Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G347200.1
Synonym Sb04g037390
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YT04
Pfam PF13483
Panther DB PTHR36142 PTHR36142:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G29700 : Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g44370.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025059
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G126550.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G166300 gibberellin 20 oxidase 2, putative, expressed -
2 Sobic.002G109300 white-brown complex homolog protein 11, putative, expressed -
3 Sobic.002G225400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@cytochrome P450, putative, expressed K09843: (+)-abscisic acid 8'-hydroxylase
4 Sobic.008G065050 - -
5 Sobic.007G069000 glyoxalase family protein, putative, expressed K01759: GLO1, lactoylglutathione lyase
6 Sobic.009G206300 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
7 Sobic.006G177400 amine oxidase, putative, expressed -
8 Sobic.007G108800 - -
9 Sobic.001G374500 - -
10 Sobic.010G012400 anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
11 Sobic.005G029900 strictosidine synthase, putative, expressed -
12 Sobic.006G084400 OsAPx7 - Stromal Ascorbate Peroxidase encoding gene 5,8, expressed K00434: L-ascorbate peroxidase
13 Sobic.009G185201 - -
14 Sobic.004G157550 - -
15 Sobic.004G157550 - -
16 Sobic.004G157550 - -
17 Sobic.002G278700 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@ribonuclease T2 family domain containing protein, expressed K01166: ribonuclease T2
18 Sobic.005G063800 expressed protein -
19 Sobic.002G278800 ribonuclease T2 family domain containing protein, expressed K01166: ribonuclease T2
20 Sobic.002G206600 class I glutamine amidotransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G347200 Sobic004G347200 Sobic001G166300 Sobic001G166300 Sobic004G347200--Sobic001G166300 Sobic002G109300 Sobic002G109300 Sobic004G347200--Sobic002G109300 Sobic002G225400 Sobic002G225400 Sobic004G347200--Sobic002G225400 Sobic008G065050 Sobic008G065050 Sobic004G347200--Sobic008G065050 Sobic007G069000 Sobic007G069000 Sobic004G347200--Sobic007G069000 Sobic009G206300 Sobic009G206300 Sobic004G347200--Sobic009G206300 Sobic006G177400 Sobic006G177400 Sobic004G347200--Sobic006G177400 Sobic007G108800 Sobic007G108800 Sobic004G347200--Sobic007G108800 Sobic001G374500 Sobic001G374500 Sobic004G347200--Sobic001G374500 Sobic009G185201 Sobic009G185201 Sobic001G166300--Sobic009G185201 Sobic001G166300--Sobic004G347200 Sobic008G065000 Sobic008G065000 Sobic001G166300--Sobic008G065000 Sobic001G033100 Sobic001G033100 Sobic001G166300--Sobic001G033100 Sobic001G166300--Sobic002G225400 Sobic008G064500 Sobic008G064500 Sobic001G166300--Sobic008G064500 Sobic001G166300--Sobic007G108800 Sobic003G022300 Sobic003G022300 Sobic001G166300--Sobic003G022300 Sobic006G084400 Sobic006G084400 Sobic001G166300--Sobic006G084400 Sobic002G109300--Sobic002G225400 Sobic002G109300--Sobic006G084400 Sobic010G077250 Sobic010G077250 Sobic002G109300--Sobic010G077250 Sobic002G109300--Sobic004G347200 Sobic003G375700 Sobic003G375700 Sobic002G109300--Sobic003G375700 Sobic007G123800 Sobic007G123800 Sobic002G109300--Sobic007G123800 Sobic002G109300--Sobic009G185201 Sobic002G338800 Sobic002G338800 Sobic002G109300--Sobic002G338800 Sobic002G109300--Sobic007G108800 Sobic002G225400--Sobic009G185201 Sobic002G225400--Sobic006G084400 Sobic002G225400--Sobic007G108800 Sobic002G225400--Sobic009G206300 Sobic005G038400 Sobic005G038400 Sobic002G225400--Sobic005G038400 Sobic010G259100 Sobic010G259100 Sobic002G225400--Sobic010G259100 Sobic002G225400--Sobic002G109300 Sobic002G225400--Sobic007G123800 Sobic002G225400--Sobic010G077250 Sobic008G065050--Sobic009G206300 Sobic004G157550 Sobic004G157550 Sobic008G065050--Sobic004G157550 Sobic010G012400 Sobic010G012400 Sobic008G065050--Sobic010G012400 Sobic002G311700 Sobic002G311700 Sobic008G065050--Sobic002G311700 Sobic005G222400 Sobic005G222400 Sobic008G065050--Sobic005G222400 Sobic002G278700 Sobic002G278700 Sobic008G065050--Sobic002G278700 Sobic008G065050--Sobic004G347200 Sobic004G338100 Sobic004G338100 Sobic007G069000--Sobic004G338100 Sobic007G069000--Sobic002G225400 Sobic007G069000--Sobic007G108800 Sobic001G500100 Sobic001G500100 Sobic007G069000--Sobic001G500100 Sobic009G245000 Sobic009G245000 Sobic007G069000--Sobic009G245000 Sobic007G069000--Sobic005G038400 Sobic001G057100 Sobic001G057100 Sobic007G069000--Sobic001G057100 Sobic003G035900 Sobic003G035900 Sobic007G069000--Sobic003G035900 Sobic007G069000--Sobic006G084400 Sobic009G206300--Sobic004G157550 Sobic009G206300--Sobic010G012400 Sobic009G206300--Sobic002G278700 Sobic008G030700 Sobic008G030700 Sobic009G206300--Sobic008G030700 Sobic001G249500 Sobic001G249500 Sobic009G206300--Sobic001G249500 Sobic002G278800 Sobic002G278800 Sobic009G206300--Sobic002G278800 Sobic003G131800 Sobic003G131800 Sobic009G206300--Sobic003G131800 Sobic003G050000 Sobic003G050000 Sobic006G177400--Sobic003G050000 Sobic010G015500 Sobic010G015500 Sobic006G177400--Sobic010G015500 Sobic008G019400 Sobic008G019400 Sobic006G177400--Sobic008G019400 Sobic002G206600 Sobic002G206600 Sobic006G177400--Sobic002G206600 Sobic001G434000 Sobic001G434000 Sobic006G177400--Sobic001G434000 Sobic003G106900 Sobic003G106900 Sobic006G177400--Sobic003G106900 Sobic001G018000 Sobic001G018000 Sobic006G177400--Sobic001G018000 Sobic007G046100 Sobic007G046100 Sobic006G177400--Sobic007G046100 Sobic002G213400 Sobic002G213400 Sobic006G177400--Sobic002G213400 Sobic007G108800--Sobic005G038400 Sobic007G108800--Sobic006G084400 Sobic007G108800--Sobic002G225400 Sobic007G108800--Sobic009G185201 Sobic007G108800--Sobic004G338100 Sobic007G108800--Sobic010G259100 Sobic007G108800--Sobic007G069000 Sobic007G108800--Sobic001G033100 Sobic007G108800--Sobic003G131800 Sobic003G403800 Sobic003G403800 Sobic001G374500--Sobic003G403800 Sobic001G439900 Sobic001G439900 Sobic001G374500--Sobic001G439900 Sobic008G044450 Sobic008G044450 Sobic001G374500--Sobic008G044450 Sobic006G068900 Sobic006G068900 Sobic001G374500--Sobic006G068900 Sobic002G211200 Sobic002G211200 Sobic001G374500--Sobic002G211200 Sobic004G028300 Sobic004G028300 Sobic001G374500--Sobic004G028300 Sobic006G140500 Sobic006G140500 Sobic001G374500--Sobic006G140500 Sobic004G154800 Sobic004G154800 Sobic001G374500--Sobic004G154800 Sobic001G172050 Sobic001G172050 Sobic001G374500--Sobic001G172050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.