Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G156100.2
Synonym RHS18, Sb04g020720
Functional annotation peroxidase precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RMP0
Pfam PF00141
Panther DB PTHR31235 PTHR31235:SF35
NCBI CDD -
KEGG Orthology K00430; peroxidase
Gene Ontology GO:0006979; response to oxidative stress GO:0004601peroxidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G22410 : root hair specific 18
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g04410.1 : peroxidase precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031352
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G116220.1
Wheat TraesCS1D02G080100 , TraesCS5A02G039600 , TraesCS5A02G039100 , TraesCS5A02G039200 , TraesCS3A02G141800 , TraesCS5B02G040900 , TraesCS5D02G046500 , TraesCS5A02G039500 , TraesCS3D02G145400 , TraesCS2D02G153500 , TraesCS3B02G162900
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G392000 WD40-like Beta Propeller Repeat family protein, expressed -
2 Sobic.007G131300 endoglucanase, putative, expressed -
3 Sobic.009G133100 cytochrome P450 72A1, putative, expressed -
4 Sobic.008G055650 - -
5 Sobic.008G147800 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
6 Sobic.009G196100 dof zinc finger domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G072400 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
8 Sobic.010G065500 BHLH transcription factor, putative, expressed -
9 Sobic.005G050900 - -
10 Sobic.005G225700 ZOS11-09 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
11 Sobic.002G008000 DnaK family protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G042800 expressed protein -
13 Sobic.010G267651 - -
14 Sobic.004G181100 expressed protein -
15 Sobic.007G035100 cyclin, putative, expressed K05868: G2/mitotic-specific cyclin-B1
16 Sobic.002G159400 expressed protein -
17 Sobic.010G111700 - -
18 Sobic.006G088500 OsFBX135 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G274000 STE_MEK_ste7_MAP2K.4 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed -
20 Sobic.002G188800 anthocyanin 3-O-beta-glucosyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G156100 Sobic004G156100 Sobic001G392000 Sobic001G392000 Sobic004G156100--Sobic001G392000 Sobic007G131300 Sobic007G131300 Sobic004G156100--Sobic007G131300 Sobic009G133100 Sobic009G133100 Sobic004G156100--Sobic009G133100 Sobic008G055650 Sobic008G055650 Sobic004G156100--Sobic008G055650 Sobic008G147800 Sobic008G147800 Sobic004G156100--Sobic008G147800 Sobic009G196100 Sobic009G196100 Sobic004G156100--Sobic009G196100 Sobic004G072400 Sobic004G072400 Sobic004G156100--Sobic004G072400 Sobic010G065500 Sobic010G065500 Sobic004G156100--Sobic010G065500 Sobic005G050900 Sobic005G050900 Sobic004G156100--Sobic005G050900 Sobic001G303600 Sobic001G303600 Sobic001G392000--Sobic001G303600 Sobic001G392000--Sobic004G156100 Sobic003G270000 Sobic003G270000 Sobic001G392000--Sobic003G270000 Sobic001G392000--Sobic004G072400 Sobic008G010700 Sobic008G010700 Sobic001G392000--Sobic008G010700 Sobic005G205550 Sobic005G205550 Sobic001G392000--Sobic005G205550 Sobic001G392000--Sobic007G131300 Sobic001G392000--Sobic009G133100 Sobic004G126200 Sobic004G126200 Sobic001G392000--Sobic004G126200 Sobic007G131300--Sobic010G065500 Sobic007G131300--Sobic008G147800 Sobic003G083100 Sobic003G083100 Sobic007G131300--Sobic003G083100 Sobic007G131300--Sobic009G133100 Sobic005G030200 Sobic005G030200 Sobic007G131300--Sobic005G030200 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic007G131300--Sobic009G258200 Sobic007G131300--Sobic008G055650 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic007G131300--Sobic002G063500 Sobic007G131300--Sobic005G050900 Sobic009G133100--Sobic007G131300 Sobic009G133100--Sobic004G072400 Sobic009G133100--Sobic010G065500 Sobic001G364200 Sobic001G364200 Sobic009G133100--Sobic001G364200 Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic009G133100--Sobic002G070400 Sobic009G133100--Sobic008G055650 Sobic009G133100--Sobic005G030200 Sobic009G133100--Sobic008G147800 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic009G133100--Sobic005G005100 Sobic008G055650--Sobic010G065500 Sobic002G277366 Sobic002G277366 Sobic008G055650--Sobic002G277366 Sobic003G021401 Sobic003G021401 Sobic008G055650--Sobic003G021401 Sobic004G082050 Sobic004G082050 Sobic008G055650--Sobic004G082050 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic008G055650--Sobic003G120050 Sobic003G023100 Sobic003G023100 Sobic008G055650--Sobic003G023100 Sobic010G267651 Sobic010G267651 Sobic008G055650--Sobic010G267651 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic008G055650--Sobic008G008601 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic008G055650--Sobic004G013400 Sobic008G147800--Sobic009G258200 Sobic008G147800--Sobic010G065500 Sobic005G205000 Sobic005G205000 Sobic008G147800--Sobic005G205000 Sobic008G147800--Sobic003G083100 Sobic005G219800 Sobic005G219800 Sobic008G147800--Sobic005G219800 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic008G147800--Sobic008G045900 Sobic008G147800--Sobic007G131300 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic008G147800--Sobic008G045100 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic008G147800--Sobic009G142600 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic009G196100--Sobic001G060001 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic009G196100--Sobic007G120600 Sobic002G078600 Sobic002G078600 Sobic009G196100--Sobic002G078600 Sobic007G007650 Sobic007G007650 Sobic009G196100--Sobic007G007650 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic009G196100--Sobic004G052700 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic009G196100--Sobic008G096401 Sobic003G326100 Sobic003G326100 Sobic009G196100--Sobic003G326100 Sobic009G196100--Sobic010G267651 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic009G196100--Sobic010G146350 Sobic004G072400--Sobic009G133100 Sobic001G058000 Sobic001G058000 Sobic004G072400--Sobic001G058000 Sobic004G072400--Sobic001G364200 Sobic004G072400--Sobic007G131300 Sobic004G072400--Sobic008G055650 Sobic004G101100 Sobic004G101100 Sobic004G072400--Sobic004G101100 Sobic004G072400--Sobic005G050900 Sobic004G072400--Sobic001G392000 Sobic004G233900 Sobic004G233900 Sobic004G072400--Sobic004G233900 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic010G065500--Sobic006G137900 Sobic010G065500--Sobic008G008601 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic010G065500--Sobic005G013700 Sobic010G065500--Sobic002G063500 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic010G065500--Sobic001G452300 Sobic010G065500--Sobic003G120050 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic010G065500--Sobic004G122700 Sobic010G065500--Sobic004G013400 Sobic010G065500--Sobic002G070400 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic005G050900--Sobic001G190600 Sobic005G050900--Sobic010G065500 Sobic005G050900--Sobic004G013400 Sobic001G001000 Sobic001G001000 Sobic005G050900--Sobic001G001000 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic005G050900--Sobic005G207550 Sobic005G050900--Sobic006G137900 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic005G050900--Sobic005G207600 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic005G050900--Sobic001G138500 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic005G050900--Sobic008G008701
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.