Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G188900.2,Sobic.003G188900.1
Synonym Sb03g025340
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XN34
Pfam PF00855
Panther DB PTHR33697 PTHR33697:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G21295 : Tudor/PWWP/MBT superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g37790.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028774 , Zm00025a038342
Brachypodium PNT72193 , KQK08315
Barley HORVU3Hr1G047750.1 , HORVU3Hr1G047750.2 , HORVU3Hr1G047750.3
Wheat TraesCS3A02G203300 , TraesCS3D02G206700 , TraesCS3B02G229300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic003G188900 Sobic003G188900 Sobic010G103000 Sobic010G103000 Sobic003G188900--Sobic010G103000 Sobic004G078400 Sobic004G078400 Sobic003G188900--Sobic004G078400 Sobic001G112300 Sobic001G112300 Sobic003G188900--Sobic001G112300 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic003G188900--Sobic002G213050 Sobic004G089600 Sobic004G089600 Sobic003G188900--Sobic004G089600 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic003G188900--Sobic007G069750 Sobic006G155400 Sobic006G155400 Sobic003G188900--Sobic006G155400 Sobic007G202000 Sobic007G202000 Sobic003G188900--Sobic007G202000 Sobic006G123600 Sobic006G123600 Sobic003G188900--Sobic006G123600 Sobic007G075200 Sobic007G075200 Sobic010G103000--Sobic007G075200 Sobic006G261000 Sobic006G261000 Sobic010G103000--Sobic006G261000 Sobic010G103000--Sobic002G213050 Sobic001G528000 Sobic001G528000 Sobic010G103000--Sobic001G528000 Sobic010G103000--Sobic004G078400 Sobic003G049100 Sobic003G049100 Sobic010G103000--Sobic003G049100 Sobic010G103000--Sobic003G188900 Sobic006G053500 Sobic006G053500 Sobic010G103000--Sobic006G053500 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic010G103000--Sobic005G199500 Sobic004G078400--Sobic010G103000 Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic004G078400--Sobic010G129900 Sobic004G078400--Sobic003G188900 Sobic004G078400--Sobic007G069750 Sobic004G078400--Sobic005G199500 Sobic004G078400--Sobic001G112300 Sobic004G078400--Sobic002G213050 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic004G078400--Sobic001G221750 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic004G078400--Sobic004G055400 Sobic001G112300--Sobic007G069750 Sobic001G112300--Sobic010G129900 Sobic001G112300--Sobic002G213050 Sobic002G237400 Sobic002G237400 Sobic001G112300--Sobic002G237400 Sobic001G112300--Sobic004G055400 Sobic009G127201 Sobic009G127201 Sobic001G112300--Sobic009G127201 Sobic001G472900 Sobic001G472900 Sobic001G112300--Sobic001G472900 Sobic002G269700 Sobic002G269700 Sobic001G112300--Sobic002G269700 Sobic003G278800 Sobic003G278800 Sobic001G112300--Sobic003G278800 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic002G213050--Sobic006G018500 Sobic002G213050--Sobic005G199500 Sobic002G213050--Sobic007G069750 Sobic002G213050--Sobic001G472900 Sobic002G213050--Sobic006G261000 Sobic002G213050--Sobic007G075200 Sobic002G213050--Sobic002G269700 Sobic002G213050--Sobic001G112300 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic002G213050--Sobic001G267950 Sobic004G089600--Sobic006G155400 Sobic005G150250 Sobic005G150250 Sobic004G089600--Sobic005G150250 Sobic009G022600 Sobic009G022600 Sobic004G089600--Sobic009G022600 Sobic002G132201 Sobic002G132201 Sobic004G089600--Sobic002G132201 Sobic005G073300 Sobic005G073300 Sobic004G089600--Sobic005G073300 Sobic003G149700 Sobic003G149700 Sobic004G089600--Sobic003G149700 Sobic001G468900 Sobic001G468900 Sobic004G089600--Sobic001G468900 Sobic003G356500 Sobic003G356500 Sobic004G089600--Sobic003G356500 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic004G089600--Sobic002G054800 Sobic007G069750--Sobic005G199500 Sobic007G069750--Sobic010G129900 Sobic007G069750--Sobic002G213050 Sobic007G069750--Sobic001G112300 Sobic007G069750--Sobic006G018500 Sobic007G069750--Sobic004G055400 Sobic007G069750--Sobic002G269700 Sobic007G069750--Sobic001G472900 Sobic007G069750--Sobic002G237400 Sobic006G155400--Sobic005G150250 Sobic006G155400--Sobic003G149700 Sobic006G155400--Sobic009G022600 Sobic006G155400--Sobic002G132201 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic006G155400--Sobic006G222200 Sobic006G155400--Sobic003G356500 Sobic003G193900 Sobic003G193900 Sobic006G155400--Sobic003G193900 Sobic006G210600 Sobic006G210600 Sobic006G155400--Sobic006G210600 Sobic006G155400--Sobic005G073300 Sobic007G202000--Sobic010G103000 Sobic007G202000--Sobic001G528000 Sobic003G399166 Sobic003G399166 Sobic007G202000--Sobic003G399166 Sobic007G202000--Sobic004G078400 Sobic005G163450 Sobic005G163450 Sobic007G202000--Sobic005G163450 Sobic007G202000--Sobic007G075200 Sobic003G289000 Sobic003G289000 Sobic007G202000--Sobic003G289000 Sobic007G120100 Sobic007G120100 Sobic007G202000--Sobic007G120100 Sobic005G156800 Sobic005G156800 Sobic007G202000--Sobic005G156800 Sobic006G123600--Sobic003G188900 Sobic009G205000 Sobic009G205000 Sobic006G123600--Sobic009G205000 Sobic006G123600--Sobic004G078400 Sobic001G421100 Sobic001G421100 Sobic006G123600--Sobic001G421100 Sobic001G477350 Sobic001G477350 Sobic006G123600--Sobic001G477350 Sobic001G175500 Sobic001G175500 Sobic006G123600--Sobic001G175500 Sobic006G123600--Sobic006G155400 Sobic002G240200 Sobic002G240200 Sobic006G123600--Sobic002G240200 Sobic007G032200 Sobic007G032200 Sobic006G123600--Sobic007G032200
Octagon: transcription factors


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