Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G152500.1
Synonym SYD, CHR3
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PSP2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G28290 : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015744
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G015200 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
2 Sobic.005G089200 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
3 Sobic.004G108800 cytochrome P450, putative, expressed -
4 Sobic.005G149600 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@cytochrome P450, putative, expressed -
5 Sobic.006G117500 polygalacturonase inhibitor 1 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.007G156800 "SGL1(Ortholog in rice:Nakagawa et al., 2012)"(PubMedID : 31659907)@expressed protein -
7 Sobic.010G170300 Os9bglu31 - beta-glucosidase, dhurrinase, similar to G. max hydroxyisourate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
8 Sobic.009G015166 - -
9 Sobic.007G058600 O-methyltransferase, putative, expressed K13066: E2.1.1.68, caffeic acid 3-O-methyltransferase
10 Sobic.008G108950 - -
11 Sobic.010G070750 - -
12 Sobic.009G006500 integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed -
13 Sobic.009G015500 - -
14 Sobic.007G038500 aquaporin protein, putative, expressed K09874: aquaporin NIP
15 Sobic.004G034200 STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 1 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.002G107400 aldehyde oxidase, putative, expressed -
17 Sobic.005G064900 cytochrome P450, putative, expressed -
18 Sobic.005G066000 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.005G107500 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
20 Sobic.005G088700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G152500 Sobic005G152500 Sobic003G015200 Sobic003G015200 Sobic005G152500--Sobic003G015200 Sobic005G089200 Sobic005G089200 Sobic005G152500--Sobic005G089200 Sobic004G108800 Sobic004G108800 Sobic005G152500--Sobic004G108800 Sobic005G149600 Sobic005G149600 Sobic005G152500--Sobic005G149600 Sobic006G117500 Sobic006G117500 Sobic005G152500--Sobic006G117500 Sobic007G156800 Sobic007G156800 Sobic005G152500--Sobic007G156800 Sobic010G170300 Sobic010G170300 Sobic005G152500--Sobic010G170300 Sobic009G015166 Sobic009G015166 Sobic005G152500--Sobic009G015166 Sobic007G058600 Sobic007G058600 Sobic005G152500--Sobic007G058600 Sobic003G015200--Sobic007G058600 Sobic003G015200--Sobic004G108800 Sobic005G064900 Sobic005G064900 Sobic003G015200--Sobic005G064900 Sobic009G015500 Sobic009G015500 Sobic003G015200--Sobic009G015500 Sobic003G015200--Sobic005G149600 Sobic003G015200--Sobic007G156800 Sobic003G015200--Sobic005G152500 Sobic003G015200--Sobic005G089200 Sobic009G006500 Sobic009G006500 Sobic003G015200--Sobic009G006500 Sobic005G089200--Sobic005G149600 Sobic005G089200--Sobic004G108800 Sobic001G026300 Sobic001G026300 Sobic005G089200--Sobic001G026300 Sobic005G089200--Sobic005G152500 Sobic005G089200--Sobic003G015200 Sobic005G089200--Sobic006G117500 Sobic005G089200--Sobic010G170300 Sobic005G089200--Sobic007G156800 Sobic004G034200 Sobic004G034200 Sobic005G089200--Sobic004G034200 Sobic004G108800--Sobic005G149600 Sobic004G108800--Sobic005G089200 Sobic004G108800--Sobic007G156800 Sobic004G108800--Sobic006G117500 Sobic004G156250 Sobic004G156250 Sobic004G108800--Sobic004G156250 Sobic004G108800--Sobic003G015200 Sobic004G108800--Sobic009G015166 Sobic004G108800--Sobic005G152500 Sobic007G038500 Sobic007G038500 Sobic004G108800--Sobic007G038500 Sobic005G149600--Sobic005G089200 Sobic005G149600--Sobic004G108800 Sobic005G149600--Sobic001G026300 Sobic005G149600--Sobic003G015200 Sobic005G149600--Sobic006G117500 Sobic005G149600--Sobic004G156250 Sobic005G149600--Sobic005G152500 Sobic005G149600--Sobic007G156800 Sobic005G149600--Sobic004G034200 Sobic005G104200 Sobic005G104200 Sobic006G117500--Sobic005G104200 Sobic010G274400 Sobic010G274400 Sobic006G117500--Sobic010G274400 Sobic006G117500--Sobic004G108800 Sobic001G506600 Sobic001G506600 Sobic006G117500--Sobic001G506600 Sobic006G117500--Sobic009G015166 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic006G117500--Sobic005G066300 Sobic010G096700 Sobic010G096700 Sobic006G117500--Sobic010G096700 Sobic006G205500 Sobic006G205500 Sobic006G117500--Sobic006G205500 Sobic002G163200 Sobic002G163200 Sobic006G117500--Sobic002G163200 Sobic007G156800--Sobic004G108800 Sobic007G156800--Sobic005G064900 Sobic007G156800--Sobic003G015200 Sobic008G108950 Sobic008G108950 Sobic007G156800--Sobic008G108950 Sobic005G088700 Sobic005G088700 Sobic007G156800--Sobic005G088700 Sobic007G156800--Sobic007G038500 Sobic007G156800--Sobic005G089200 Sobic007G156800--Sobic005G149600 Sobic007G156800--Sobic009G015500 Sobic010G170300--Sobic005G089200 Sobic002G107400 Sobic002G107400 Sobic010G170300--Sobic002G107400 Sobic010G170300--Sobic005G149600 Sobic010G170300--Sobic003G015200 Sobic010G170300--Sobic001G026300 Sobic010G170300--Sobic005G152500 Sobic004G126700 Sobic004G126700 Sobic010G170300--Sobic004G126700 Sobic010G170300--Sobic006G117500 Sobic003G287200 Sobic003G287200 Sobic010G170300--Sobic003G287200 Sobic001G238500 Sobic001G238500 Sobic009G015166--Sobic001G238500 Sobic009G015166--Sobic006G117500 Sobic009G015166--Sobic005G066300 Sobic009G015166--Sobic004G108800 Sobic009G015166--Sobic005G104200 Sobic004G126500 Sobic004G126500 Sobic009G015166--Sobic004G126500 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic009G015166--Sobic002G411000 Sobic009G015166--Sobic004G156250 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic009G015166--Sobic006G009700 Sobic007G058600--Sobic009G015500 Sobic007G058600--Sobic003G015200 Sobic007G058600--Sobic005G064900 Sobic001G323600 Sobic001G323600 Sobic007G058600--Sobic001G323600 Sobic006G142000 Sobic006G142000 Sobic007G058600--Sobic006G142000 Sobic007G058600--Sobic005G088700 Sobic003G024600 Sobic003G024600 Sobic007G058600--Sobic003G024600 Sobic001G373600 Sobic001G373600 Sobic007G058600--Sobic001G373600 Sobic007G164500 Sobic007G164500 Sobic007G058600--Sobic007G164500
Octagon: transcription factors


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