Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G263300.1
Synonym
Functional annotation PPR repeat domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A194YRN3
Pfam PF13812 PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF698
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G77360 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g48122.1 : PPR repeat domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032500 , Zm00025a021769
Brachypodium -
Barley HORVU0Hr1G016920.10 , HORVU0Hr1G016920.11 , HORVU0Hr1G016920.12 , HORVU0Hr1G016920.13 , HORVU0Hr1G016920.7 , HORVU0Hr1G016920.8 , HORVU0Hr1G016920.9
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G263300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic004G263300 Sobic004G263300 Sobic005G022400 Sobic005G022400 Sobic004G263300--Sobic005G022400 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic004G263300--Sobic007G072901 Sobic004G356600 Sobic004G356600 Sobic004G263300--Sobic004G356600 Sobic002G356700 Sobic002G356700 Sobic004G263300--Sobic002G356700 Sobic002G052500 Sobic002G052500 Sobic004G263300--Sobic002G052500 Sobic003G045800 Sobic003G045800 Sobic004G263300--Sobic003G045800 Sobic009G233600 Sobic009G233600 Sobic004G263300--Sobic009G233600 Sobic007G056400 Sobic007G056400 Sobic004G263300--Sobic007G056400 Sobic009G194600 Sobic009G194600 Sobic004G263300--Sobic009G194600 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic005G022400--Sobic008G023500 Sobic009G010800 Sobic009G010800 Sobic005G022400--Sobic009G010800 Sobic005G022400--Sobic007G072901 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic005G022400--Sobic003G245700 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic005G022400--Sobic007G152200 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic005G022400--Sobic005G189400 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic005G022400--Sobic004G330500 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic005G022400--Sobic006G185400 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic005G022400--Sobic006G090201 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic007G072901--Sobic004G351866 Sobic007G072901--Sobic008G023500 Sobic007G072901--Sobic005G189400 Sobic007G072901--Sobic006G090201 Sobic007G072901--Sobic003G245700 Sobic007G072901--Sobic004G330500 Sobic007G072901--Sobic006G185400 Sobic007G072901--Sobic007G152200 Sobic003G357000 Sobic003G357000 Sobic007G072901--Sobic003G357000 Sobic004G356600--Sobic006G090201 Sobic004G356600--Sobic007G072901 Sobic004G356600--Sobic009G010800 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic004G356600--Sobic001G361500 Sobic003G423100 Sobic003G423100 Sobic004G356600--Sobic003G423100 Sobic004G356600--Sobic003G357000 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic004G356600--Sobic009G164200 Sobic004G356600--Sobic006G185400 Sobic004G356600--Sobic003G245700 Sobic002G356700--Sobic009G233600 Sobic003G178200 Sobic003G178200 Sobic002G356700--Sobic003G178200 Sobic002G356700--Sobic003G245700 Sobic002G356700--Sobic006G090201 Sobic002G356700--Sobic005G022400 Sobic002G356700--Sobic001G361500 Sobic002G356700--Sobic008G023500 Sobic002G356700--Sobic009G164200 Sobic002G356700--Sobic007G072901 Sobic002G052500--Sobic007G072901 Sobic002G052500--Sobic003G245700 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic002G052500--Sobic003G343100 Sobic002G052500--Sobic008G023500 Sobic002G052500--Sobic006G090201 Sobic002G052500--Sobic006G185400 Sobic002G052500--Sobic009G010800 Sobic002G052500--Sobic003G178200 Sobic002G052500--Sobic004G330500 Sobic003G045800--Sobic008G023500 Sobic003G045800--Sobic007G072901 Sobic003G045800--Sobic007G152200 Sobic003G045800--Sobic005G189400 Sobic003G045800--Sobic009G164200 Sobic003G045800--Sobic004G351866 Sobic003G045800--Sobic004G330500 Sobic010G014600 Sobic010G014600 Sobic003G045800--Sobic010G014600 Sobic003G045800--Sobic006G185400 Sobic009G233600--Sobic002G356700 Sobic009G229100 Sobic009G229100 Sobic009G233600--Sobic009G229100 Sobic003G364700 Sobic003G364700 Sobic009G233600--Sobic003G364700 Sobic001G511200 Sobic001G511200 Sobic009G233600--Sobic001G511200 Sobic009G233600--Sobic004G356600 Sobic009G233600--Sobic005G022400 Sobic010G145200 Sobic010G145200 Sobic009G233600--Sobic010G145200 Sobic009G233600--Sobic003G178200 Sobic002G237700 Sobic002G237700 Sobic009G233600--Sobic002G237700 Sobic006G214101 Sobic006G214101 Sobic007G056400--Sobic006G214101 Sobic007G056400--Sobic010G014600 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic007G056400--Sobic005G106800 Sobic009G165050 Sobic009G165050 Sobic007G056400--Sobic009G165050 Sobic007G056400--Sobic007G072901 Sobic007G056400--Sobic003G357000 Sobic004G325766 Sobic004G325766 Sobic007G056400--Sobic004G325766 Sobic007G056400--Sobic004G351866 Sobic007G056400--Sobic005G189400 Sobic009G194600--Sobic003G343100 Sobic010G058650 Sobic010G058650 Sobic009G194600--Sobic010G058650 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic009G194600--Sobic010G275550 Sobic009G194600--Sobic003G245700 Sobic009G194600--Sobic006G185400 Sobic009G194600--Sobic004G330500 Sobic009G194600--Sobic007G152200 Sobic009G194600--Sobic005G189400 Sobic009G194600--Sobic008G023500
Octagon: transcription factors


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