Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G306000.1
Synonym AtENODL20, ENODL20, Sb03g035450
Functional annotation plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q6A5
Pfam PF02298
Panther DB PTHR33021 PTHR33021:SF43
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0009055; electron transfer activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G27035 : early nodulin-like protein 20
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02200.1 : plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027443
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G074100.1
Wheat TraesCS3A02G301900 , TraesCS3D02G300100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G086300 - -
2 Sobic.001G355700 - -
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15 Sobic.002G072050 - -
16 Sobic.004G103200 lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.007G115700 expressed protein -
18 Sobic.005G231000 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
19 Sobic.009G192450 - -
20 Sobic.007G056300 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G306000 Sobic003G306000 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic003G306000--Sobic008G086300 Sobic001G355700 Sobic001G355700 Sobic003G306000--Sobic001G355700 SobicK043700 SobicK043700 Sobic003G306000--SobicK043700 Sobic001G124400 Sobic001G124400 Sobic003G306000--Sobic001G124400 Sobic003G445750 Sobic003G445750 Sobic003G306000--Sobic003G445750 Sobic007G096833 Sobic007G096833 Sobic003G306000--Sobic007G096833 Sobic001G360300 Sobic001G360300 Sobic003G306000--Sobic001G360300 Sobic004G310000 Sobic004G310000 Sobic003G306000--Sobic004G310000 Sobic001G499350 Sobic001G499350 Sobic003G306000--Sobic001G499350 Sobic006G000200 Sobic006G000200 Sobic008G086300--Sobic006G000200 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic008G086300--Sobic006G045301 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic008G086300--Sobic007G225050 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic008G086300--Sobic007G124800 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic008G086300--Sobic010G217001 Sobic008G086300--Sobic007G096833 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic008G086300--Sobic007G081400 Sobic008G086300--Sobic003G445750 Sobic002G208900 Sobic002G208900 Sobic008G086300--Sobic002G208900 Sobic002G072050 Sobic002G072050 Sobic001G355700--Sobic002G072050 Sobic001G355700--Sobic001G499350 Sobic004G103200 Sobic004G103200 Sobic001G355700--Sobic004G103200 Sobic001G355700--Sobic007G096833 Sobic001G355700--SobicK043700 Sobic001G521800 Sobic001G521800 Sobic001G355700--Sobic001G521800 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic001G355700--Sobic004G117850 Sobic007G056300 Sobic007G056300 Sobic001G355700--Sobic007G056300 Sobic005G231000 Sobic005G231000 Sobic001G355700--Sobic005G231000 SobicK043700--Sobic005G231000 SobicK043700--Sobic004G103200 SobicK043700--Sobic001G499350 SobicK043700--Sobic001G521800 Sobic002G142950 Sobic002G142950 SobicK043700--Sobic002G142950 Sobic003G368550 Sobic003G368550 SobicK043700--Sobic003G368550 Sobic002G212900 Sobic002G212900 SobicK043700--Sobic002G212900 SobicK031900 SobicK031900 SobicK043700--SobicK031900 Sobic002G129900 Sobic002G129900 SobicK043700--Sobic002G129900 Sobic001G124400--Sobic002G072050 Sobic003G226600 Sobic003G226600 Sobic001G124400--Sobic003G226600 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic001G124400--Sobic010G169950 Sobic002G204050 Sobic002G204050 Sobic001G124400--Sobic002G204050 Sobic007G115700 Sobic007G115700 Sobic001G124400--Sobic007G115700 Sobic004G160350 Sobic004G160350 Sobic001G124400--Sobic004G160350 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic001G124400--Sobic002G401533 Sobic001G124400--Sobic007G056300 Sobic001G124400--Sobic001G360300 Sobic003G445750--Sobic001G521800 Sobic003G445750--Sobic008G086300 Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic003G445750--Sobic003G399200 Sobic003G445750--Sobic006G000200 Sobic003G445750--Sobic007G096833 Sobic001G431900 Sobic001G431900 Sobic003G445750--Sobic001G431900 Sobic003G445750--Sobic005G231000 Sobic003G445750--Sobic007G225050 Sobic003G445750--Sobic003G368550 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic007G096833--Sobic009G176100 Sobic007G096833--Sobic006G000200 Sobic007G096833--Sobic003G399200 Sobic007G096833--Sobic004G117850 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic007G096833--Sobic006G111000 Sobic002G302800 Sobic002G302800 Sobic007G096833--Sobic002G302800 Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic007G096833--Sobic010G142501 Sobic007G096833--Sobic007G056300 Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic007G096833--Sobic004G118300 Sobic001G360300--Sobic002G072050 Sobic001G360300--Sobic004G160350 Sobic009G192450 Sobic009G192450 Sobic001G360300--Sobic009G192450 Sobic002G025100 Sobic002G025100 Sobic001G360300--Sobic002G025100 Sobic003G439200 Sobic003G439200 Sobic001G360300--Sobic003G439200 Sobic003G313600 Sobic003G313600 Sobic001G360300--Sobic003G313600 Sobic004G208000 Sobic004G208000 Sobic001G360300--Sobic004G208000 Sobic002G331050 Sobic002G331050 Sobic001G360300--Sobic002G331050 Sobic006G201450 Sobic006G201450 Sobic001G360300--Sobic006G201450 Sobic009G151500 Sobic009G151500 Sobic004G310000--Sobic009G151500 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic004G310000--Sobic002G331200 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic004G310000--Sobic001G214400 Sobic002G284300 Sobic002G284300 Sobic004G310000--Sobic002G284300 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic004G310000--Sobic009G094000 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic004G310000--Sobic002G018133 Sobic004G310000--Sobic006G045301 Sobic010G059900 Sobic010G059900 Sobic004G310000--Sobic010G059900 Sobic004G279150 Sobic004G279150 Sobic004G310000--Sobic004G279150 Sobic001G499350--Sobic004G103200 Sobic001G499350--Sobic002G212900 Sobic001G499350--SobicK043700 Sobic001G499350--Sobic001G521800 Sobic001G499350--Sobic005G231000 Sobic001G499350--Sobic003G368550 Sobic001G499350--Sobic002G129900 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic001G499350--Sobic001G154450 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic001G499350--Sobic007G174500
Octagon: transcription factors


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