Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G046900.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RLF5
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33086 PTHR33086:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g08650.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G046900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G141600 - -
2 Sobic.006G099200 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
3 Sobic.001G125600 - -
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11 Sobic.005G125200 OsFBX313 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G015100 expressed protein -
13 Sobic.004G338900 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.005G072850 - -
15 Sobic.001G120800 - -
16 Sobic.006G130900 - -
17 Sobic.005G209600 kinesin-4, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
18 Sobic.002G160200 expressed protein -
19 Sobic.010G257900 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
20 Sobic.002G031301 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G046900 Sobic004G046900 Sobic003G141600 Sobic003G141600 Sobic004G046900--Sobic003G141600 Sobic006G099200 Sobic006G099200 Sobic004G046900--Sobic006G099200 Sobic001G125600 Sobic001G125600 Sobic004G046900--Sobic001G125600 Sobic005G027250 Sobic005G027250 Sobic004G046900--Sobic005G027250 Sobic003G223800 Sobic003G223800 Sobic004G046900--Sobic003G223800 Sobic010G032200 Sobic010G032200 Sobic004G046900--Sobic010G032200 Sobic009G044200 Sobic009G044200 Sobic004G046900--Sobic009G044200 Sobic007G204800 Sobic007G204800 Sobic004G046900--Sobic007G204800 Sobic008G041450 Sobic008G041450 Sobic004G046900--Sobic008G041450 Sobic004G098800 Sobic004G098800 Sobic003G141600--Sobic004G098800 Sobic003G141600--Sobic008G041450 Sobic003G392275 Sobic003G392275 Sobic003G141600--Sobic003G392275 Sobic010G006800 Sobic010G006800 Sobic003G141600--Sobic010G006800 Sobic001G490950 Sobic001G490950 Sobic003G141600--Sobic001G490950 Sobic002G102300 Sobic002G102300 Sobic003G141600--Sobic002G102300 Sobic002G368100 Sobic002G368100 Sobic003G141600--Sobic002G368100 Sobic010G134700 Sobic010G134700 Sobic003G141600--Sobic010G134700 Sobic004G178700 Sobic004G178700 Sobic003G141600--Sobic004G178700 Sobic006G099200--Sobic005G027250 Sobic006G099200--Sobic007G204800 Sobic004G338900 Sobic004G338900 Sobic006G099200--Sobic004G338900 Sobic006G099200--Sobic009G044200 Sobic001G160900 Sobic001G160900 Sobic006G099200--Sobic001G160900 Sobic006G099200--Sobic010G032200 Sobic002G160200 Sobic002G160200 Sobic006G099200--Sobic002G160200 Sobic002G083100 Sobic002G083100 Sobic006G099200--Sobic002G083100 Sobic001G120800 Sobic001G120800 Sobic006G099200--Sobic001G120800 Sobic003G444700 Sobic003G444700 Sobic001G125600--Sobic003G444700 Sobic003G192200 Sobic003G192200 Sobic001G125600--Sobic003G192200 Sobic003G131900 Sobic003G131900 Sobic001G125600--Sobic003G131900 Sobic010G257900 Sobic010G257900 Sobic001G125600--Sobic010G257900 Sobic001G125600--Sobic001G120800 Sobic010G056900 Sobic010G056900 Sobic001G125600--Sobic010G056900 Sobic006G130900 Sobic006G130900 Sobic001G125600--Sobic006G130900 Sobic001G125600--Sobic001G160900 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic001G125600--Sobic002G102600 Sobic005G027250--Sobic006G099200 Sobic005G027250--Sobic009G044200 Sobic005G027250--Sobic004G338900 Sobic005G027250--Sobic007G204800 Sobic005G027250--Sobic002G160200 Sobic005G027250--Sobic001G160900 Sobic005G027250--Sobic002G083100 Sobic005G027250--Sobic010G032200 Sobic005G125200 Sobic005G125200 Sobic005G027250--Sobic005G125200 Sobic003G385000 Sobic003G385000 Sobic003G223800--Sobic003G385000 Sobic006G199700 Sobic006G199700 Sobic003G223800--Sobic006G199700 Sobic003G223800--Sobic004G098800 Sobic003G223800--Sobic010G134700 Sobic003G435400 Sobic003G435400 Sobic003G223800--Sobic003G435400 Sobic001G284425 Sobic001G284425 Sobic003G223800--Sobic001G284425 Sobic010G220400 Sobic010G220400 Sobic003G223800--Sobic010G220400 Sobic003G223800--Sobic008G041450 Sobic002G373600 Sobic002G373600 Sobic003G223800--Sobic002G373600 Sobic010G032200--Sobic006G099200 Sobic010G032200--Sobic005G027250 Sobic010G032200--Sobic007G204800 Sobic010G015100 Sobic010G015100 Sobic010G032200--Sobic010G015100 Sobic010G032200--Sobic004G338900 Sobic010G032200--Sobic009G044200 Sobic009G237900 Sobic009G237900 Sobic010G032200--Sobic009G237900 Sobic005G072850 Sobic005G072850 Sobic010G032200--Sobic005G072850 Sobic010G032200--Sobic002G083100 Sobic009G044200--Sobic005G027250 Sobic009G044200--Sobic006G099200 Sobic009G044200--Sobic004G338900 Sobic009G044200--Sobic005G125200 Sobic009G044200--Sobic002G160200 Sobic009G044200--Sobic007G204800 Sobic009G044200--Sobic001G160900 Sobic009G044200--Sobic002G083100 Sobic009G044200--Sobic010G032200 Sobic007G204800--Sobic002G160200 Sobic007G204800--Sobic004G338900 Sobic007G204800--Sobic006G099200 Sobic007G204800--Sobic001G160900 Sobic007G204800--Sobic001G120800 Sobic007G204800--Sobic002G102600 Sobic007G204800--Sobic010G257900 Sobic007G204800--Sobic005G027250 Sobic007G204800--Sobic002G083100 Sobic008G041450--Sobic004G098800 Sobic008G041600 Sobic008G041600 Sobic008G041450--Sobic008G041600 Sobic008G041450--Sobic003G141600 Sobic008G041450--Sobic010G134700 Sobic008G041450--Sobic003G392275 Sobic008G041450--Sobic003G385000 Sobic008G041450--Sobic010G006800 Sobic008G041450--Sobic002G102300 Sobic001G414100 Sobic001G414100 Sobic008G041450--Sobic001G414100
Octagon: transcription factors


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