Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G226600.1
Synonym WRKY27, Sb03g028440, ATWRKY27
Functional annotation WRKY12, expressed
UniProt C5XEC4
Pfam PF03106
Panther DB PTHR32096 PTHR32096:SF23
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G01250 : WRKY family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g43550.2 : WRKY12, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038595 , Zm00025a036725 , Zm00025a028356
Brachypodium KQK08809 , KQK04705
Barley HORVU3Hr1G055910.8 , HORVU3Hr1G055910.5 , HORVU3Hr1G055910.4 , HORVU3Hr1G055910.7 , HORVU3Hr1G055910.6 , HORVU3Hr1G055910.1 , HORVU3Hr1G055910.3 , HORVU3Hr1G055910.2
Wheat TraesCS3A02G229300 , TraesCS3D02G227400 , TraesCS1B02G455000 , TraesCS1D02G431600 , TraesCS3B02G255400
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G226600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.007G116300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G226600 Sobic003G226600 Sobic001G450900 Sobic001G450900 Sobic003G226600--Sobic001G450900 Sobic005G021400 Sobic005G021400 Sobic003G226600--Sobic005G021400 Sobic001G207301 Sobic001G207301 Sobic003G226600--Sobic001G207301 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic003G226600--Sobic005G104900 Sobic006G217400 Sobic006G217400 Sobic003G226600--Sobic006G217400 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic003G226600--Sobic001G535850 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic003G226600--Sobic002G401533 Sobic009G027200 Sobic009G027200 Sobic003G226600--Sobic009G027200 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic003G226600--Sobic003G161900 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic001G450900--Sobic004G019550 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic001G450900--Sobic001G154000 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic001G450900--Sobic010G035600 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic001G450900--Sobic003G286450 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic001G450900--Sobic001G476800 Sobic001G450900--Sobic001G535850 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic001G450900--Sobic007G065000 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic001G450900--Sobic005G139750 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic001G450900--Sobic008G171200 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic005G021400--Sobic010G176000 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic005G021400--Sobic009G204501 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic005G021400--Sobic007G116300 Sobic005G021400--Sobic003G286450 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic005G021400--Sobic001G093400 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic005G021400--Sobic001G255866 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic005G021400--Sobic010G053700 Sobic005G021400--Sobic001G535850 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic005G021400--Sobic001G420150 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic001G207301--Sobic003G169700 SobicK031400 SobicK031400 Sobic001G207301--SobicK031400 Sobic001G207301--Sobic006G217400 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic001G207301--Sobic004G332200 Sobic006G205800 Sobic006G205800 Sobic001G207301--Sobic006G205800 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic001G207301--Sobic006G261650 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic001G207301--Sobic003G163000 Sobic001G207301--Sobic001G420150 Sobic004G291300 Sobic004G291300 Sobic001G207301--Sobic004G291300 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic005G104900--Sobic005G139900 Sobic005G104900--Sobic005G139750 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic005G104900--Sobic003G173116 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic005G104900--Sobic003G053100 Sobic005G104900--Sobic003G161900 Sobic005G104900--Sobic001G535850 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic005G104900--Sobic003G172600 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic005G104900--Sobic001G022700 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic005G104900--Sobic004G077700 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic006G217400--Sobic003G172966 Sobic007G200700 Sobic007G200700 Sobic006G217400--Sobic007G200700 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic006G217400--Sobic004G115100 SobicK032200 SobicK032200 Sobic006G217400--SobicK032200 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic006G217400--Sobic006G107700 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic006G217400--Sobic003G056200 SobicK031900 SobicK031900 Sobic006G217400--SobicK031900 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic006G217400--Sobic001G261444 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic006G217400--Sobic008G100201 Sobic001G535850--Sobic003G286450 Sobic001G535850--Sobic005G139900 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic001G535850--Sobic004G303433 Sobic001G535850--Sobic003G173116 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic001G535850--Sobic001G394532 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic001G535850--Sobic010G206600 Sobic001G535850--Sobic005G139750 Sobic001G535850--Sobic001G154000 Sobic001G535850--Sobic005G104900 Sobic002G401533--Sobic006G107700 Sobic002G401533--Sobic003G161900 Sobic002G401533--Sobic003G056200 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic002G401533--Sobic001G475950 Sobic002G401533--Sobic001G261444 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic002G401533--Sobic009G077000 Sobic002G401533--Sobic003G172966 Sobic002G401533--SobicK032200 Sobic002G401533--Sobic005G104900 Sobic009G027200--Sobic006G217400 Sobic009G027200--Sobic007G200700 Sobic009G027200--Sobic003G226600 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic009G027200--Sobic008G093300 Sobic009G027200--Sobic004G115100 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic009G027200--Sobic006G029850 Sobic009G027200--Sobic001G207301 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic009G027200--Sobic006G035350 Sobic009G027200--Sobic008G100201 Sobic003G161900--Sobic002G401533 Sobic003G161900--Sobic001G261444 Sobic003G161900--Sobic006G107700 Sobic003G161900--Sobic005G104900 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic003G161900--Sobic003G208200 Sobic003G161900--Sobic009G077000 Sobic003G161900--Sobic001G475950 Sobic003G161900--Sobic003G056200 Sobic003G161900--SobicK032200
Octagon: transcription factors


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