Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G038900.1
Synonym ARA1, ISA1, ATISA1
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YML5
Pfam PF01936
Panther DB PTHR38134
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G15560 : Putative endonuclease or glycosyl hydrolase
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g13390.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G171800 OsFBDUF20 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
2 Sobic.007G128400 expressed protein -
3 Sobic.010G207400 protein kinase domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G207100 expressed protein -
5 Sobic.003G091500 expressed protein -
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7 Sobic.005G174500 - -
8 Sobic.010G047300 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
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12 Sobic.008G088900 hypothetical protein -
13 Sobic.001G233600 expressed protein -
14 Sobic.004G196800 tetratricopeptide repeat containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G089500 DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
16 Sobic.005G174000 - -
17 Sobic.001G246400 MBTB43 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
18 Sobic.002G108300 expressed protein -
19 Sobic.009G077250 - -
20 Sobic.009G090250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G038900 Sobic004G038900 Sobic005G171800 Sobic005G171800 Sobic004G038900--Sobic005G171800 Sobic007G128400 Sobic007G128400 Sobic004G038900--Sobic007G128400 Sobic010G207400 Sobic010G207400 Sobic004G038900--Sobic010G207400 Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic004G038900--Sobic003G207100 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic004G038900--Sobic003G091500 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic004G038900--Sobic002G007700 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic004G038900--Sobic005G174500 Sobic010G047300 Sobic010G047300 Sobic004G038900--Sobic010G047300 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic004G038900--Sobic008G184100 Sobic007G037200 Sobic007G037200 Sobic005G171800--Sobic007G037200 Sobic008G168400 Sobic008G168400 Sobic005G171800--Sobic008G168400 Sobic007G187100 Sobic007G187100 Sobic005G171800--Sobic007G187100 Sobic005G032500 Sobic005G032500 Sobic005G171800--Sobic005G032500 Sobic009G061900 Sobic009G061900 Sobic005G171800--Sobic009G061900 Sobic004G212350 Sobic004G212350 Sobic005G171800--Sobic004G212350 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic005G171800--Sobic002G293100 Sobic002G100000 Sobic002G100000 Sobic005G171800--Sobic002G100000 Sobic010G181900 Sobic010G181900 Sobic005G171800--Sobic010G181900 Sobic006G117300 Sobic006G117300 Sobic007G128400--Sobic006G117300 Sobic007G040000 Sobic007G040000 Sobic007G128400--Sobic007G040000 Sobic007G128400--Sobic005G174500 Sobic009G090250 Sobic009G090250 Sobic007G128400--Sobic009G090250 Sobic001G246400 Sobic001G246400 Sobic007G128400--Sobic001G246400 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic007G128400--Sobic003G321500 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic007G128400--Sobic002G089500 Sobic002G267700 Sobic002G267700 Sobic007G128400--Sobic002G267700 Sobic001G392900 Sobic001G392900 Sobic007G128400--Sobic001G392900 Sobic010G207400--Sobic005G171800 Sobic004G294100 Sobic004G294100 Sobic010G207400--Sobic004G294100 Sobic009G025100 Sobic009G025100 Sobic010G207400--Sobic009G025100 Sobic003G230500 Sobic003G230500 Sobic010G207400--Sobic003G230500 Sobic010G227400 Sobic010G227400 Sobic010G207400--Sobic010G227400 Sobic010G168500 Sobic010G168500 Sobic010G207400--Sobic010G168500 Sobic009G077250 Sobic009G077250 Sobic010G207400--Sobic009G077250 Sobic008G039700 Sobic008G039700 Sobic010G207400--Sobic008G039700 Sobic001G158600 Sobic001G158600 Sobic010G207400--Sobic001G158600 Sobic003G207100--Sobic002G007700 Sobic003G207100--Sobic003G091500 Sobic003G207100--Sobic008G184100 Sobic003G207100--Sobic002G089500 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic003G207100--Sobic001G233600 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic003G207100--Sobic004G171600 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic003G207100--Sobic005G077900 Sobic003G207100--Sobic005G174500 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic003G207100--Sobic008G088900 Sobic003G091500--Sobic008G184100 Sobic003G091500--Sobic008G088900 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic003G091500--Sobic002G108300 Sobic003G091500--Sobic002G007700 Sobic003G091500--Sobic004G171600 Sobic003G091500--Sobic003G207100 Sobic003G091500--Sobic001G233600 Sobic008G031400 Sobic008G031400 Sobic003G091500--Sobic008G031400 Sobic003G091500--Sobic005G077900 Sobic002G007700--Sobic001G233600 Sobic002G007700--Sobic004G171600 Sobic002G007700--Sobic002G089500 Sobic002G007700--Sobic005G077900 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic002G007700--Sobic005G174000 Sobic002G007700--Sobic003G091500 Sobic002G007700--Sobic008G184100 Sobic005G021100 Sobic005G021100 Sobic002G007700--Sobic005G021100 Sobic002G007700--Sobic008G088900 Sobic005G174500--Sobic009G090250 Sobic005G174500--Sobic001G246400 Sobic005G174500--Sobic007G040000 Sobic005G173900 Sobic005G173900 Sobic005G174500--Sobic005G173900 Sobic005G174500--Sobic002G007700 Sobic005G174500--Sobic006G117300 Sobic005G174500--Sobic003G091500 Sobic005G174500--Sobic002G089500 Sobic005G174500--Sobic003G207100 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic010G047300--Sobic009G058300 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic010G047300--Sobic006G264800 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic010G047300--Sobic002G172100 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic010G047300--Sobic001G489075 Sobic008G109600 Sobic008G109600 Sobic010G047300--Sobic008G109600 Sobic010G047300--Sobic002G108300 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic010G047300--Sobic002G172200 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic010G047300--Sobic001G284700 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic010G047300--Sobic002G015400 Sobic008G184100--Sobic003G091500 Sobic008G184100--Sobic008G088900 Sobic008G184100--Sobic002G108300 Sobic008G184100--Sobic002G007700 Sobic008G184100--Sobic004G171600 Sobic008G184100--Sobic008G031400 Sobic008G184100--Sobic001G233600 Sobic008G184100--Sobic003G207100 Sobic008G184100--Sobic005G174000
Octagon: transcription factors


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