Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G142200.1
Synonym Sb03g012300
Functional annotation integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed
UniProt C5XI39
Pfam PF00892
Panther DB PTHR31218 PTHR31218:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane GO:0016020membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G09380 : nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g19290.1 : integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024261 , Zm00025a036036
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCSU02G213700 , TraesCS7B02G379300 , TraesCS7B02G379400 , TraesCS3D02G199100 , TraesCS3B02G227600
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cDNA sequences
Sobic.003G142200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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19 Sobic.008G181200 - -
20 Sobic.005G177200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G142200 Sobic003G142200 Sobic002G259301 Sobic002G259301 Sobic003G142200--Sobic002G259301 Sobic007G191200 Sobic007G191200 Sobic003G142200--Sobic007G191200 Sobic005G164800 Sobic005G164800 Sobic003G142200--Sobic005G164800 Sobic009G125200 Sobic009G125200 Sobic003G142200--Sobic009G125200 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic003G142200--Sobic003G238900 Sobic003G443900 Sobic003G443900 Sobic003G142200--Sobic003G443900 Sobic009G210700 Sobic009G210700 Sobic003G142200--Sobic009G210700 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic003G142200--Sobic006G139400 Sobic002G299200 Sobic002G299200 Sobic003G142200--Sobic002G299200 Sobic002G259301--Sobic002G299200 Sobic002G259301--Sobic003G142200 Sobic007G193300 Sobic007G193300 Sobic002G259301--Sobic007G193300 Sobic002G259301--Sobic005G164800 Sobic001G288000 Sobic001G288000 Sobic002G259301--Sobic001G288000 Sobic007G205300 Sobic007G205300 Sobic002G259301--Sobic007G205300 Sobic001G287900 Sobic001G287900 Sobic002G259301--Sobic001G287900 Sobic003G217300 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Sobic005G070301 Sobic002G299200--Sobic005G070301
Octagon: transcription factors


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