Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G043200.2,Sobic.004G043200.3,Sobic.004G043200.1,Sobic.004G043200.4
Synonym Sb04g003720
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YMR3 , A0A194YMS6 , A0A194YMN6 , A0A1Z5RLQ2
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g45195.1,LOC_Os04g38260.1,LOC_Os04g38290.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045613
Brachypodium PNT73509 , PNT73508
Barley -
Wheat TraesCS3B02G477600 , TraesCS5A02G282000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G088401 - -
2 Sobic.004G107400 expressed protein -
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9 Sobic.004G109500 - -
10 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
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12 Sobic.007G208500 expressed protein -
13 Sobic.010G152700 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G285525 - -
15 Sobic.005G168500 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
16 Sobic.001G137200 homeobox domain containing protein, expressed -
17 Sobic.006G273500 expressed protein -
18 Sobic.001G527400 - -
19 Sobic.002G173600 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I


Gene co-expression network
sample Sobic004G043200 Sobic004G043200 Sobic009G088401 Sobic009G088401 Sobic004G043200--Sobic009G088401 Sobic004G107400 Sobic004G107400 Sobic004G043200--Sobic004G107400 Sobic010G014900 Sobic010G014900 Sobic004G043200--Sobic010G014900 Sobic007G072400 Sobic007G072400 Sobic004G043200--Sobic007G072400 Sobic003G390300 Sobic003G390300 Sobic004G043200--Sobic003G390300 Sobic005G076650 Sobic005G076650 Sobic004G043200--Sobic005G076650 Sobic007G158400 Sobic007G158400 Sobic004G043200--Sobic007G158400 Sobic009G028600 Sobic009G028600 Sobic004G043200--Sobic009G028600 Sobic004G109500 Sobic004G109500 Sobic004G043200--Sobic004G109500 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic009G088401--Sobic008G023000 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic009G088401--Sobic005G209800 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic009G088401--Sobic006G171000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic009G088401--Sobic008G002100 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic009G088401--Sobic003G173032 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic009G088401--Sobic001G527400 Sobic009G088401--Sobic007G072400 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic009G088401--Sobic004G226300 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic009G088401--Sobic007G183000 Sobic004G107400--Sobic006G171000 Sobic004G107400--Sobic010G014900 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic004G107400--Sobic001G137200 Sobic004G107400--Sobic003G390300 Sobic004G107400--Sobic005G209800 Sobic002G078850 Sobic002G078850 Sobic004G107400--Sobic002G078850 Sobic003G104900 Sobic003G104900 Sobic004G107400--Sobic003G104900 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic004G107400--Sobic005G231800 Sobic004G107400--Sobic008G002100 Sobic010G014900--Sobic007G158400 Sobic010G014900--Sobic004G107400 Sobic010G014900--Sobic001G137200 Sobic010G014900--Sobic006G171000 Sobic010G014900--Sobic009G028600 Sobic010G014900--Sobic005G231800 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic010G014900--Sobic002G285525 Sobic010G014900--Sobic004G226300 Sobic010G014900--Sobic001G527400 Sobic007G072400--Sobic001G527400 Sobic007G072400--Sobic006G171000 Sobic007G072400--Sobic008G002100 Sobic007G072400--Sobic005G209800 Sobic007G072400--Sobic007G183000 Sobic007G072400--Sobic008G023000 Sobic007G072400--Sobic004G226300 Sobic007G072400--Sobic003G173032 Sobic007G072400--Sobic001G137200 Sobic003G390300--Sobic004G107400 Sobic004G061600 Sobic004G061600 Sobic003G390300--Sobic004G061600 Sobic008G136900 Sobic008G136900 Sobic003G390300--Sobic008G136900 Sobic001G062700 Sobic001G062700 Sobic003G390300--Sobic001G062700 Sobic003G390300--Sobic003G104900 Sobic003G390300--Sobic010G014900 Sobic003G390300--Sobic007G158400 Sobic003G390300--Sobic001G137200 Sobic003G390300--Sobic009G028600 Sobic008G098098 Sobic008G098098 Sobic005G076650--Sobic008G098098 Sobic007G016000 Sobic007G016000 Sobic005G076650--Sobic007G016000 Sobic005G076650--Sobic009G088401 Sobic005G076650--Sobic004G043200 Sobic005G076650--Sobic007G072400 Sobic010G152700 Sobic010G152700 Sobic005G076650--Sobic010G152700 Sobic008G119200 Sobic008G119200 Sobic005G076650--Sobic008G119200 Sobic001G516200 Sobic001G516200 Sobic005G076650--Sobic001G516200 Sobic006G273500 Sobic006G273500 Sobic005G076650--Sobic006G273500 Sobic007G158400--Sobic010G014900 Sobic007G158400--Sobic004G107400 Sobic007G158400--Sobic001G137200 Sobic007G158400--Sobic006G171000 Sobic007G158400--Sobic004G061600 Sobic007G158400--Sobic009G028600 Sobic005G168500 Sobic005G168500 Sobic007G158400--Sobic005G168500 Sobic007G158400--Sobic005G231800 Sobic003G006500 Sobic003G006500 Sobic007G158400--Sobic003G006500 Sobic009G028600--Sobic006G171000 Sobic009G028600--Sobic004G226300 Sobic009G028600--Sobic007G183000 Sobic009G028600--Sobic002G285525 Sobic009G028600--Sobic001G527400 Sobic009G028600--Sobic005G231800 Sobic009G028600--Sobic001G137200 Sobic009G028600--Sobic008G023000 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic009G028600--Sobic002G048250 Sobic004G109500--Sobic009G088401 Sobic004G109500--Sobic007G072400 Sobic004G180600 Sobic004G180600 Sobic004G109500--Sobic004G180600 Sobic004G109500--Sobic004G043200 Sobic004G109500--Sobic007G016000 Sobic004G109500--Sobic007G158400 Sobic004G109500--Sobic005G076650 Sobic004G109500--Sobic004G061600 Sobic004G109500--Sobic004G107400
Octagon: transcription factors


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