Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G029900.1
Synonym Sb05g002520
Functional annotation strictosidine synthase, putative, expressed
UniProt C5Y473
Pfam PF03088
Panther DB PTHR10426 PTHR10426:SF22
NCBI CDD KOG1520; Predicted alkaloid synthase/Surface mucin Hemomucin
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016844; strictosidine synthase activity GO:0009058biosynthetic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G57030 : Calcium-dependent phosphotriesterase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g04424.2 : strictosidine synthase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033440
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G043200.8 , HORVU5Hr1G043200.4 , HORVU5Hr1G043200.5 , HORVU5Hr1G043200.7 , HORVU5Hr1G043200.1 , HORVU5Hr1G043200.2 , HORVU5Hr1G043200.3
Wheat TraesCS5A02G131200
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G029900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.009G169300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G029900 Sobic005G029900 Sobic008G142400 Sobic008G142400 Sobic005G029900--Sobic008G142400 Sobic007G111500 Sobic007G111500 Sobic005G029900--Sobic007G111500 Sobic002G036300 Sobic002G036300 Sobic005G029900--Sobic002G036300 Sobic005G150501 Sobic005G150501 Sobic005G029900--Sobic005G150501 Sobic002G430100 Sobic002G430100 Sobic005G029900--Sobic002G430100 Sobic008G128800 Sobic008G128800 Sobic005G029900--Sobic008G128800 Sobic001G079000 Sobic001G079000 Sobic005G029900--Sobic001G079000 Sobic001G387700 Sobic001G387700 Sobic005G029900--Sobic001G387700 Sobic008G065700 Sobic008G065700 Sobic005G029900--Sobic008G065700 Sobic002G311700 Sobic002G311700 Sobic008G142400--Sobic002G311700 Sobic002G052600 Sobic002G052600 Sobic008G142400--Sobic002G052600 Sobic001G531800 Sobic001G531800 Sobic008G142400--Sobic001G531800 Sobic004G235100 Sobic004G235100 Sobic008G142400--Sobic004G235100 Sobic007G122400 Sobic007G122400 Sobic008G142400--Sobic007G122400 Sobic006G253900 Sobic006G253900 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Octagon: transcription factors


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