200 Sobic002G384600--Sobic001G261464 Sobic002G384600--Sobic006G109600 Sobic002G384600--Sobic002G026150 Sobic002G384600--Sobic010G147300 Sobic004G358200--Sobic001G261464 Sobic004G358200--Sobic003G126750 Sobic004G358200--Sobic002G153900 Sobic004G358200--Sobic005G031901 Sobic004G358200--Sobic006G109600 Sobic004G358200--Sobic006G026300 Sobic004G358200--Sobic002G100100 Sobic004G358200--Sobic004G243700 Sobic004G358200--Sobic002G026150 Sobic002G102700 Sobic002G102700 Sobic006G147500--Sobic002G102700 Sobic001G188600 Sobic001G188600 Sobic006G147500--Sobic001G188600 Sobic002G020100 Sobic002G020100 Sobic006G147500--Sobic002G020100 Sobic007G211100 Sobic007G211100 Sobic006G147500--Sobic007G211100 Sobic010G202700 Sobic010G202700 Sobic006G147500--Sobic010G202700 Sobic001G069500 Sobic001G069500 Sobic006G147500--Sobic001G069500 Sobic008G067400 Sobic008G067400 Sobic006G147500--Sobic008G067400 Sobic004G109000 Sobic004G109000 Sobic006G147500--Sobic004G109000 Sobic003G068300 Sobic003G068300 Sobic006G147500--Sobic003G068300 Sobic002G100100--Sobic005G031901 Sobic002G100100--Sobic001G261464 Sobic002G100100--Sobic006G109600 Sobic002G100100--Sobic003G126750 Sobic002G100100--Sobic010G147300 Sobic002G100100--Sobic006G026300 Sobic002G100100--Sobic004G358301 Sobic002G100100--Sobic004G243700 Sobic002G100100--Sobic002G026150
Octagon: transcription factors


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