Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G008200.4,Sobic.004G008200.2,Sobic.004G008200.6,Sobic.004G008200.3,Sobic.004G008200.5
Synonym SBH1
Functional annotation sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RKC4 , A0A1Z5RL64 , A0A1Z5RLF2
Pfam PF04116
Panther DB PTHR11863 PTHR11863:SF52
NCBI CDD KOG0874; Sphingolipid hydroxylase
KEGG Orthology K04713; sphinganine C4-monooxygenase
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity GO:0006633fatty acid biosynthetic process GO:0005506iron ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G14290 : sphingoid base hydroxylase 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g22490.1 : sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029755 , Zm00025a044154 , Zm00025a044153
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G274100 spotted leaf 11, putative, expressed -
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Gene co-expression network
sample Sobic004G008200 Sobic004G008200 Sobic010G274100 Sobic010G274100 Sobic004G008200--Sobic010G274100 Sobic004G134900 Sobic004G134900 Sobic004G008200--Sobic004G134900 Sobic008G057800 Sobic008G057800 Sobic004G008200--Sobic008G057800 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic004G008200--Sobic005G035250 Sobic008G011901 Sobic008G011901 Sobic004G008200--Sobic008G011901 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic004G008200--Sobic002G145400 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic004G008200--Sobic008G097800 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic004G008200--Sobic003G195400 Sobic005G035200 Sobic005G035200 Sobic004G008200--Sobic005G035200 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic010G274100--Sobic004G158100 Sobic010G274100--Sobic008G057800 Sobic001G024700 Sobic001G024700 Sobic010G274100--Sobic001G024700 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic010G274100--Sobic001G539820 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic010G274100--Sobic005G009700 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic010G274100--Sobic002G128700 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic010G274100--Sobic002G225800 Sobic010G274100--Sobic003G195400 Sobic005G065300 Sobic005G065300 Sobic010G274100--Sobic005G065300 Sobic004G134900--Sobic005G035250 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic004G134900--Sobic007G148233 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic004G134900--Sobic001G539880 Sobic004G134900--Sobic002G225800 Sobic004G134900--Sobic003G195400 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic004G134900--Sobic004G024800 Sobic004G134900--Sobic002G128700 Sobic004G134900--Sobic005G035200 Sobic004G134900--Sobic005G009700 Sobic008G057800--Sobic008G011901 Sobic008G057800--Sobic008G097800 Sobic008G057800--Sobic002G145400 Sobic008G057800--Sobic004G024800 Sobic008G057800--Sobic005G035200 Sobic007G221932 Sobic007G221932 Sobic008G057800--Sobic007G221932 Sobic007G080100 Sobic007G080100 Sobic008G057800--Sobic007G080100 Sobic008G057800--Sobic003G195400 Sobic008G057800--Sobic001G539880 Sobic005G035250--Sobic007G148233 Sobic005G035250--Sobic003G195400 Sobic005G035250--Sobic002G225800 Sobic005G035250--Sobic001G539880 Sobic005G035250--Sobic005G035200 Sobic005G035250--Sobic004G024800 Sobic005G035250--Sobic007G080100 Sobic005G035250--Sobic002G145400 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic005G035250--Sobic007G222700 Sobic008G011901--Sobic007G080100 Sobic008G011901--Sobic004G024800 Sobic008G011901--Sobic005G035200 Sobic008G011901--Sobic007G221932 Sobic008G011901--Sobic002G145400 Sobic008G011901--Sobic001G539880 Sobic008G011901--Sobic008G097800 Sobic008G011901--Sobic003G195400 Sobic009G091000 Sobic009G091000 Sobic008G011901--Sobic009G091000 Sobic002G145400--Sobic005G035200 Sobic002G145400--Sobic008G097800 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic002G145400--Sobic004G336401 Sobic002G145400--Sobic007G221932 Sobic002G145400--Sobic004G024800 Sobic010G254100 Sobic010G254100 Sobic002G145400--Sobic010G254100 Sobic002G145400--Sobic007G080100 Sobic002G145400--Sobic009G091000 Sobic002G145400--Sobic003G195400 Sobic008G097800--Sobic007G221932 Sobic008G097800--Sobic004G336401 Sobic008G097800--Sobic009G091000 Sobic009G252000 Sobic009G252000 Sobic008G097800--Sobic009G252000 Sobic008G097800--Sobic010G254100 Sobic010G034300 Sobic010G034300 Sobic008G097800--Sobic010G034300 Sobic008G097800--Sobic005G035200 Sobic008G097800--Sobic002G145400 Sobic008G097800--Sobic004G024800 Sobic003G195400--Sobic007G148233 Sobic003G195400--Sobic002G225800 Sobic003G195400--Sobic001G539880 Sobic003G195400--Sobic005G035250 Sobic003G195400--Sobic005G035200 Sobic003G195400--Sobic004G024800 Sobic003G195400--Sobic007G080100 Sobic003G195400--Sobic004G158100 Sobic003G195400--Sobic005G009700 Sobic005G035200--Sobic004G024800 Sobic005G035200--Sobic002G145400 Sobic005G035200--Sobic004G336401 Sobic005G035200--Sobic007G221932 Sobic005G035200--Sobic001G539880 Sobic005G035200--Sobic008G097800 Sobic005G035200--Sobic003G195400 Sobic005G035200--Sobic007G080100 Sobic005G035200--Sobic007G148233
Octagon: transcription factors


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