Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G124400.1
Synonym Sb01g010950
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WNU0
Pfam PF08576
Panther DB PTHR34066 PTHR34066:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G11760 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g49485.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007746
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G124400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.006G107700 OsMADS27 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant


Gene co-expression network
sample Sobic001G124400 Sobic001G124400 Sobic002G072050 Sobic002G072050 Sobic001G124400--Sobic002G072050 Sobic003G226600 Sobic003G226600 Sobic001G124400--Sobic003G226600 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic001G124400--Sobic010G169950 Sobic002G204050 Sobic002G204050 Sobic001G124400--Sobic002G204050 Sobic007G115700 Sobic007G115700 Sobic001G124400--Sobic007G115700 Sobic004G160350 Sobic004G160350 Sobic001G124400--Sobic004G160350 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic001G124400--Sobic002G401533 Sobic007G056300 Sobic007G056300 Sobic001G124400--Sobic007G056300 Sobic001G360300 Sobic001G360300 Sobic001G124400--Sobic001G360300 Sobic002G072050--Sobic004G160350 Sobic003G313600 Sobic003G313600 Sobic002G072050--Sobic003G313600 Sobic002G072050--Sobic001G360300 Sobic002G072050--Sobic010G169950 Sobic002G072050--Sobic002G204050 Sobic009G192450 Sobic009G192450 Sobic002G072050--Sobic009G192450 Sobic002G025100 Sobic002G025100 Sobic002G072050--Sobic002G025100 Sobic006G205300 Sobic006G205300 Sobic002G072050--Sobic006G205300 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic002G072050--Sobic001G037033 Sobic001G450900 Sobic001G450900 Sobic003G226600--Sobic001G450900 Sobic005G021400 Sobic005G021400 Sobic003G226600--Sobic005G021400 Sobic001G207301 Sobic001G207301 Sobic003G226600--Sobic001G207301 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic003G226600--Sobic005G104900 Sobic006G217400 Sobic006G217400 Sobic003G226600--Sobic006G217400 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic003G226600--Sobic001G535850 Sobic003G226600--Sobic002G401533 Sobic009G027200 Sobic009G027200 Sobic003G226600--Sobic009G027200 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic003G226600--Sobic003G161900 Sobic010G169950--Sobic001G037033 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic010G169950--Sobic009G257000 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic010G169950--Sobic007G113000 Sobic010G169950--Sobic002G401533 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic010G169950--Sobic006G107700 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic010G169950--Sobic004G133201 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic010G169950--Sobic001G373850 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic010G169950--Sobic009G210250 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic010G169950--Sobic008G100900 Sobic002G204050--Sobic006G205300 Sobic002G204050--Sobic010G169950 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic002G204050--Sobic002G358450 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic002G204050--Sobic006G016950 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic002G204050--Sobic004G183701 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic002G204050--Sobic001G475950 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic002G204050--Sobic002G009000 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic002G204050--Sobic001G352633 Sobic002G204050--Sobic002G401533 Sobic007G023000 Sobic007G023000 Sobic007G115700--Sobic007G023000 Sobic007G115700--Sobic007G113000 Sobic007G115700--Sobic010G169950 Sobic007G115700--Sobic008G100900 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic007G115700--Sobic006G111000 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic007G115700--Sobic003G030450 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic007G115700--Sobic006G041200 Sobic007G115700--Sobic001G373850 Sobic002G142950 Sobic002G142950 Sobic007G115700--Sobic002G142950 Sobic004G160350--Sobic002G072050 Sobic004G160350--Sobic002G025100 Sobic004G160350--Sobic009G192450 Sobic004G160350--Sobic003G313600 Sobic004G160350--Sobic010G169950 Sobic004G160350--Sobic001G360300 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic004G160350--Sobic004G084600 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic004G160350--Sobic001G523150 Sobic003G096950 Sobic003G096950 Sobic004G160350--Sobic003G096950 Sobic002G401533--Sobic006G107700 Sobic002G401533--Sobic003G161900 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic002G401533--Sobic003G056200 Sobic002G401533--Sobic001G475950 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic002G401533--Sobic001G261444 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic002G401533--Sobic009G077000 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic002G401533--Sobic003G172966 SobicK032200 SobicK032200 Sobic002G401533--SobicK032200 Sobic002G401533--Sobic005G104900 Sobic002G212900 Sobic002G212900 Sobic007G056300--Sobic002G212900 Sobic004G103200 Sobic004G103200 Sobic007G056300--Sobic004G103200 Sobic001G499350 Sobic001G499350 Sobic007G056300--Sobic001G499350 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic007G056300--Sobic009G176100 Sobic007G056300--Sobic006G111000 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic007G056300--Sobic003G368550 Sobic007G096833 Sobic007G096833 Sobic007G056300--Sobic007G096833 Sobic007G056300--Sobic007G115700 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic007G056300--Sobic002G129900 Sobic001G360300--Sobic002G072050 Sobic001G360300--Sobic004G160350 Sobic001G360300--Sobic009G192450 Sobic001G360300--Sobic002G025100 Sobic003G439200 Sobic003G439200 Sobic001G360300--Sobic003G439200 Sobic001G360300--Sobic003G313600 Sobic004G208000 Sobic004G208000 Sobic001G360300--Sobic004G208000 Sobic002G331050 Sobic002G331050 Sobic001G360300--Sobic002G331050 Sobic006G201450 Sobic006G201450 Sobic001G360300--Sobic006G201450
Octagon: transcription factors


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