Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G076650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RH86
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G098098 - -
2 Sobic.007G016000 - -
3 Sobic.009G088401 - -
4 Sobic.004G043200 expressed protein -
5 Sobic.007G072400 phosphoribosyl transferase, putative, expressed -
6 Sobic.010G152700 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G119200 - -
8 Sobic.001G516200 expressed protein -
9 Sobic.006G273500 expressed protein -
10 Sobic.002G256500 expressed protein -
11 Sobic.004G180600 expressed protein K18172: COX assembly mitochondrial protein 2
12 Sobic.004G107400 expressed protein -
13 Sobic.004G109500 - -
14 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
15 Sobic.003G191800 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
16 Sobic.010G014900 expressed protein -
17 Sobic.001G137200 homeobox domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G000900 expressed protein -
19 Sobic.007G183000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I


Gene co-expression network
sample Sobic005G076650 Sobic005G076650 Sobic008G098098 Sobic008G098098 Sobic005G076650--Sobic008G098098 Sobic007G016000 Sobic007G016000 Sobic005G076650--Sobic007G016000 Sobic009G088401 Sobic009G088401 Sobic005G076650--Sobic009G088401 Sobic004G043200 Sobic004G043200 Sobic005G076650--Sobic004G043200 Sobic007G072400 Sobic007G072400 Sobic005G076650--Sobic007G072400 Sobic010G152700 Sobic010G152700 Sobic005G076650--Sobic010G152700 Sobic008G119200 Sobic008G119200 Sobic005G076650--Sobic008G119200 Sobic001G516200 Sobic001G516200 Sobic005G076650--Sobic001G516200 Sobic006G273500 Sobic006G273500 Sobic005G076650--Sobic006G273500 Sobic008G098098--Sobic008G119200 Sobic001G000900 Sobic001G000900 Sobic008G098098--Sobic001G000900 Sobic008G098098--Sobic006G273500 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic008G098098--Sobic009G223700 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic008G098098--Sobic005G231800 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic008G098098--Sobic004G226300 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic008G098098--Sobic007G183000 Sobic008G098098--Sobic009G088401 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic008G098098--Sobic001G527400 Sobic007G016000--Sobic008G098098 Sobic007G016000--Sobic009G088401 Sobic007G016000--Sobic008G119200 Sobic004G180600 Sobic004G180600 Sobic007G016000--Sobic004G180600 Sobic007G016000--Sobic007G072400 Sobic007G016000--Sobic010G152700 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic007G016000--Sobic003G173032 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic007G016000--Sobic006G171000 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic007G016000--Sobic008G023000 Sobic009G088401--Sobic008G023000 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic009G088401--Sobic005G209800 Sobic009G088401--Sobic006G171000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic009G088401--Sobic008G002100 Sobic009G088401--Sobic003G173032 Sobic009G088401--Sobic001G527400 Sobic009G088401--Sobic007G072400 Sobic009G088401--Sobic004G226300 Sobic009G088401--Sobic007G183000 Sobic004G043200--Sobic009G088401 Sobic004G107400 Sobic004G107400 Sobic004G043200--Sobic004G107400 Sobic010G014900 Sobic010G014900 Sobic004G043200--Sobic010G014900 Sobic004G043200--Sobic007G072400 Sobic003G390300 Sobic003G390300 Sobic004G043200--Sobic003G390300 Sobic004G043200--Sobic005G076650 Sobic007G158400 Sobic007G158400 Sobic004G043200--Sobic007G158400 Sobic009G028600 Sobic009G028600 Sobic004G043200--Sobic009G028600 Sobic004G109500 Sobic004G109500 Sobic004G043200--Sobic004G109500 Sobic007G072400--Sobic001G527400 Sobic007G072400--Sobic006G171000 Sobic007G072400--Sobic008G002100 Sobic007G072400--Sobic005G209800 Sobic007G072400--Sobic007G183000 Sobic007G072400--Sobic008G023000 Sobic007G072400--Sobic004G226300 Sobic007G072400--Sobic003G173032 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic007G072400--Sobic001G137200 Sobic010G152700--Sobic001G137200 Sobic010G152700--Sobic006G171000 Sobic010G152700--Sobic008G002100 Sobic010G152700--Sobic001G527400 Sobic010G152700--Sobic005G209800 Sobic010G152700--Sobic007G183000 Sobic010G152700--Sobic008G023000 Sobic010G152700--Sobic004G226300 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic010G152700--Sobic002G285525 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic008G119200--Sobic002G048250 Sobic008G119200--Sobic007G183000 Sobic008G119200--Sobic004G226300 Sobic008G119200--Sobic005G231800 Sobic008G119200--Sobic001G527400 Sobic008G119200--Sobic002G285525 Sobic008G119200--Sobic008G023000 Sobic008G119200--Sobic008G002100 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic008G119200--Sobic004G347866 Sobic003G191800 Sobic003G191800 Sobic001G516200--Sobic003G191800 Sobic005G102200 Sobic005G102200 Sobic001G516200--Sobic005G102200 Sobic001G516200--Sobic010G152700 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic001G516200--Sobic001G483700 Sobic001G516200--Sobic007G072400 Sobic001G516200--Sobic007G183000 Sobic001G516200--Sobic002G285525 Sobic001G516200--Sobic004G226300 Sobic007G139000 Sobic007G139000 Sobic001G516200--Sobic007G139000 Sobic006G273500--Sobic008G098098 Sobic006G273500--Sobic008G119200 Sobic006G273500--Sobic004G107400 Sobic006G273500--Sobic002G285525 Sobic006G273500--Sobic001G137200 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic006G273500--Sobic010G002850 Sobic006G273500--Sobic006G171000 Sobic006G273500--Sobic005G209800 Sobic006G273500--Sobic005G231800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.