Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G119332.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VWX0
Pfam PF14383
Panther DB PTHR37897 PTHR37897:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g15550.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023980
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G491300 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G419600 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
3 Sobic.009G242501 - -
4 Sobic.002G142200 expressed protein -
5 Sobic.001G029800 expressed protein -
6 Sobic.001G037400 expressed protein -
7 Sobic.001G301900 ZOS10-07 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
8 Sobic.008G093600 expressed protein -
9 Sobic.003G013000 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
10 Sobic.003G277200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@IQ calmodulin-binding motif family protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G110600 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
12 Sobic.007G111700 glutathione S-transferase, C-terminal domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G116900 expressed protein -
14 Sobic.010G007000 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
15 Sobic.005G091000 receptor protein kinase CLAVATA1 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.010G261200 LTPL86 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
17 Sobic.008G170400 expressed protein -
18 Sobic.008G006800 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.007G168900 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10398: KIF11, kinesin family member 11
20 Sobic.003G410600 exostosin family domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Sobic003G013000--Sobic003G444100 Sobic003G013000--Sobic001G177900 Sobic003G013000--Sobic006G144300 Sobic003G102000 Sobic003G102000 Sobic003G013000--Sobic003G102000 Sobic003G013000--Sobic003G314900
Octagon: transcription factors


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