Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G284400.1
Synonym Sb03g033570
Functional annotation subtilisin N-terminal Region family protein, expressed
UniProt A0A1B6Q5W1
Pfam PF05922
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G71950 : Proteinase inhibitor, propeptide
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g52960.1 : subtilisin N-terminal Region family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G029200 - -
2 Sobic.005G009900 pectinesterase, putative, expressed -
3 Sobic.002G331900 CRP8 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
4 Sobic.003G279000 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
5 Sobic.001G129750 - -
6 Sobic.003G020900 - -
7 Sobic.008G130350 - -
8 Sobic.003G262000 plant-specific domain TIGR01568 family protein, expressed -
9 Sobic.001G494700 nodulin, putative, expressed -
10 Sobic.001G302000 - -
11 Sobic.002G430601 - -
12 Sobic.006G080050 - -
13 Sobic.006G190950 - K10706: SETX, senataxin
14 Sobic.004G098650 - -
15 Sobic.001G120700 - -
16 Sobic.001G371500 - -
17 Sobic.003G089400 seven in absentia protein family protein, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
18 Sobic.007G054300 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.010G059100 - -
20 Sobic.003G137832 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G284400 Sobic003G284400 Sobic004G029200 Sobic004G029200 Sobic003G284400--Sobic004G029200 Sobic005G009900 Sobic005G009900 Sobic003G284400--Sobic005G009900 Sobic002G331900 Sobic002G331900 Sobic003G284400--Sobic002G331900 Sobic003G279000 Sobic003G279000 Sobic003G284400--Sobic003G279000 Sobic001G129750 Sobic001G129750 Sobic003G284400--Sobic001G129750 Sobic003G020900 Sobic003G020900 Sobic003G284400--Sobic003G020900 Sobic008G130350 Sobic008G130350 Sobic003G284400--Sobic008G130350 Sobic003G262000 Sobic003G262000 Sobic003G284400--Sobic003G262000 Sobic001G494700 Sobic001G494700 Sobic003G284400--Sobic001G494700 Sobic004G029200--Sobic005G009900 Sobic004G029200--Sobic003G279000 Sobic004G029200--Sobic008G130350 Sobic004G029200--Sobic001G129750 Sobic004G029200--Sobic003G020900 Sobic004G029200--Sobic001G494700 Sobic004G029200--Sobic003G262000 Sobic001G302000 Sobic001G302000 Sobic004G029200--Sobic001G302000 Sobic010G081300 Sobic010G081300 Sobic004G029200--Sobic010G081300 Sobic005G009900--Sobic004G029200 Sobic005G009900--Sobic003G279000 Sobic005G009900--Sobic002G331900 Sobic005G009900--Sobic010G081300 Sobic007G048300 Sobic007G048300 Sobic005G009900--Sobic007G048300 Sobic005G009900--Sobic001G494700 Sobic005G009900--Sobic008G130350 Sobic005G009900--Sobic001G129750 Sobic005G009900--Sobic003G020900 Sobic002G331900--Sobic005G009900 Sobic002G331900--Sobic004G029200 Sobic002G331900--Sobic003G284400 Sobic002G331900--Sobic003G279000 Sobic002G331900--Sobic007G048300 Sobic002G331900--Sobic001G494700 Sobic004G015000 Sobic004G015000 Sobic002G331900--Sobic004G015000 Sobic002G331900--Sobic010G081300 Sobic003G398600 Sobic003G398600 Sobic002G331900--Sobic003G398600 Sobic003G279000--Sobic004G029200 Sobic003G279000--Sobic001G129750 Sobic003G279000--Sobic003G020900 Sobic003G279000--Sobic003G262000 Sobic003G279000--Sobic001G302000 Sobic002G430601 Sobic002G430601 Sobic003G279000--Sobic002G430601 Sobic003G279000--Sobic008G130350 Sobic003G279000--Sobic005G009900 Sobic006G080050 Sobic006G080050 Sobic003G279000--Sobic006G080050 Sobic001G129750--Sobic003G020900 Sobic001G129750--Sobic003G262000 Sobic001G129750--Sobic002G430601 Sobic001G129750--Sobic001G302000 Sobic001G129750--Sobic006G080050 Sobic006G190950 Sobic006G190950 Sobic001G129750--Sobic006G190950 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic001G129750--Sobic001G018700 Sobic003G020900--Sobic001G129750 Sobic003G020900--Sobic003G262000 Sobic003G020900--Sobic002G430601 Sobic003G020900--Sobic001G302000 Sobic003G020900--Sobic006G080050 Sobic003G020900--Sobic006G190950 Sobic003G020900--Sobic001G018700 Sobic008G130350--Sobic004G029200 Sobic008G130350--Sobic006G190950 Sobic008G130350--Sobic001G129750 Sobic008G130350--Sobic003G020900 Sobic008G130350--Sobic003G279000 Sobic010G017600 Sobic010G017600 Sobic008G130350--Sobic010G017600 Sobic008G130350--Sobic003G262000 Sobic008G106550 Sobic008G106550 Sobic008G130350--Sobic008G106550 Sobic002G026600 Sobic002G026600 Sobic008G130350--Sobic002G026600 Sobic003G262000--Sobic003G020900 Sobic003G262000--Sobic001G129750 Sobic003G262000--Sobic002G430601 Sobic003G262000--Sobic006G190950 Sobic003G262000--Sobic001G302000 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic003G262000--Sobic003G405400 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic003G262000--Sobic003G384650 Sobic003G262000--Sobic006G080050 Sobic001G539100 Sobic001G539100 Sobic003G262000--Sobic001G539100 Sobic001G494700--Sobic004G029200 Sobic001G494700--Sobic003G279000 Sobic001G494700--Sobic001G129750 Sobic001G494700--Sobic003G020900 Sobic001G494700--Sobic005G009900 Sobic001G494700--Sobic003G262000 Sobic001G494700--Sobic001G302000 Sobic001G494700--Sobic008G130350 Sobic001G185700 Sobic001G185700 Sobic001G494700--Sobic001G185700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.