Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G094600.1
Synonym Sb05g008200
Functional annotation DUF581 domain containing protein, expressed
UniProt C5Y1I9
Pfam PF04570
Panther DB PTHR33059 PTHR33059:SF31
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G17670 : Protein of unknown function (DUF581)
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g46190.1 : DUF581 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056704 , Zm00025a032349
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G066610.2 , HORVU6Hr1G066610.1 , HORVU6Hr1G066610.3
Wheat TraesCS6B02G289300 , TraesCS6D02G242700 , TraesCS6A02G262000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G014000 O-methyltransferase, putative, expressed -
2 Sobic.009G198350 - -
3 Sobic.001G261464 - -
4 Sobic.007G048400 berberine and berberine like domain containing protein, expressed -
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8 Sobic.004G243700 - -
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10 Sobic.005G048100 - -
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12 Sobic.005G110469 - -
13 Sobic.003G126750 - -
14 Sobic.005G031901 - -
15 Sobic.006G109600 - -
16 Sobic.010G147300 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
17 Sobic.006G236900 gibberellin 20 oxidase 2, putative, expressed -
18 Sobic.002G026150 - -
19 Sobic.001G349200 sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase, decarboxylating, putative, expressed -
20 Sobic.004G188100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G094600 Sobic005G094600 Sobic008G014000 Sobic008G014000 Sobic005G094600--Sobic008G014000 Sobic009G198350 Sobic009G198350 Sobic005G094600--Sobic009G198350 Sobic001G261464 Sobic001G261464 Sobic005G094600--Sobic001G261464 Sobic007G048400 Sobic007G048400 Sobic005G094600--Sobic007G048400 Sobic004G358200 Sobic004G358200 Sobic005G094600--Sobic004G358200 Sobic002G322600 Sobic002G322600 Sobic005G094600--Sobic002G322600 Sobic008G139250 Sobic008G139250 Sobic005G094600--Sobic008G139250 Sobic004G243700 Sobic004G243700 Sobic005G094600--Sobic004G243700 Sobic006G241700 Sobic006G241700 Sobic005G094600--Sobic006G241700 Sobic007G074800 Sobic007G074800 Sobic008G014000--Sobic007G074800 Sobic008G014000--Sobic005G094600 Sobic008G014000--Sobic002G322600 Sobic008G014000--Sobic007G048400 Sobic004G065600 Sobic004G065600 Sobic008G014000--Sobic004G065600 Sobic008G103500 Sobic008G103500 Sobic008G014000--Sobic008G103500 Sobic008G014000--Sobic004G243700 Sobic003G145800 Sobic003G145800 Sobic008G014000--Sobic003G145800 Sobic008G005100 Sobic008G005100 Sobic008G014000--Sobic008G005100 Sobic005G086650 Sobic005G086650 Sobic009G198350--Sobic005G086650 Sobic005G060700 Sobic005G060700 Sobic009G198350--Sobic005G060700 Sobic005G060666 Sobic005G060666 Sobic009G198350--Sobic005G060666 Sobic001G261750 Sobic001G261750 Sobic009G198350--Sobic001G261750 Sobic009G198350--Sobic005G094600 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic001G261464--Sobic005G031901 Sobic003G126750 Sobic003G126750 Sobic001G261464--Sobic003G126750 Sobic006G109600 Sobic006G109600 Sobic001G261464--Sobic006G109600 Sobic002G100100 Sobic002G100100 Sobic001G261464--Sobic002G100100 Sobic010G147300 Sobic010G147300 Sobic001G261464--Sobic010G147300 Sobic001G261464--Sobic004G358200 Sobic004G358301 Sobic004G358301 Sobic001G261464--Sobic004G358301 Sobic001G261464--Sobic004G243700 Sobic002G026150 Sobic002G026150 Sobic001G261464--Sobic002G026150 Sobic007G048400--Sobic001G261464 Sobic007G048400--Sobic004G243700 Sobic007G048400--Sobic003G126750 Sobic007G048400--Sobic002G100100 Sobic007G048400--Sobic005G031901 Sobic007G048400--Sobic006G109600 Sobic007G048400--Sobic010G147300 Sobic007G048400--Sobic004G358301 Sobic002G175700 Sobic002G175700 Sobic007G048400--Sobic002G175700 Sobic004G358200--Sobic001G261464 Sobic004G358200--Sobic003G126750 Sobic002G153900 Sobic002G153900 Sobic004G358200--Sobic002G153900 Sobic004G358200--Sobic005G031901 Sobic004G358200--Sobic006G109600 Sobic006G026300 Sobic006G026300 Sobic004G358200--Sobic006G026300 Sobic004G358200--Sobic002G100100 Sobic004G358200--Sobic004G243700 Sobic004G358200--Sobic002G026150 Sobic006G141400 Sobic006G141400 Sobic002G322600--Sobic006G141400 Sobic007G007600 Sobic007G007600 Sobic002G322600--Sobic007G007600 Sobic002G322600--Sobic007G074800 Sobic002G036500 Sobic002G036500 Sobic002G322600--Sobic002G036500 Sobic007G064000 Sobic007G064000 Sobic002G322600--Sobic007G064000 Sobic002G322600--Sobic004G243700 Sobic002G208850 Sobic002G208850 Sobic002G322600--Sobic002G208850 Sobic002G322600--Sobic008G139250 Sobic002G322600--Sobic007G048400 Sobic008G139250--Sobic005G031901 Sobic008G139250--Sobic001G261464 Sobic008G139250--Sobic003G126750 Sobic008G139250--Sobic006G109600 Sobic008G139250--Sobic004G358200 Sobic008G139250--Sobic010G147300 Sobic008G139250--Sobic002G100100 Sobic008G079733 Sobic008G079733 Sobic008G139250--Sobic008G079733 Sobic008G139250--Sobic002G026150 Sobic004G243700--Sobic003G126750 Sobic004G243700--Sobic001G261464 Sobic004G243700--Sobic002G100100 Sobic004G243700--Sobic006G109600 Sobic004G243700--Sobic005G031901 Sobic004G243700--Sobic010G147300 Sobic004G243700--Sobic002G026150 Sobic004G243700--Sobic006G026300 Sobic004G243700--Sobic004G358200 Sobic002G196000 Sobic002G196000 Sobic006G241700--Sobic002G196000 Sobic006G088900 Sobic006G088900 Sobic006G241700--Sobic006G088900 Sobic008G010500 Sobic008G010500 Sobic006G241700--Sobic008G010500 Sobic004G346300 Sobic004G346300 Sobic006G241700--Sobic004G346300 Sobic001G231800 Sobic001G231800 Sobic006G241700--Sobic001G231800 Sobic006G160900 Sobic006G160900 Sobic006G241700--Sobic006G160900 Sobic005G127200 Sobic005G127200 Sobic006G241700--Sobic005G127200 Sobic010G093300 Sobic010G093300 Sobic006G241700--Sobic010G093300 Sobic001G140300 Sobic001G140300 Sobic006G241700--Sobic001G140300
Octagon: transcription factors


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