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Transcriptome id Sobic.009G016666.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R0J2
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
2 Sobic.004G337850 - -
3 Sobic.010G035600 - -
4 Sobic.005G139750 - -
5 Sobic.007G065000 proton-dependent oligopeptide transport, putative, expressed -
6 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
7 Sobic.001G450900 UNE2, putative, expressed -
8 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
9 Sobic.006G183100 RFC2 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 2, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
10 Sobic.003G169000 - K02718: photosystem II PsbT protein
11 Sobic.004G077700 - -
12 Sobic.004G191901 - K09264: MADS-box transcription factor, plant
13 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
14 Sobic.003G169100 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed K02704: photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein
15 Sobic.006G057050 - -
16 Sobic.003G172500 - -
17 Sobic.009G101500 - -
18 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -
19 Sobic.004G019550 - -
20 Sobic.009G174150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G016666 Sobic009G016666 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic009G016666--Sobic007G145801 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic009G016666--Sobic004G337850 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic009G016666--Sobic010G035600 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic009G016666--Sobic005G139750 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic009G016666--Sobic007G065000 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic009G016666--Sobic009G123100 Sobic001G450900 Sobic001G450900 Sobic009G016666--Sobic001G450900 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic009G016666--Sobic001G022700 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic009G016666--Sobic006G183100 Sobic007G145801--Sobic009G123100 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic007G145801--Sobic003G169100 Sobic007G145801--Sobic005G139750 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic007G145801--Sobic006G124800 SobicK032300 SobicK032300 Sobic007G145801--SobicK032300 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic007G145801--Sobic010G206600 Sobic007G145801--Sobic006G183100 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic007G145801--Sobic009G148950 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic007G145801--Sobic006G124700 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic004G337850--Sobic006G057050 Sobic004G337850--Sobic009G123100 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic004G337850--Sobic003G352000 Sobic004G337850--Sobic010G035600 Sobic004G337850--Sobic007G145801 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic004G337850--Sobic003G172500 SobicK029400 SobicK029400 Sobic004G337850--SobicK029400 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic004G337850--Sobic003G168200 Sobic004G337850--Sobic009G148950 Sobic010G035600--Sobic007G065000 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic010G035600--Sobic001G182900 Sobic010G035600--Sobic004G337850 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic010G035600--Sobic010G185250 Sobic010G035600--SobicK029400 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic010G035600--Sobic004G019550 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic010G035600--Sobic001G476800 Sobic010G035600--Sobic003G172500 Sobic010G035600--Sobic010G206600 Sobic005G139750--Sobic001G022700 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic005G139750--Sobic004G077700 Sobic005G139750--Sobic007G145801 Sobic005G139750--Sobic010G206600 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic005G139750--Sobic001G535850 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic005G139750--Sobic005G104900 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic005G139750--Sobic003G173116 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic005G139750--Sobic001G230050 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic005G139750--Sobic003G286450 Sobic007G065000--Sobic010G035600 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic007G065000--Sobic003G169000 Sobic007G065000--Sobic003G169100 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic007G065000--Sobic003G369533 Sobic007G065000--SobicK029400 Sobic007G065000--Sobic007G145801 Sobic007G065000--Sobic010G206600 Sobic007G065000--Sobic003G352000 Sobic007G065000--Sobic003G168200 Sobic009G123100--Sobic003G172500 Sobic009G123100--Sobic009G148950 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic009G123100--Sobic004G087050 Sobic009G123100--Sobic006G057050 Sobic009G123100--SobicK032300 Sobic009G123100--Sobic007G145801 Sobic009G123100--Sobic006G124700 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic009G123100--Sobic010G139200 Sobic009G123100--Sobic004G337850 Sobic001G450900--Sobic004G019550 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic001G450900--Sobic001G154000 Sobic001G450900--Sobic010G035600 Sobic001G450900--Sobic003G286450 Sobic001G450900--Sobic001G476800 Sobic001G450900--Sobic001G535850 Sobic001G450900--Sobic007G065000 Sobic001G450900--Sobic005G139750 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic001G450900--Sobic008G171200 Sobic001G022700--Sobic005G139750 Sobic001G022700--Sobic004G077700 Sobic001G022700--Sobic003G173116 Sobic001G022700--Sobic007G145801 Sobic001G022700--Sobic009G148950 Sobic001G022700--Sobic005G104900 Sobic001G022700--Sobic009G123100 Sobic001G022700--Sobic001G230050 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic001G022700--Sobic009G174150 Sobic006G183100--SobicK032300 Sobic006G183100--Sobic006G124700 Sobic006G183100--Sobic001G230050 Sobic006G183100--Sobic010G206600 Sobic006G183100--Sobic003G172500 Sobic006G183100--Sobic009G123100 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic006G183100--Sobic001G394532 Sobic006G183100--Sobic006G124800 Sobic006G183100--Sobic007G145801
Octagon: transcription factors


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