Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G156800.1
Synonym Sb07g023040
Functional annotation "SGL1(Ortholog in rice:Nakagawa et al., 2012)" (PubMedID : 31659907)
expressed protein
UniProt C5YMB1
Pfam -
Panther DB PTHR31722 PTHR31722:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G34419 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g52490.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047258 , Zm00025a005427
Brachypodium KQJ98627 , PNT64722
Barley HORVU5Hr1G068550.4 , HORVU5Hr1G068550.3 , HORVU5Hr1G068550.1
Wheat TraesCS5B02G237800 , TraesCS5A02G239200 , TraesCS5D02G246300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G108800 cytochrome P450, putative, expressed -
2 Sobic.005G064900 cytochrome P450, putative, expressed -
3 Sobic.003G015200 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
4 Sobic.008G108950 - -
5 Sobic.005G088700 expressed protein -
6 Sobic.007G038500 aquaporin protein, putative, expressed K09874: aquaporin NIP
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9 Sobic.009G015500 - -
10 Sobic.007G058600 O-methyltransferase, putative, expressed K13066: E2.1.1.68, caffeic acid 3-O-methyltransferase
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12 Sobic.004G034200 STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 1 precursor, putative, expressed -
13 Sobic.005G152500 - -
14 Sobic.001G323600 transporter family protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G070750 - -
16 Sobic.001G373600 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
17 Sobic.009G158600 - -
18 Sobic.003G024600 CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.7 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
19 Sobic.004G156250 - -
20 Sobic.007G164500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G156800 Sobic007G156800 Sobic004G108800 Sobic004G108800 Sobic007G156800--Sobic004G108800 Sobic005G064900 Sobic005G064900 Sobic007G156800--Sobic005G064900 Sobic003G015200 Sobic003G015200 Sobic007G156800--Sobic003G015200 Sobic008G108950 Sobic008G108950 Sobic007G156800--Sobic008G108950 Sobic005G088700 Sobic005G088700 Sobic007G156800--Sobic005G088700 Sobic007G038500 Sobic007G038500 Sobic007G156800--Sobic007G038500 Sobic005G089200 Sobic005G089200 Sobic007G156800--Sobic005G089200 Sobic005G149600 Sobic005G149600 Sobic007G156800--Sobic005G149600 Sobic009G015500 Sobic009G015500 Sobic007G156800--Sobic009G015500 Sobic004G108800--Sobic005G149600 Sobic004G108800--Sobic005G089200 Sobic004G108800--Sobic007G156800 Sobic006G117500 Sobic006G117500 Sobic004G108800--Sobic006G117500 Sobic004G156250 Sobic004G156250 Sobic004G108800--Sobic004G156250 Sobic004G108800--Sobic003G015200 Sobic009G015166 Sobic009G015166 Sobic004G108800--Sobic009G015166 Sobic005G152500 Sobic005G152500 Sobic004G108800--Sobic005G152500 Sobic004G108800--Sobic007G038500 Sobic007G058600 Sobic007G058600 Sobic005G064900--Sobic007G058600 Sobic005G064900--Sobic007G156800 Sobic005G064900--Sobic009G015500 Sobic005G064900--Sobic003G015200 Sobic005G064900--Sobic005G088700 Sobic005G064900--Sobic008G108950 Sobic001G323600 Sobic001G323600 Sobic005G064900--Sobic001G323600 Sobic005G064900--Sobic004G108800 Sobic001G373600 Sobic001G373600 Sobic005G064900--Sobic001G373600 Sobic003G015200--Sobic007G058600 Sobic003G015200--Sobic004G108800 Sobic003G015200--Sobic005G064900 Sobic003G015200--Sobic009G015500 Sobic003G015200--Sobic005G149600 Sobic003G015200--Sobic007G156800 Sobic003G015200--Sobic005G152500 Sobic003G015200--Sobic005G089200 Sobic009G006500 Sobic009G006500 Sobic003G015200--Sobic009G006500 Sobic008G108950--Sobic007G156800 Sobic008G108950--Sobic005G064900 Sobic008G108950--Sobic004G108800 Sobic008G108950--Sobic003G015200 Sobic008G108950--Sobic005G088700 Sobic008G108950--Sobic009G015500 Sobic008G108950--Sobic007G058600 Sobic008G108950--Sobic007G038500 Sobic008G108950--Sobic001G323600 Sobic005G088700--Sobic001G323600 Sobic005G088700--Sobic001G373600 Sobic003G024600 Sobic003G024600 Sobic005G088700--Sobic003G024600 Sobic007G164500 Sobic007G164500 Sobic005G088700--Sobic007G164500 Sobic001G466450 Sobic001G466450 Sobic005G088700--Sobic001G466450 Sobic007G038500--Sobic004G108800 Sobic007G038500--Sobic007G156800 Sobic007G038500--Sobic009G015166 Sobic007G038500--Sobic008G108950 Sobic007G038500--Sobic005G064900 Sobic007G038500--Sobic004G156250 Sobic007G038500--Sobic005G149600 Sobic007G038500--Sobic005G089200 Sobic007G038500--Sobic003G015200 Sobic005G089200--Sobic005G149600 Sobic005G089200--Sobic004G108800 Sobic001G026300 Sobic001G026300 Sobic005G089200--Sobic001G026300 Sobic005G089200--Sobic005G152500 Sobic005G089200--Sobic003G015200 Sobic005G089200--Sobic006G117500 Sobic010G170300 Sobic010G170300 Sobic005G089200--Sobic010G170300 Sobic005G089200--Sobic007G156800 Sobic004G034200 Sobic004G034200 Sobic005G089200--Sobic004G034200 Sobic005G149600--Sobic005G089200 Sobic005G149600--Sobic004G108800 Sobic005G149600--Sobic001G026300 Sobic005G149600--Sobic003G015200 Sobic005G149600--Sobic006G117500 Sobic005G149600--Sobic004G156250 Sobic005G149600--Sobic005G152500 Sobic005G149600--Sobic007G156800 Sobic005G149600--Sobic004G034200 Sobic009G015500--Sobic007G058600 Sobic009G015500--Sobic001G323600 Sobic010G070750 Sobic010G070750 Sobic009G015500--Sobic010G070750 Sobic004G308300 Sobic004G308300 Sobic009G015500--Sobic004G308300 Sobic009G015500--Sobic005G088700 Sobic009G158600 Sobic009G158600 Sobic009G015500--Sobic009G158600 Sobic009G015500--Sobic003G024600 Sobic009G015500--Sobic007G164500 Sobic009G015500--Sobic001G373600
Octagon: transcription factors


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