Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G000200.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PJB5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.006G000200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G086300 - -
2 Sobic.007G096833 - -
3 Sobic.009G176100 - -
4 Sobic.002G129900 - -
5 Sobic.003G336550 - -
6 Sobic.006G021100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@L-ascorbate peroxidase (Os)(PubMedID : 27208977)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@OsAPx3 - Peroxisomal Ascorbate Peroxidase encoding gene 5,8, expressed K00434: L-ascorbate peroxidase
7 Sobic.005G018400 NB-ARC domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G202550 - -
9 Sobic.006G215650 - -
10 Sobic.002G208900 glutamate receptor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
11 Sobic.001G521800 expressed protein -
12 Sobic.004G030850 - -
13 Sobic.006G111000 expressed protein -
14 Sobic.006G041200 - -
15 Sobic.003G368550 - -
16 Sobic.009G199750 - -
17 Sobic.007G056300 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, putative, expressed -
18 Sobic.007G203800 - -
19 Sobic.004G180950 - -
20 Sobic.007G023000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G000200 Sobic006G000200 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic006G000200--Sobic008G086300 Sobic007G096833 Sobic007G096833 Sobic006G000200--Sobic007G096833 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic006G000200--Sobic009G176100 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic006G000200--Sobic002G129900 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic006G000200--Sobic003G336550 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic006G000200--Sobic006G021100 Sobic005G018400 Sobic005G018400 Sobic006G000200--Sobic005G018400 Sobic001G202550 Sobic001G202550 Sobic006G000200--Sobic001G202550 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic006G000200--Sobic006G215650 Sobic008G086300--Sobic006G000200 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic008G086300--Sobic006G045301 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic008G086300--Sobic007G225050 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic008G086300--Sobic007G124800 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic008G086300--Sobic010G217001 Sobic008G086300--Sobic007G096833 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic008G086300--Sobic007G081400 Sobic003G445750 Sobic003G445750 Sobic008G086300--Sobic003G445750 Sobic002G208900 Sobic002G208900 Sobic008G086300--Sobic002G208900 Sobic007G096833--Sobic009G176100 Sobic007G096833--Sobic006G000200 Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic007G096833--Sobic003G399200 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic007G096833--Sobic004G117850 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic007G096833--Sobic006G111000 Sobic002G302800 Sobic002G302800 Sobic007G096833--Sobic002G302800 Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic007G096833--Sobic010G142501 Sobic007G056300 Sobic007G056300 Sobic007G096833--Sobic007G056300 Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic007G096833--Sobic004G118300 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic009G176100--Sobic008G085800 Sobic009G176100--Sobic006G111000 Sobic009G176100--Sobic007G096833 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic009G176100--Sobic003G329300 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic009G176100--Sobic002G171901 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic009G176100--Sobic008G100900 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic009G176100--Sobic007G174500 Sobic009G176100--Sobic004G117850 Sobic009G176100--Sobic010G142501 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic002G129900--Sobic004G180950 Sobic002G129900--Sobic005G018400 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic002G129900--Sobic009G199750 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic002G129900--Sobic001G283400 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic002G129900--Sobic002G200400 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic002G129900--Sobic003G368550 Sobic002G129900--Sobic006G111000 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic002G129900--Sobic006G041200 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic002G129900--Sobic010G155000 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic003G336550--Sobic004G030850 Sobic003G336550--Sobic006G041200 Sobic003G336550--Sobic006G021100 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic003G336550--Sobic004G084600 Sobic003G336550--Sobic006G111000 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic003G336550--Sobic004G255550 Sobic001G485901 Sobic001G485901 Sobic003G336550--Sobic001G485901 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic003G336550--Sobic007G203800 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic003G336550--Sobic008G113200 Sobic006G021100--Sobic003G336550 Sobic006G021100--Sobic006G041200 Sobic007G089566 Sobic007G089566 Sobic006G021100--Sobic007G089566 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic006G021100--Sobic003G219300 Sobic006G021100--Sobic007G203800 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic006G021100--Sobic002G226200 Sobic006G021100--Sobic004G030850 Sobic006G021100--Sobic006G111000 Sobic006G021100--Sobic004G084600 Sobic005G018400--Sobic002G129900 Sobic005G018400--Sobic009G199750 Sobic005G018400--Sobic004G180950 Sobic005G018400--Sobic002G200400 Sobic005G018400--Sobic001G283400 Sobic005G018400--Sobic003G368550 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic005G018400--Sobic006G097600 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic005G018400--Sobic003G230800 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic005G018400--Sobic008G129500 Sobic004G008100 Sobic004G008100 Sobic001G202550--Sobic004G008100 Sobic001G202550--Sobic006G000200 Sobic001G047500 Sobic001G047500 Sobic001G202550--Sobic001G047500 Sobic005G031400 Sobic005G031400 Sobic001G202550--Sobic005G031400 Sobic001G202550--Sobic004G030850 Sobic007G075600 Sobic007G075600 Sobic001G202550--Sobic007G075600 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic001G202550--Sobic010G088100 Sobic003G358800 Sobic003G358800 Sobic001G202550--Sobic003G358800 Sobic001G202550--Sobic002G302800 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic006G215650--Sobic002G046150 Sobic006G215650--Sobic002G208900 Sobic006G215650--Sobic002G129900 Sobic006G215650--Sobic003G230800 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic006G215650--Sobic002G208700 Sobic006G215650--Sobic004G180950 Sobic006G215650--Sobic009G176100 Sobic006G215650--Sobic003G219300 Sobic006G215650--Sobic005G018400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.