Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G066000.1
Synonym Sb05g005560
Functional annotation glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed
UniProt C5Y6J6
Pfam -
Panther DB PTHR33548 PTHR33548:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g31640.1 : glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012780 , Zm00025a012777 , Zm00025a012766 , Zm00025a012769 , Zm00025a012779
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G172500 ATCHX, putative, expressed -
2 Sobic.005G149600 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@cytochrome P450, putative, expressed -
3 Sobic.006G074200 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@"uncharacterized lipid transporters, up-regulated under drought stress, mapped into a QTL involved in stay green (QSTG18_3)"(PubMedID : 24655390)@LTPL102 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
4 Sobic.002G163200 - -
5 Sobic.006G117500 polygalacturonase inhibitor 1 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.003G287200 WRKY23, expressed -
7 Sobic.003G015200 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
8 Sobic.001G212451 - -
9 Sobic.006G183900 cytochrome P450, putative, expressed -
10 Sobic.006G003601 - -
11 Sobic.001G026300 sex determination protein tasselseed-2, putative, expressed -
12 Sobic.002G365600 igA FC receptor precursor, putative, expressed -
13 Sobic.010G274400 reticuline oxidase-like protein precursor, putative, expressed -
14 Sobic.004G108800 cytochrome P450, putative, expressed -
15 Sobic.004G283900 cytochrome P450, putative, expressed -
16 Sobic.005G089200 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
17 Sobic.010G170300 Os9bglu31 - beta-glucosidase, dhurrinase, similar to G. max hydroxyisourate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
18 Sobic.005G152500 - -
19 Sobic.004G248500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.001G464300 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G066000 Sobic005G066000 Sobic008G172500 Sobic008G172500 Sobic005G066000--Sobic008G172500 Sobic005G149600 Sobic005G149600 Sobic005G066000--Sobic005G149600 Sobic006G074200 Sobic006G074200 Sobic005G066000--Sobic006G074200 Sobic002G163200 Sobic002G163200 Sobic005G066000--Sobic002G163200 Sobic006G117500 Sobic006G117500 Sobic005G066000--Sobic006G117500 Sobic003G287200 Sobic003G287200 Sobic005G066000--Sobic003G287200 Sobic003G015200 Sobic003G015200 Sobic005G066000--Sobic003G015200 Sobic001G212451 Sobic001G212451 Sobic005G066000--Sobic001G212451 Sobic006G183900 Sobic006G183900 Sobic005G066000--Sobic006G183900 Sobic002G365600 Sobic002G365600 Sobic008G172500--Sobic002G365600 Sobic003G269500 Sobic003G269500 Sobic008G172500--Sobic003G269500 Sobic008G172500--Sobic005G066000 Sobic002G365550 Sobic002G365550 Sobic008G172500--Sobic002G365550 Sobic008G172500--Sobic006G074200 Sobic009G073800 Sobic009G073800 Sobic008G172500--Sobic009G073800 Sobic009G109000 Sobic009G109000 Sobic008G172500--Sobic009G109000 Sobic001G364400 Sobic001G364400 Sobic008G172500--Sobic001G364400 Sobic002G365500 Sobic002G365500 Sobic008G172500--Sobic002G365500 Sobic005G089200 Sobic005G089200 Sobic005G149600--Sobic005G089200 Sobic004G108800 Sobic004G108800 Sobic005G149600--Sobic004G108800 Sobic001G026300 Sobic001G026300 Sobic005G149600--Sobic001G026300 Sobic005G149600--Sobic003G015200 Sobic005G149600--Sobic006G117500 Sobic004G156250 Sobic004G156250 Sobic005G149600--Sobic004G156250 Sobic005G152500 Sobic005G152500 Sobic005G149600--Sobic005G152500 Sobic007G156800 Sobic007G156800 Sobic005G149600--Sobic007G156800 Sobic004G034200 Sobic004G034200 Sobic005G149600--Sobic004G034200 Sobic006G074200--Sobic001G364400 Sobic007G170300 Sobic007G170300 Sobic006G074200--Sobic007G170300 Sobic006G074200--Sobic005G066000 Sobic006G074200--Sobic006G183900 Sobic006G074200--Sobic003G287200 Sobic006G074200--Sobic008G172500 Sobic006G074200--Sobic002G365500 Sobic006G074200--Sobic002G365600 Sobic010G110800 Sobic010G110800 Sobic006G074200--Sobic010G110800 Sobic002G163200--Sobic006G117500 Sobic001G503000 Sobic001G503000 Sobic002G163200--Sobic001G503000 Sobic005G115300 Sobic005G115300 Sobic002G163200--Sobic005G115300 Sobic001G238500 Sobic001G238500 Sobic002G163200--Sobic001G238500 Sobic005G104200 Sobic005G104200 Sobic002G163200--Sobic005G104200 Sobic002G163200--Sobic003G287200 Sobic001G506600 Sobic001G506600 Sobic002G163200--Sobic001G506600 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic002G163200--Sobic005G066300 Sobic002G163200--Sobic004G108800 Sobic006G117500--Sobic005G104200 Sobic010G274400 Sobic010G274400 Sobic006G117500--Sobic010G274400 Sobic006G117500--Sobic004G108800 Sobic006G117500--Sobic001G506600 Sobic009G015166 Sobic009G015166 Sobic006G117500--Sobic009G015166 Sobic006G117500--Sobic005G066300 Sobic010G096700 Sobic010G096700 Sobic006G117500--Sobic010G096700 Sobic006G205500 Sobic006G205500 Sobic006G117500--Sobic006G205500 Sobic006G117500--Sobic002G163200 Sobic003G287200--Sobic006G183900 Sobic006G229100 Sobic006G229100 Sobic003G287200--Sobic006G229100 Sobic001G002800 Sobic001G002800 Sobic003G287200--Sobic001G002800 Sobic001G360500 Sobic001G360500 Sobic003G287200--Sobic001G360500 Sobic003G287200--Sobic001G503000 Sobic007G090472 Sobic007G090472 Sobic003G287200--Sobic007G090472 Sobic003G287200--Sobic010G096700 Sobic003G287200--Sobic007G170300 Sobic003G287200--Sobic006G117500 Sobic007G058600 Sobic007G058600 Sobic003G015200--Sobic007G058600 Sobic003G015200--Sobic004G108800 Sobic005G064900 Sobic005G064900 Sobic003G015200--Sobic005G064900 Sobic009G015500 Sobic009G015500 Sobic003G015200--Sobic009G015500 Sobic003G015200--Sobic005G149600 Sobic003G015200--Sobic007G156800 Sobic003G015200--Sobic005G152500 Sobic003G015200--Sobic005G089200 Sobic009G006500 Sobic009G006500 Sobic003G015200--Sobic009G006500 Sobic001G464300 Sobic001G464300 Sobic001G212451--Sobic001G464300 Sobic004G248500 Sobic004G248500 Sobic001G212451--Sobic004G248500 Sobic002G391200 Sobic002G391200 Sobic001G212451--Sobic002G391200 Sobic010G021700 Sobic010G021700 Sobic001G212451--Sobic010G021700 Sobic005G097600 Sobic005G097600 Sobic001G212451--Sobic005G097600 Sobic007G109600 Sobic007G109600 Sobic001G212451--Sobic007G109600 Sobic002G307900 Sobic002G307900 Sobic001G212451--Sobic002G307900 Sobic005G036900 Sobic005G036900 Sobic001G212451--Sobic005G036900 Sobic001G301400 Sobic001G301400 Sobic001G212451--Sobic001G301400 Sobic006G183900--Sobic003G287200 Sobic006G183900--Sobic007G109600 Sobic006G028400 Sobic006G028400 Sobic006G183900--Sobic006G028400 Sobic006G183900--Sobic007G090472 Sobic008G034700 Sobic008G034700 Sobic006G183900--Sobic008G034700 Sobic006G183900--Sobic004G248500 Sobic006G183900--Sobic007G170300 Sobic006G183900--Sobic002G365600 Sobic006G183900--Sobic002G365500
Octagon: transcription factors


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