Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G274100.1,Sobic.010G274100.2
Synonym Sb10g030800, PUB15
Functional annotation spotted leaf 11, putative, expressed
UniProt C5Z2L2 , A0A194YMX5
Pfam PF04564 PF00514
Panther DB PTHR23315 PTHR23315:SF49
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016567; protein ubiquitination GO:0004842ubiquitin-protein transferase activity GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G42340 : Plant U-Box 15
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g37570.1,LOC_Os06g51130.1 : spotted leaf 11, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018540
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7D02G536300 , TraesCS7A02G549700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G539880 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G274100 Sobic010G274100 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic010G274100--Sobic004G158100 Sobic008G057800 Sobic008G057800 Sobic010G274100--Sobic008G057800 Sobic001G024700 Sobic001G024700 Sobic010G274100--Sobic001G024700 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic010G274100--Sobic001G539820 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic010G274100--Sobic005G009700 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic010G274100--Sobic002G128700 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic010G274100--Sobic002G225800 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic010G274100--Sobic003G195400 Sobic005G065300 Sobic005G065300 Sobic010G274100--Sobic005G065300 Sobic004G158100--Sobic005G009700 Sobic004G158100--Sobic002G225800 Sobic004G158100--Sobic001G539820 Sobic005G000200 Sobic005G000200 Sobic004G158100--Sobic005G000200 Sobic001G139400 Sobic001G139400 Sobic004G158100--Sobic001G139400 Sobic004G158100--Sobic003G195400 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic004G158100--Sobic007G148233 Sobic004G158100--Sobic002G128700 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic004G158100--Sobic007G222700 Sobic008G011901 Sobic008G011901 Sobic008G057800--Sobic008G011901 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic008G057800--Sobic008G097800 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic008G057800--Sobic002G145400 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic008G057800--Sobic004G024800 Sobic005G035200 Sobic005G035200 Sobic008G057800--Sobic005G035200 Sobic007G221932 Sobic007G221932 Sobic008G057800--Sobic007G221932 Sobic007G080100 Sobic007G080100 Sobic008G057800--Sobic007G080100 Sobic008G057800--Sobic003G195400 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic008G057800--Sobic001G539880 Sobic001G024700--Sobic005G009700 Sobic001G024700--Sobic005G000200 Sobic001G024700--Sobic004G158100 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic001G024700--Sobic004G091000 Sobic001G024700--Sobic001G539820 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic001G024700--Sobic003G114800 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic001G024700--Sobic007G134260 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic001G024700--Sobic007G103000 Sobic001G024700--Sobic001G139400 Sobic001G539820--Sobic005G009700 Sobic001G539820--Sobic005G000200 Sobic001G539820--Sobic002G128700 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic001G539820--Sobic001G364700 Sobic001G539820--Sobic002G225800 Sobic001G539820--Sobic004G091000 Sobic001G539820--Sobic001G139400 Sobic001G539820--Sobic004G158100 Sobic001G539820--Sobic007G148233 Sobic005G009700--Sobic001G539820 Sobic005G009700--Sobic005G000200 Sobic005G009700--Sobic002G128700 Sobic005G009700--Sobic002G225800 Sobic005G009700--Sobic001G139400 Sobic005G009700--Sobic004G091000 Sobic005G009700--Sobic003G114800 Sobic005G009700--Sobic001G364700 Sobic005G009700--Sobic004G158100 Sobic002G128700--Sobic001G539820 Sobic002G128700--Sobic005G009700 Sobic002G128700--Sobic005G000200 Sobic002G128700--Sobic002G225800 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic002G128700--Sobic006G173400 Sobic002G128700--Sobic007G148233 Sobic002G128700--Sobic001G139400 Sobic002G128700--Sobic001G364700 Sobic002G128700--Sobic001G539880 Sobic002G225800--Sobic007G148233 Sobic002G225800--Sobic003G195400 Sobic002G225800--Sobic001G539880 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic002G225800--Sobic005G035250 Sobic002G225800--Sobic005G009700 Sobic002G225800--Sobic001G539820 Sobic002G225800--Sobic002G128700 Sobic002G225800--Sobic007G222700 Sobic002G225800--Sobic004G158100 Sobic003G195400--Sobic007G148233 Sobic003G195400--Sobic002G225800 Sobic003G195400--Sobic001G539880 Sobic003G195400--Sobic005G035250 Sobic003G195400--Sobic005G035200 Sobic003G195400--Sobic004G024800 Sobic003G195400--Sobic007G080100 Sobic003G195400--Sobic004G158100 Sobic003G195400--Sobic005G009700 Sobic009G089200 Sobic009G089200 Sobic005G065300--Sobic009G089200 Sobic005G065300--Sobic007G103000 Sobic005G065300--Sobic007G134260 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic005G065300--Sobic008G102850 Sobic005G065300--Sobic003G114800 Sobic005G065300--Sobic004G091000 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic005G065300--Sobic005G122100 Sobic003G147700 Sobic003G147700 Sobic005G065300--Sobic003G147700 Sobic003G232100 Sobic003G232100 Sobic005G065300--Sobic003G232100
Octagon: transcription factors


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