Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G336800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QMK3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G307300 short chain dehydrogenase/reductase protein, putative, expressed -
2 Sobic.009G215600 expressed protein -
3 Sobic.009G151000 Subtilase family protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@OsSub47 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
4 Sobic.001G275600 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
5 Sobic.009G070600 HAD superfamily phosphatase, putative, expressed -
6 Sobic.009G119400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
7 Sobic.008G163200 OsSCP9 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I
8 Sobic.002G141100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
9 Sobic.005G029400 strictosidine synthase, putative, expressed -
10 Sobic.008G173200 ZOS12-10 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
11 Sobic.003G108000 expressed protein -
12 Sobic.001G255300 Protein tyrosine decarboxylase 4 (OS)(PubMedID : 27208977)@decarboxylase, putative, expressed K01592: tyrosine decarboxylase
13 Sobic.004G328900 expressed protein -
14 Sobic.001G379300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.007G181000 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
16 Sobic.005G218600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G068300 transferase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G033000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
19 Sobic.005G183300 resistance protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G397400 thiol protease SEN102 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G336800 Sobic001G336800 Sobic001G307300 Sobic001G307300 Sobic001G336800--Sobic001G307300 Sobic009G215600 Sobic009G215600 Sobic001G336800--Sobic009G215600 Sobic009G151000 Sobic009G151000 Sobic001G336800--Sobic009G151000 Sobic001G275600 Sobic001G275600 Sobic001G336800--Sobic001G275600 Sobic009G070600 Sobic009G070600 Sobic001G336800--Sobic009G070600 Sobic009G119400 Sobic009G119400 Sobic001G336800--Sobic009G119400 Sobic008G163200 Sobic008G163200 Sobic001G336800--Sobic008G163200 Sobic002G141100 Sobic002G141100 Sobic001G336800--Sobic002G141100 Sobic005G029400 Sobic005G029400 Sobic001G336800--Sobic005G029400 Sobic001G307300--Sobic009G119400 Sobic001G307300--Sobic001G336800 Sobic010G196400 Sobic010G196400 Sobic001G307300--Sobic010G196400 Sobic001G307300--Sobic001G275600 Sobic001G307300--Sobic009G215600 Sobic002G397400 Sobic002G397400 Sobic001G307300--Sobic002G397400 Sobic002G351000 Sobic002G351000 Sobic001G307300--Sobic002G351000 Sobic001G307300--Sobic009G151000 Sobic001G265900 Sobic001G265900 Sobic001G307300--Sobic001G265900 Sobic009G215600--Sobic002G141100 Sobic009G215600--Sobic008G163200 Sobic004G038300 Sobic004G038300 Sobic009G215600--Sobic004G038300 Sobic002G209800 Sobic002G209800 Sobic009G215600--Sobic002G209800 Sobic002G416950 Sobic002G416950 Sobic009G215600--Sobic002G416950 Sobic004G300800 Sobic004G300800 Sobic009G215600--Sobic004G300800 Sobic004G060700 Sobic004G060700 Sobic009G215600--Sobic004G060700 Sobic001G379300 Sobic001G379300 Sobic009G215600--Sobic001G379300 Sobic002G415300 Sobic002G415300 Sobic009G215600--Sobic002G415300 Sobic009G151000--Sobic001G275600 Sobic008G173200 Sobic008G173200 Sobic009G151000--Sobic008G173200 Sobic003G153400 Sobic003G153400 Sobic009G151000--Sobic003G153400 Sobic009G151000--Sobic010G196400 Sobic003G108000 Sobic003G108000 Sobic009G151000--Sobic003G108000 Sobic009G151000--Sobic001G307300 Sobic006G001000 Sobic006G001000 Sobic009G151000--Sobic006G001000 Sobic009G151000--Sobic001G336800 Sobic009G151000--Sobic009G070600 Sobic001G275600--Sobic009G151000 Sobic008G163000 Sobic008G163000 Sobic001G275600--Sobic008G163000 Sobic001G275600--Sobic009G215600 Sobic001G275600--Sobic001G307300 Sobic001G275600--Sobic006G001000 Sobic001G275600--Sobic009G119400 Sobic001G275600--Sobic008G173200 Sobic001G275600--Sobic010G196400 Sobic001G275600--Sobic002G141100 Sobic009G070700 Sobic009G070700 Sobic009G070600--Sobic009G070700 Sobic001G255300 Sobic001G255300 Sobic009G070600--Sobic001G255300 Sobic009G070600--Sobic005G029400 Sobic008G189500 Sobic008G189500 Sobic009G070600--Sobic008G189500 Sobic003G007800 Sobic003G007800 Sobic009G070600--Sobic003G007800 Sobic004G328900 Sobic004G328900 Sobic009G070600--Sobic004G328900 Sobic002G207900 Sobic002G207900 Sobic009G070600--Sobic002G207900 Sobic001G472000 Sobic001G472000 Sobic009G070600--Sobic001G472000 Sobic009G070600--Sobic001G379300 Sobic009G119400--Sobic002G351000 Sobic009G119400--Sobic002G141100 Sobic009G119400--Sobic001G307300 Sobic009G119400--Sobic009G215600 Sobic007G009600 Sobic007G009600 Sobic009G119400--Sobic007G009600 Sobic009G119400--Sobic004G060700 Sobic007G170800 Sobic007G170800 Sobic009G119400--Sobic007G170800 Sobic009G119400--Sobic008G163200 Sobic005G110436 Sobic005G110436 Sobic009G119400--Sobic005G110436 Sobic008G163200--Sobic002G415300 Sobic008G163200--Sobic004G060700 Sobic002G415400 Sobic002G415400 Sobic008G163200--Sobic002G415400 Sobic008G163200--Sobic002G416950 Sobic008G163200--Sobic007G170800 Sobic003G068300 Sobic003G068300 Sobic008G163200--Sobic003G068300 Sobic008G163200--Sobic001G379300 Sobic008G163200--Sobic001G255300 Sobic001G435600 Sobic001G435600 Sobic008G163200--Sobic001G435600 Sobic001G541300 Sobic001G541300 Sobic002G141100--Sobic001G541300 Sobic005G200600 Sobic005G200600 Sobic002G141100--Sobic005G200600 Sobic002G141100--Sobic007G170800 Sobic002G141100--Sobic004G060700 Sobic002G141100--Sobic002G416950 Sobic006G238100 Sobic006G238100 Sobic002G141100--Sobic006G238100 Sobic002G141100--Sobic007G009600 Sobic003G114200 Sobic003G114200 Sobic002G141100--Sobic003G114200 Sobic002G141100--Sobic001G379300 Sobic005G029400--Sobic008G189500 Sobic005G029400--Sobic001G255300 Sobic005G029400--Sobic009G070600 Sobic005G029400--Sobic003G007800 Sobic005G029400--Sobic001G379300 Sobic007G069500 Sobic007G069500 Sobic005G029400--Sobic007G069500 Sobic002G128600 Sobic002G128600 Sobic005G029400--Sobic002G128600 Sobic003G317800 Sobic003G317800 Sobic005G029400--Sobic003G317800 Sobic005G029400--Sobic004G328900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.