Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G121700.1
Synonym Sb05g017970
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y2N5
Pfam -
Panther DB PTHR33184 PTHR33184:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G05835 : PHD finger protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g28940.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015655
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G514400 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
2 Sobic.005G098400 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf and root"(PubMedID : 20499123)@OsIAA27 - Auxin-responsive Aux/IAA gene family member, expressed K14484: auxin-responsive protein IAA
3 Sobic.008G077300 expressed protein -
4 Sobic.009G021700 expressed protein -
5 Sobic.001G305300 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
6 Sobic.007G225400 phosphate-induced protein 1 conserved region domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G034301 - -
8 Sobic.007G208100 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G016400 monocopper oxidase, putative, expressed -
10 Sobic.005G231300 thaumatin, putative, expressed -
11 Sobic.007G050500 MYB family transcription factor, putative, expressed -
12 Sobic.004G156900 OsGrx_C8 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
13 Sobic.001G345200 OsFBX94 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G264400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@hsp20/alpha crystallin family protein, putative, expressed -
15 Sobic.007G111700 glutathione S-transferase, C-terminal domain containing protein, expressed -
16 Sobic.006G030200 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
17 Sobic.009G061400 leucine-rich repeat receptor protein kinase EXS precursor, putative, expressed -
18 Sobic.007G120301 - -
19 Sobic.009G242501 - -
20 Sobic.005G010300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G121700 Sobic005G121700 Sobic001G514400 Sobic001G514400 Sobic005G121700--Sobic001G514400 Sobic005G098400 Sobic005G098400 Sobic005G121700--Sobic005G098400 Sobic008G077300 Sobic008G077300 Sobic005G121700--Sobic008G077300 Sobic009G021700 Sobic009G021700 Sobic005G121700--Sobic009G021700 Sobic001G305300 Sobic001G305300 Sobic005G121700--Sobic001G305300 Sobic007G225400 Sobic007G225400 Sobic005G121700--Sobic007G225400 Sobic002G034301 Sobic002G034301 Sobic005G121700--Sobic002G034301 Sobic007G208100 Sobic007G208100 Sobic005G121700--Sobic007G208100 Sobic002G016400 Sobic002G016400 Sobic005G121700--Sobic002G016400 Sobic001G514400--Sobic005G121700 Sobic004G259101 Sobic004G259101 Sobic001G514400--Sobic004G259101 Sobic001G258100 Sobic001G258100 Sobic001G514400--Sobic001G258100 Sobic004G247300 Sobic004G247300 Sobic001G514400--Sobic004G247300 Sobic001G409700 Sobic001G409700 Sobic001G514400--Sobic001G409700 Sobic009G099700 Sobic009G099700 Sobic001G514400--Sobic009G099700 Sobic009G061400 Sobic009G061400 Sobic001G514400--Sobic009G061400 Sobic001G514400--Sobic009G021700 Sobic005G054700 Sobic005G054700 Sobic001G514400--Sobic005G054700 Sobic005G098400--Sobic002G016400 Sobic005G098400--Sobic001G305300 Sobic001G345200 Sobic001G345200 Sobic005G098400--Sobic001G345200 Sobic003G418300 Sobic003G418300 Sobic005G098400--Sobic003G418300 Sobic007G050500 Sobic007G050500 Sobic005G098400--Sobic007G050500 Sobic005G098400--Sobic007G225400 Sobic005G091000 Sobic005G091000 Sobic005G098400--Sobic005G091000 Sobic005G098400--Sobic005G121700 Sobic008G170400 Sobic008G170400 Sobic005G098400--Sobic008G170400 Sobic001G264400 Sobic001G264400 Sobic008G077300--Sobic001G264400 Sobic005G231300 Sobic005G231300 Sobic008G077300--Sobic005G231300 Sobic001G514300 Sobic001G514300 Sobic008G077300--Sobic001G514300 Sobic008G077300--Sobic005G121700 Sobic006G030200 Sobic006G030200 Sobic008G077300--Sobic006G030200 Sobic008G077300--Sobic007G208100 Sobic008G077300--Sobic002G016400 Sobic004G297950 Sobic004G297950 Sobic008G077300--Sobic004G297950 Sobic004G156900 Sobic004G156900 Sobic008G077300--Sobic004G156900 Sobic009G021700--Sobic005G121700 Sobic009G242501 Sobic009G242501 Sobic009G021700--Sobic009G242501 Sobic009G021700--Sobic007G225400 Sobic009G021700--Sobic007G208100 Sobic003G420100 Sobic003G420100 Sobic009G021700--Sobic003G420100 Sobic008G143000 Sobic008G143000 Sobic009G021700--Sobic008G143000 Sobic004G170900 Sobic004G170900 Sobic009G021700--Sobic004G170900 Sobic002G280300 Sobic002G280300 Sobic009G021700--Sobic002G280300 Sobic009G021700--Sobic008G077300 Sobic001G305300--Sobic005G098400 Sobic001G305300--Sobic002G016400 Sobic007G120301 Sobic007G120301 Sobic001G305300--Sobic007G120301 Sobic001G305300--Sobic001G345200 Sobic001G305300--Sobic005G121700 Sobic001G305300--Sobic007G050500 Sobic005G010300 Sobic005G010300 Sobic001G305300--Sobic005G010300 Sobic001G305300--Sobic007G225400 Sobic001G310200 Sobic001G310200 Sobic001G305300--Sobic001G310200 Sobic007G225400--Sobic004G170900 Sobic007G225400--Sobic005G098400 Sobic010G216600 Sobic010G216600 Sobic007G225400--Sobic010G216600 Sobic005G047100 Sobic005G047100 Sobic007G225400--Sobic005G047100 Sobic002G226500 Sobic002G226500 Sobic007G225400--Sobic002G226500 Sobic007G225400--Sobic005G121700 Sobic007G225400--Sobic002G016400 Sobic007G225400--Sobic001G305300 Sobic007G225400--Sobic001G264400 Sobic002G034301--Sobic007G208100 Sobic002G034301--Sobic005G231300 Sobic005G057000 Sobic005G057000 Sobic002G034301--Sobic005G057000 Sobic002G034301--Sobic005G121700 Sobic007G111700 Sobic007G111700 Sobic002G034301--Sobic007G111700 Sobic002G034301--Sobic008G077300 Sobic002G034301--Sobic002G016400 Sobic002G034301--Sobic003G420100 Sobic003G052100 Sobic003G052100 Sobic002G034301--Sobic003G052100 Sobic007G208100--Sobic005G231300 Sobic007G208100--Sobic002G016400 Sobic003G296500 Sobic003G296500 Sobic007G208100--Sobic003G296500 Sobic006G149300 Sobic006G149300 Sobic007G208100--Sobic006G149300 Sobic007G208100--Sobic002G034301 Sobic007G208100--Sobic003G420100 Sobic010G104400 Sobic010G104400 Sobic007G208100--Sobic010G104400 Sobic003G247600 Sobic003G247600 Sobic007G208100--Sobic003G247600 Sobic007G208100--Sobic001G514300 Sobic002G016400--Sobic005G098400 Sobic002G016400--Sobic003G418300 Sobic002G016400--Sobic007G050500 Sobic002G016400--Sobic001G305300 Sobic002G016400--Sobic001G345200 Sobic002G016400--Sobic007G208100 Sobic002G016400--Sobic006G149300 Sobic001G382700 Sobic001G382700 Sobic002G016400--Sobic001G382700 Sobic002G016400--Sobic008G170400
Octagon: transcription factors


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