Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G088800.1
Synonym Sb05g007250
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RHM9
Pfam -
Panther DB PTHR31509 PTHR31509:SF18
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g13710.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029531
Brachypodium KQJ88838
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G108950 - -
2 Sobic.005G064900 cytochrome P450, putative, expressed -
3 Sobic.007G156800 "SGL1(Ortholog in rice:Nakagawa et al., 2012)"(PubMedID : 31659907)@expressed protein -
4 Sobic.007G038500 aquaporin protein, putative, expressed K09874: aquaporin NIP
5 Sobic.004G108800 cytochrome P450, putative, expressed -
6 Sobic.004G156250 - -
7 Sobic.004G034200 STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 1 precursor, putative, expressed -
8 Sobic.001G131001 - -
9 Sobic.006G212350 - -
10 Sobic.005G088700 expressed protein -
11 Sobic.002G082700 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.005G149600 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@cytochrome P450, putative, expressed -
13 Sobic.005G089200 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
14 Sobic.003G015200 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
15 Sobic.001G464300 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G038600 monodehydroascorbate reductase, putative, expressed K08232: monodehydroascorbate reductase (NADH)
17 Sobic.004G161200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@protein binding protein, putative, expressed K19042: E3 ubiquitin-protein ligase BOI and related proteins
18 Sobic.001G026300 sex determination protein tasselseed-2, putative, expressed -
19 Sobic.009G015500 - -
20 Sobic.009G015166 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G088800 Sobic005G088800 Sobic008G108950 Sobic008G108950 Sobic005G088800--Sobic008G108950 Sobic005G064900 Sobic005G064900 Sobic005G088800--Sobic005G064900 Sobic007G156800 Sobic007G156800 Sobic005G088800--Sobic007G156800 Sobic007G038500 Sobic007G038500 Sobic005G088800--Sobic007G038500 Sobic004G108800 Sobic004G108800 Sobic005G088800--Sobic004G108800 Sobic004G156250 Sobic004G156250 Sobic005G088800--Sobic004G156250 Sobic004G034200 Sobic004G034200 Sobic005G088800--Sobic004G034200 Sobic001G131001 Sobic001G131001 Sobic005G088800--Sobic001G131001 Sobic006G212350 Sobic006G212350 Sobic005G088800--Sobic006G212350 Sobic008G108950--Sobic007G156800 Sobic008G108950--Sobic005G064900 Sobic008G108950--Sobic004G108800 Sobic003G015200 Sobic003G015200 Sobic008G108950--Sobic003G015200 Sobic005G088700 Sobic005G088700 Sobic008G108950--Sobic005G088700 Sobic009G015500 Sobic009G015500 Sobic008G108950--Sobic009G015500 Sobic007G058600 Sobic007G058600 Sobic008G108950--Sobic007G058600 Sobic008G108950--Sobic007G038500 Sobic001G323600 Sobic001G323600 Sobic008G108950--Sobic001G323600 Sobic005G064900--Sobic007G058600 Sobic005G064900--Sobic007G156800 Sobic005G064900--Sobic009G015500 Sobic005G064900--Sobic003G015200 Sobic005G064900--Sobic005G088700 Sobic005G064900--Sobic008G108950 Sobic005G064900--Sobic001G323600 Sobic005G064900--Sobic004G108800 Sobic001G373600 Sobic001G373600 Sobic005G064900--Sobic001G373600 Sobic007G156800--Sobic004G108800 Sobic007G156800--Sobic005G064900 Sobic007G156800--Sobic003G015200 Sobic007G156800--Sobic008G108950 Sobic007G156800--Sobic005G088700 Sobic007G156800--Sobic007G038500 Sobic005G089200 Sobic005G089200 Sobic007G156800--Sobic005G089200 Sobic005G149600 Sobic005G149600 Sobic007G156800--Sobic005G149600 Sobic007G156800--Sobic009G015500 Sobic007G038500--Sobic004G108800 Sobic007G038500--Sobic007G156800 Sobic009G015166 Sobic009G015166 Sobic007G038500--Sobic009G015166 Sobic007G038500--Sobic008G108950 Sobic007G038500--Sobic005G064900 Sobic007G038500--Sobic004G156250 Sobic007G038500--Sobic005G149600 Sobic007G038500--Sobic005G089200 Sobic007G038500--Sobic003G015200 Sobic004G108800--Sobic005G149600 Sobic004G108800--Sobic005G089200 Sobic004G108800--Sobic007G156800 Sobic006G117500 Sobic006G117500 Sobic004G108800--Sobic006G117500 Sobic004G108800--Sobic004G156250 Sobic004G108800--Sobic003G015200 Sobic004G108800--Sobic009G015166 Sobic005G152500 Sobic005G152500 Sobic004G108800--Sobic005G152500 Sobic004G108800--Sobic007G038500 Sobic004G156250--Sobic004G108800 Sobic005G104200 Sobic005G104200 Sobic004G156250--Sobic005G104200 Sobic001G238500 Sobic001G238500 Sobic004G156250--Sobic001G238500 Sobic004G156250--Sobic005G149600 Sobic004G156250--Sobic001G131001 Sobic004G126500 Sobic004G126500 Sobic004G156250--Sobic004G126500 Sobic004G156250--Sobic009G015166 Sobic004G156250--Sobic006G117500 Sobic004G156250--Sobic005G089200 Sobic004G034200--Sobic005G089200 Sobic004G034200--Sobic005G149600 Sobic001G026300 Sobic001G026300 Sobic004G034200--Sobic001G026300 Sobic004G034200--Sobic004G108800 Sobic004G034200--Sobic007G156800 Sobic004G034200--Sobic003G015200 Sobic008G091557 Sobic008G091557 Sobic004G034200--Sobic008G091557 Sobic004G034200--Sobic001G131001 Sobic007G038600 Sobic007G038600 Sobic004G034200--Sobic007G038600 Sobic001G131001--Sobic004G156250 Sobic001G131001--Sobic005G104200 Sobic001G131001--Sobic001G238500 Sobic001G348800 Sobic001G348800 Sobic001G131001--Sobic001G348800 Sobic008G133000 Sobic008G133000 Sobic001G131001--Sobic008G133000 Sobic001G131001--Sobic004G126500 Sobic001G464300 Sobic001G464300 Sobic001G131001--Sobic001G464300 Sobic005G115300 Sobic005G115300 Sobic001G131001--Sobic005G115300 Sobic001G131001--Sobic006G117500 Sobic002G082700 Sobic002G082700 Sobic006G212350--Sobic002G082700 Sobic009G096300 Sobic009G096300 Sobic006G212350--Sobic009G096300 Sobic002G391200 Sobic002G391200 Sobic006G212350--Sobic002G391200 Sobic010G174100 Sobic010G174100 Sobic006G212350--Sobic010G174100 Sobic006G212350--Sobic001G464300 Sobic010G021700 Sobic010G021700 Sobic006G212350--Sobic010G021700 Sobic001G301400 Sobic001G301400 Sobic006G212350--Sobic001G301400 Sobic006G171300 Sobic006G171300 Sobic006G212350--Sobic006G171300 Sobic002G307900 Sobic002G307900 Sobic006G212350--Sobic002G307900
Octagon: transcription factors


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