Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G042800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q196
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G102850 - -
2 Sobic.005G214700 - -
3 Sobic.009G090400 - -
4 Sobic.005G122100 expressed protein -
5 Sobic.002G157900 - -
6 Sobic.007G103000 FGGY family of carbohydrate kinases, putative, expressed K00864: glpK, glycerol kinase
7 Sobic.007G222200 - -
8 Sobic.007G134260 - -
9 Sobic.001G024300 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
10 Sobic.006G136700 GPI-anchored protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G332200 cysteine proteinase EP-B 1 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.003G009600 POEI21 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
13 Sobic.002G417401 - -
14 Sobic.006G270800 EF hand family protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G190500 - -
16 Sobic.003G147700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G427500 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
18 Sobic.006G127800 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G089000 ATCHX, putative, expressed -
20 Sobic.009G116100 conserved hypothetical protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G042800 Sobic003G042800 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic003G042800--Sobic008G102850 Sobic005G214700 Sobic005G214700 Sobic003G042800--Sobic005G214700 Sobic009G090400 Sobic009G090400 Sobic003G042800--Sobic009G090400 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic003G042800--Sobic005G122100 Sobic002G157900 Sobic002G157900 Sobic003G042800--Sobic002G157900 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic003G042800--Sobic007G103000 Sobic007G222200 Sobic007G222200 Sobic003G042800--Sobic007G222200 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic003G042800--Sobic007G134260 Sobic001G024300 Sobic001G024300 Sobic003G042800--Sobic001G024300 Sobic008G102850--Sobic007G103000 Sobic008G102850--Sobic007G134260 Sobic008G102850--Sobic005G214700 Sobic008G102850--Sobic005G122100 Sobic005G065300 Sobic005G065300 Sobic008G102850--Sobic005G065300 Sobic003G147700 Sobic003G147700 Sobic008G102850--Sobic003G147700 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic008G102850--Sobic004G091000 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic008G102850--Sobic003G114800 Sobic003G232100 Sobic003G232100 Sobic008G102850--Sobic003G232100 Sobic005G214700--Sobic009G090400 Sobic005G214700--Sobic002G157900 Sobic005G214700--Sobic008G102850 Sobic010G190500 Sobic010G190500 Sobic005G214700--Sobic010G190500 Sobic005G214700--Sobic005G122100 Sobic005G214700--Sobic007G222200 Sobic009G098400 Sobic009G098400 Sobic005G214700--Sobic009G098400 Sobic003G009600 Sobic003G009600 Sobic005G214700--Sobic003G009600 Sobic005G214700--Sobic001G024300 Sobic009G090400--Sobic002G157900 Sobic009G090400--Sobic007G222200 Sobic009G090400--Sobic005G122100 Sobic009G090400--Sobic001G024300 Sobic002G417401 Sobic002G417401 Sobic009G090400--Sobic002G417401 Sobic009G090400--Sobic003G009600 Sobic006G136700 Sobic006G136700 Sobic009G090400--Sobic006G136700 Sobic001G332200 Sobic001G332200 Sobic009G090400--Sobic001G332200 Sobic009G116100 Sobic009G116100 Sobic009G090400--Sobic009G116100 Sobic005G122100--Sobic009G090400 Sobic005G122100--Sobic007G103000 Sobic005G122100--Sobic007G134260 Sobic005G122100--Sobic007G222200 Sobic006G270800 Sobic006G270800 Sobic005G122100--Sobic006G270800 Sobic005G122100--Sobic003G232100 Sobic005G122100--Sobic002G157900 Sobic005G122100--Sobic003G147700 Sobic002G427500 Sobic002G427500 Sobic005G122100--Sobic002G427500 Sobic002G157900--Sobic009G090400 Sobic002G157900--Sobic006G136700 Sobic002G157900--Sobic001G024300 Sobic002G157900--Sobic001G332200 Sobic002G157900--Sobic007G222200 Sobic002G157900--Sobic002G417401 Sobic002G157900--Sobic009G116100 Sobic002G157900--Sobic005G122100 Sobic002G157900--Sobic003G009600 Sobic007G103000--Sobic007G134260 Sobic007G103000--Sobic005G122100 Sobic007G103000--Sobic004G091000 Sobic007G103000--Sobic003G232100 Sobic007G103000--Sobic003G147700 Sobic007G103000--Sobic003G114800 Sobic007G103000--Sobic008G102850 Sobic007G103000--Sobic006G270800 Sobic007G103000--Sobic009G090400 Sobic007G222200--Sobic009G090400 Sobic007G222200--Sobic002G417401 Sobic007G222200--Sobic001G024300 Sobic007G222200--Sobic002G157900 Sobic007G222200--Sobic005G122100 Sobic007G222200--Sobic003G009600 Sobic007G222200--Sobic006G136700 Sobic007G222200--Sobic009G116100 Sobic007G222200--Sobic001G332200 Sobic007G134260--Sobic007G103000 Sobic007G134260--Sobic005G122100 Sobic007G134260--Sobic004G091000 Sobic007G134260--Sobic003G232100 Sobic007G134260--Sobic003G114800 Sobic007G134260--Sobic003G147700 Sobic007G134260--Sobic006G270800 Sobic007G134260--Sobic008G102850 Sobic007G134260--Sobic009G090400 Sobic001G024300--Sobic009G116100 Sobic001G024300--Sobic006G136700 Sobic001G024300--Sobic003G009600 Sobic001G024300--Sobic002G157900 Sobic001G024300--Sobic007G222200 Sobic001G024300--Sobic002G417401 Sobic001G024300--Sobic009G090400 Sobic001G024300--Sobic001G332200 Sobic009G089000 Sobic009G089000 Sobic001G024300--Sobic009G089000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.