Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G081300.1
Synonym Sb03g006820
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VWA0
Pfam PF13947 PF14380
Panther DB PTHR33138 PTHR33138:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G18390 : Protein kinase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g04560.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G141200 - -
2 Sobic.003G245000 expressed protein -
3 Sobic.008G109650 - -
4 Sobic.007G007100 expressed protein -
5 Sobic.003G253650 - -
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7 Sobic.001G273950 - -
8 Sobic.003G229900 - -
9 Sobic.001G297900 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K00652: 8-amino-7-oxononanoate synthase
10 Sobic.003G089500 seven in absentia protein family protein, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
11 Sobic.003G149700 FAD dependent oxidoreductase domain containing protein, expressed K00306: sarcosine oxidase / L-pipecolate oxidase
12 Sobic.002G132201 - -
13 Sobic.004G221800 DUF584 domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G054800 "O2(Ortholog in maize:Hartings et al., 1989)"(PubMedID : 31659852)@bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G049633 - -
16 Sobic.001G357650 - -
17 Sobic.007G072700 - -
18 Sobic.001G071500 - -
19 Sobic.001G207100 - -
20 Sobic.005G073300 limonoid UDP-glucosyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G081300 Sobic003G081300 Sobic006G141200 Sobic006G141200 Sobic003G081300--Sobic006G141200 Sobic003G245000 Sobic003G245000 Sobic003G081300--Sobic003G245000 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic003G081300--Sobic008G109650 Sobic007G007100 Sobic007G007100 Sobic003G081300--Sobic007G007100 Sobic003G253650 Sobic003G253650 Sobic003G081300--Sobic003G253650 Sobic001G242400 Sobic001G242400 Sobic003G081300--Sobic001G242400 Sobic001G273950 Sobic001G273950 Sobic003G081300--Sobic001G273950 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic003G081300--Sobic003G229900 Sobic001G297900 Sobic001G297900 Sobic003G081300--Sobic001G297900 Sobic003G149700 Sobic003G149700 Sobic006G141200--Sobic003G149700 Sobic002G132201 Sobic002G132201 Sobic006G141200--Sobic002G132201 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic006G141200--Sobic002G054800 Sobic001G071500 Sobic001G071500 Sobic006G141200--Sobic001G071500 Sobic006G141200--Sobic001G273950 Sobic006G141200--Sobic003G245000 Sobic005G073300 Sobic005G073300 Sobic006G141200--Sobic005G073300 Sobic010G215201 Sobic010G215201 Sobic006G141200--Sobic010G215201 Sobic006G141200--Sobic003G253650 Sobic001G421450 Sobic001G421450 Sobic003G245000--Sobic001G421450 Sobic003G245000--Sobic006G141200 Sobic003G245000--Sobic003G149700 Sobic005G150250 Sobic005G150250 Sobic003G245000--Sobic005G150250 Sobic002G321000 Sobic002G321000 Sobic003G245000--Sobic002G321000 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic003G245000--Sobic006G222200 Sobic003G245000--Sobic008G109650 Sobic003G245000--Sobic002G132201 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic003G245000--Sobic001G084133 Sobic008G109650--Sobic003G245000 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic008G109650--Sobic001G209550 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic008G109650--Sobic001G208166 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic008G109650--Sobic006G147101 Sobic008G109650--Sobic002G321000 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic008G109650--Sobic002G059700 Sobic008G109650--Sobic001G084133 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic008G109650--Sobic004G272000 Sobic002G347850 Sobic002G347850 Sobic008G109650--Sobic002G347850 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic007G007100--Sobic006G049633 Sobic007G007100--Sobic003G229900 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic007G007100--Sobic002G266700 Sobic002G055000 Sobic002G055000 Sobic007G007100--Sobic002G055000 Sobic004G296750 Sobic004G296750 Sobic007G007100--Sobic004G296750 Sobic008G061900 Sobic008G061900 Sobic007G007100--Sobic008G061900 Sobic001G480900 Sobic001G480900 Sobic007G007100--Sobic001G480900 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic007G007100--Sobic010G011500 Sobic007G007100--Sobic001G297900 Sobic003G253650--Sobic002G054800 Sobic001G421100 Sobic001G421100 Sobic003G253650--Sobic001G421100 Sobic003G253650--Sobic002G132201 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic003G253650--Sobic008G030801 Sobic003G253650--Sobic001G071500 Sobic003G253650--Sobic006G141200 Sobic007G072700 Sobic007G072700 Sobic003G253650--Sobic007G072700 Sobic002G172300 Sobic002G172300 Sobic003G253650--Sobic002G172300 Sobic003G253650--Sobic005G073300 Sobic001G242400--Sobic003G229900 Sobic001G242400--Sobic006G049633 Sobic001G242400--Sobic001G273950 Sobic001G242400--Sobic006G141200 Sobic001G242400--Sobic008G030801 Sobic001G242400--Sobic007G007100 Sobic006G161200 Sobic006G161200 Sobic001G242400--Sobic006G161200 Sobic001G242400--Sobic010G215201 Sobic004G221800 Sobic004G221800 Sobic001G242400--Sobic004G221800 Sobic001G273950--Sobic006G161200 Sobic001G273950--Sobic008G030801 Sobic001G273950--Sobic006G141200 Sobic001G273950--Sobic001G071500 Sobic006G049000 Sobic006G049000 Sobic001G273950--Sobic006G049000 Sobic001G273950--Sobic003G229900 Sobic001G273950--Sobic006G049633 Sobic001G273950--Sobic010G215201 Sobic001G273950--Sobic002G054800 Sobic003G229900--Sobic006G049633 Sobic003G229900--Sobic002G055000 Sobic003G229900--Sobic010G011500 Sobic003G229900--Sobic001G480900 Sobic003G229900--Sobic002G266700 Sobic003G229900--Sobic004G296750 Sobic003G229900--Sobic008G061900 Sobic003G229900--Sobic007G007100 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic003G229900--Sobic009G019400 Sobic001G297900--Sobic002G055000 Sobic001G297900--Sobic010G011500 Sobic001G297900--Sobic001G480900 Sobic001G297900--Sobic008G030801 Sobic001G297900--Sobic006G049633 Sobic001G297900--Sobic004G296750 Sobic001G297900--Sobic002G266700 Sobic001G297900--Sobic003G229900 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic001G297900--Sobic003G281000
Octagon: transcription factors


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