Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G261632.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q5F9
Pfam -
Panther DB PTHR27001 PTHR27001:SF25
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G01540 : Protein kinase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g12680.1 : protein kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G060666 - -
2 Sobic.008G126700 calmodulin binding protein, putative, expressed -
3 Sobic.005G190900 MBTB64 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
4 Sobic.005G060700 protein kinase domain containing protein, expressed K17302: COPB2, coatomer subunit beta'
5 Sobic.002G040400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
6 Sobic.001G432500 expressed protein -
7 Sobic.002G298400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@dehydrodolichyl diphosphate synthase, putative, expressed K11778: DHDDS, RER2, ditrans,polycis-polyprenyl diphosphate synthase
8 Sobic.009G085700 - -
9 Sobic.002G391700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peroxidase, putative, expressed K00430: peroxidase
10 Sobic.002G087500 - -
11 Sobic.008G077800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
12 Sobic.002G093600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Jacalin-like lectin domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.005G021950 - -
14 Sobic.001G291500 - -
15 Sobic.003G262900 expressed protein -
16 Sobic.004G143801 - -
17 Sobic.008G145200 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
18 Sobic.002G265400 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed K13691: pathogen-inducible salicylic acid glucosyltransferase
19 Sobic.008G028600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@WRKY112, expressed -
20 Sobic.006G007300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G261632 Sobic003G261632 Sobic005G060666 Sobic005G060666 Sobic003G261632--Sobic005G060666 Sobic008G126700 Sobic008G126700 Sobic003G261632--Sobic008G126700 Sobic005G190900 Sobic005G190900 Sobic003G261632--Sobic005G190900 Sobic005G060700 Sobic005G060700 Sobic003G261632--Sobic005G060700 Sobic002G040400 Sobic002G040400 Sobic003G261632--Sobic002G040400 Sobic001G432500 Sobic001G432500 Sobic003G261632--Sobic001G432500 Sobic002G298400 Sobic002G298400 Sobic003G261632--Sobic002G298400 Sobic009G085700 Sobic009G085700 Sobic003G261632--Sobic009G085700 Sobic002G391700 Sobic002G391700 Sobic003G261632--Sobic002G391700 Sobic005G060666--Sobic005G060700 Sobic008G077800 Sobic008G077800 Sobic005G060666--Sobic008G077800 Sobic002G087500 Sobic002G087500 Sobic005G060666--Sobic002G087500 Sobic005G060666--Sobic002G040400 Sobic006G007300 Sobic006G007300 Sobic005G060666--Sobic006G007300 Sobic008G028600 Sobic008G028600 Sobic005G060666--Sobic008G028600 Sobic005G060666--Sobic002G298400 Sobic008G028566 Sobic008G028566 Sobic005G060666--Sobic008G028566 Sobic005G219000 Sobic005G219000 Sobic005G060666--Sobic005G219000 Sobic005G021950 Sobic005G021950 Sobic008G126700--Sobic005G021950 Sobic002G224300 Sobic002G224300 Sobic008G126700--Sobic002G224300 Sobic008G145200 Sobic008G145200 Sobic008G126700--Sobic008G145200 Sobic006G004400 Sobic006G004400 Sobic008G126700--Sobic006G004400 Sobic008G126700--Sobic006G007300 Sobic008G126700--Sobic008G077800 Sobic008G126700--Sobic008G028566 Sobic002G093600 Sobic002G093600 Sobic008G126700--Sobic002G093600 Sobic008G126700--Sobic005G060666 Sobic001G019300 Sobic001G019300 Sobic005G190900--Sobic001G019300 Sobic001G291500 Sobic001G291500 Sobic005G190900--Sobic001G291500 Sobic002G265400 Sobic002G265400 Sobic005G190900--Sobic002G265400 Sobic005G190900--Sobic001G432500 Sobic003G106500 Sobic003G106500 Sobic005G190900--Sobic003G106500 Sobic005G063900 Sobic005G063900 Sobic005G190900--Sobic005G063900 Sobic003G135800 Sobic003G135800 Sobic005G190900--Sobic003G135800 Sobic010G225500 Sobic010G225500 Sobic005G190900--Sobic010G225500 Sobic002G371900 Sobic002G371900 Sobic005G190900--Sobic002G371900 Sobic005G060700--Sobic005G060666 Sobic005G060700--Sobic006G007300 Sobic005G060700--Sobic008G077800 Sobic005G219100 Sobic005G219100 Sobic005G060700--Sobic005G219100 Sobic005G060700--Sobic005G219000 Sobic005G060700--Sobic002G087500 Sobic005G060700--Sobic008G028566 Sobic005G060700--Sobic008G028600 Sobic006G007100 Sobic006G007100 Sobic005G060700--Sobic006G007100 Sobic002G040400--Sobic008G028600 Sobic002G040400--Sobic002G087500 Sobic002G040400--Sobic002G298400 Sobic002G040400--Sobic002G391700 Sobic006G005500 Sobic006G005500 Sobic002G040400--Sobic006G005500 Sobic002G040400--Sobic005G219000 Sobic001G125700 Sobic001G125700 Sobic002G040400--Sobic001G125700 Sobic002G040400--Sobic008G077800 Sobic007G076000 Sobic007G076000 Sobic002G040400--Sobic007G076000 Sobic001G432500--Sobic008G028600 Sobic001G432500--Sobic002G040400 Sobic001G432500--Sobic002G298400 Sobic001G432500--Sobic002G087500 Sobic001G432500--Sobic005G219000 Sobic001G432500--Sobic006G005500 Sobic001G432500--Sobic002G391700 Sobic001G432500--Sobic001G125700 Sobic001G432500--Sobic007G076000 Sobic002G298400--Sobic002G040400 Sobic002G298400--Sobic002G087500 Sobic002G298400--Sobic002G391700 Sobic002G298400--Sobic008G028600 Sobic002G298400--Sobic002G093600 Sobic002G298400--Sobic008G077800 Sobic004G143801 Sobic004G143801 Sobic002G298400--Sobic004G143801 Sobic002G298400--Sobic008G028566 Sobic002G298400--Sobic005G219000 Sobic002G041800 Sobic002G041800 Sobic009G085700--Sobic002G041800 Sobic002G423600 Sobic002G423600 Sobic009G085700--Sobic002G423600 Sobic005G085500 Sobic005G085500 Sobic009G085700--Sobic005G085500 Sobic001G145050 Sobic001G145050 Sobic009G085700--Sobic001G145050 Sobic009G252100 Sobic009G252100 Sobic009G085700--Sobic009G252100 Sobic004G078600 Sobic004G078600 Sobic009G085700--Sobic004G078600 Sobic009G085700--Sobic002G265400 Sobic009G037200 Sobic009G037200 Sobic009G085700--Sobic009G037200 Sobic009G085700--Sobic005G063900 Sobic002G391700--Sobic002G093600 Sobic002G391700--Sobic002G087500 Sobic002G391700--Sobic002G298400 Sobic002G391700--Sobic002G040400 Sobic002G391700--Sobic008G077800 Sobic002G391700--Sobic008G028600 Sobic002G391700--Sobic006G007300 Sobic002G391700--Sobic008G028566 Sobic002G391700--Sobic005G219000
Octagon: transcription factors


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