Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G061950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PQG8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G392550 - -
2 Sobic.004G135600 - -
3 Sobic.004G102500 BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G063801 - -
5 Sobic.006G200100 expressed protein -
6 Sobic.010G133100 expressed protein K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
7 Sobic.006G134600 thaumatin, putative, expressed -
8 Sobic.001G398150 - -
9 Sobic.010G062700 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
10 Sobic.005G097201 - -
11 Sobic.005G162100 - -
12 Sobic.002G064100 DNA-binding storekeeper protein-related, putative, expressed -
13 Sobic.005G089800 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
14 Sobic.002G275000 LRP1, putative, expressed -
15 Sobic.010G169500 - -
16 Sobic.010G081300 expressed protein -
17 Sobic.003G377400 ANTH domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G080350 - -
19 Sobic.010G142132 - -
20 Sobic.003G255000 no apical meristem protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G061950 Sobic005G061950 Sobic002G392550 Sobic002G392550 Sobic005G061950--Sobic002G392550 Sobic004G135600 Sobic004G135600 Sobic005G061950--Sobic004G135600 Sobic004G102500 Sobic004G102500 Sobic005G061950--Sobic004G102500 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic005G061950--Sobic003G063801 Sobic006G200100 Sobic006G200100 Sobic005G061950--Sobic006G200100 Sobic010G133100 Sobic010G133100 Sobic005G061950--Sobic010G133100 Sobic006G134600 Sobic006G134600 Sobic005G061950--Sobic006G134600 Sobic001G398150 Sobic001G398150 Sobic005G061950--Sobic001G398150 Sobic010G062700 Sobic010G062700 Sobic005G061950--Sobic010G062700 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic002G392550--Sobic003G255000 Sobic002G392550--Sobic003G063801 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic002G392550--Sobic008G043000 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic002G392550--Sobic005G002350 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic002G392550--Sobic009G225250 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic002G392550--Sobic002G250700 Sobic002G064100 Sobic002G064100 Sobic002G392550--Sobic002G064100 Sobic002G392550--Sobic010G133100 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic002G392550--Sobic004G204700 Sobic004G135600--Sobic004G102500 Sobic005G162100 Sobic005G162100 Sobic004G135600--Sobic005G162100 Sobic004G135600--Sobic010G133100 Sobic002G354300 Sobic002G354300 Sobic004G135600--Sobic002G354300 Sobic010G169500 Sobic010G169500 Sobic004G135600--Sobic010G169500 Sobic008G043800 Sobic008G043800 Sobic004G135600--Sobic008G043800 Sobic004G135600--Sobic006G200100 Sobic004G135600--Sobic006G134600 Sobic004G135600--Sobic003G063801 Sobic004G102500--Sobic006G200100 Sobic004G102500--Sobic006G134600 Sobic004G102500--Sobic004G135600 Sobic005G089800 Sobic005G089800 Sobic004G102500--Sobic005G089800 Sobic004G102500--Sobic005G162100 Sobic004G102500--Sobic001G398150 Sobic004G102500--Sobic010G169500 Sobic007G176400 Sobic007G176400 Sobic004G102500--Sobic007G176400 Sobic004G102500--Sobic010G062700 Sobic003G063801--Sobic002G064100 Sobic010G142132 Sobic010G142132 Sobic003G063801--Sobic010G142132 Sobic003G063801--Sobic009G225250 Sobic002G146701 Sobic002G146701 Sobic003G063801--Sobic002G146701 Sobic003G063801--Sobic008G043000 Sobic003G063801--Sobic002G250700 Sobic003G063801--Sobic010G133100 Sobic003G063801--Sobic004G204700 Sobic003G063801--Sobic002G392550 Sobic006G200100--Sobic006G134600 Sobic006G200100--Sobic005G089800 Sobic006G200100--Sobic001G398150 Sobic006G200100--Sobic004G102500 Sobic010G115450 Sobic010G115450 Sobic006G200100--Sobic010G115450 Sobic006G200100--Sobic010G062700 Sobic006G200100--Sobic007G176400 Sobic006G200100--Sobic010G169500 Sobic006G200100--Sobic005G162100 Sobic010G133100--Sobic003G063801 Sobic010G133100--Sobic002G064100 Sobic010G133100--Sobic008G043000 Sobic010G133100--Sobic004G135600 Sobic010G133100--Sobic009G225250 Sobic004G196600 Sobic004G196600 Sobic010G133100--Sobic004G196600 Sobic010G133100--Sobic003G255000 Sobic010G133100--Sobic002G392550 Sobic010G133100--Sobic002G250700 Sobic006G134600--Sobic001G398150 Sobic006G134600--Sobic006G200100 Sobic006G134600--Sobic005G089800 Sobic006G134600--Sobic004G102500 Sobic006G134600--Sobic010G062700 Sobic006G134600--Sobic010G115450 Sobic006G134600--Sobic010G142132 Sobic005G067000 Sobic005G067000 Sobic006G134600--Sobic005G067000 Sobic006G134600--Sobic007G176400 Sobic001G398150--Sobic006G134600 Sobic001G398150--Sobic010G062700 Sobic001G398150--Sobic006G200100 Sobic001G398150--Sobic005G089800 Sobic001G398150--Sobic010G142132 Sobic001G398150--Sobic005G067000 Sobic001G398150--Sobic010G115450 Sobic006G176300 Sobic006G176300 Sobic001G398150--Sobic006G176300 Sobic007G221300 Sobic007G221300 Sobic001G398150--Sobic007G221300 Sobic010G062700--Sobic001G398150 Sobic010G062700--Sobic010G142132 Sobic010G062700--Sobic006G176300 Sobic010G062700--Sobic005G067000 Sobic010G062700--Sobic006G134600 Sobic010G062700--Sobic007G221300 Sobic005G207900 Sobic005G207900 Sobic010G062700--Sobic005G207900 Sobic009G128901 Sobic009G128901 Sobic010G062700--Sobic009G128901 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic010G062700--Sobic005G193900
Octagon: transcription factors


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