Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G010300.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PPL3
Pfam PF00011
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g17660.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G016400 monocopper oxidase, putative, expressed -
2 Sobic.001G305300 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
3 Sobic.005G098400 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf and root"(PubMedID : 20499123)@OsIAA27 - Auxin-responsive Aux/IAA gene family member, expressed K14484: auxin-responsive protein IAA
4 Sobic.006G149300 possible lysine decarboxylase domain containing protein, expressed K06966: pyrimidine/purine-5'-nucleotide nucleosidase
5 Sobic.009G061400 leucine-rich repeat receptor protein kinase EXS precursor, putative, expressed -
6 Sobic.007G050500 MYB family transcription factor, putative, expressed -
7 Sobic.007G225400 phosphate-induced protein 1 conserved region domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G514300 Glutathione S-transferase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
9 Sobic.005G231300 thaumatin, putative, expressed -
10 Sobic.003G418300 protein kinase, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
11 Sobic.001G310200 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
12 Sobic.001G345200 OsFBX94 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.007G120301 - -
14 Sobic.008G114000 expressed protein -
15 Sobic.005G121700 expressed protein -
16 Sobic.004G156900 OsGrx_C8 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
17 Sobic.008G077300 expressed protein -
18 Sobic.006G030200 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
19 Sobic.008G170400 expressed protein -
20 Sobic.004G297950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G010300 Sobic005G010300 Sobic002G016400 Sobic002G016400 Sobic005G010300--Sobic002G016400 Sobic001G305300 Sobic001G305300 Sobic005G010300--Sobic001G305300 Sobic005G098400 Sobic005G098400 Sobic005G010300--Sobic005G098400 Sobic006G149300 Sobic006G149300 Sobic005G010300--Sobic006G149300 Sobic009G061400 Sobic009G061400 Sobic005G010300--Sobic009G061400 Sobic007G050500 Sobic007G050500 Sobic005G010300--Sobic007G050500 Sobic007G225400 Sobic007G225400 Sobic005G010300--Sobic007G225400 Sobic001G514300 Sobic001G514300 Sobic005G010300--Sobic001G514300 Sobic005G231300 Sobic005G231300 Sobic005G010300--Sobic005G231300 Sobic002G016400--Sobic005G098400 Sobic003G418300 Sobic003G418300 Sobic002G016400--Sobic003G418300 Sobic002G016400--Sobic007G050500 Sobic002G016400--Sobic001G305300 Sobic001G345200 Sobic001G345200 Sobic002G016400--Sobic001G345200 Sobic007G208100 Sobic007G208100 Sobic002G016400--Sobic007G208100 Sobic002G016400--Sobic006G149300 Sobic001G382700 Sobic001G382700 Sobic002G016400--Sobic001G382700 Sobic008G170400 Sobic008G170400 Sobic002G016400--Sobic008G170400 Sobic001G305300--Sobic005G098400 Sobic001G305300--Sobic002G016400 Sobic007G120301 Sobic007G120301 Sobic001G305300--Sobic007G120301 Sobic001G305300--Sobic001G345200 Sobic005G121700 Sobic005G121700 Sobic001G305300--Sobic005G121700 Sobic001G305300--Sobic007G050500 Sobic001G305300--Sobic005G010300 Sobic001G305300--Sobic007G225400 Sobic001G310200 Sobic001G310200 Sobic001G305300--Sobic001G310200 Sobic005G098400--Sobic002G016400 Sobic005G098400--Sobic001G305300 Sobic005G098400--Sobic001G345200 Sobic005G098400--Sobic003G418300 Sobic005G098400--Sobic007G050500 Sobic005G098400--Sobic007G225400 Sobic005G091000 Sobic005G091000 Sobic005G098400--Sobic005G091000 Sobic005G098400--Sobic005G121700 Sobic005G098400--Sobic008G170400 Sobic006G149300--Sobic002G016400 Sobic006G149300--Sobic007G208100 Sobic010G104400 Sobic010G104400 Sobic006G149300--Sobic010G104400 Sobic006G149300--Sobic005G231300 Sobic006G149300--Sobic005G098400 Sobic002G226500 Sobic002G226500 Sobic006G149300--Sobic002G226500 Sobic002G278200 Sobic002G278200 Sobic006G149300--Sobic002G278200 Sobic006G149300--Sobic007G120301 Sobic007G018100 Sobic007G018100 Sobic006G149300--Sobic007G018100 Sobic009G061400--Sobic002G016400 Sobic001G409700 Sobic001G409700 Sobic009G061400--Sobic001G409700 Sobic004G156900 Sobic004G156900 Sobic009G061400--Sobic004G156900 Sobic006G054600 Sobic006G054600 Sobic009G061400--Sobic006G054600 Sobic009G061400--Sobic005G231300 Sobic008G077300 Sobic008G077300 Sobic009G061400--Sobic008G077300 Sobic007G111700 Sobic007G111700 Sobic009G061400--Sobic007G111700 Sobic009G061400--Sobic007G208100 Sobic001G264400 Sobic001G264400 Sobic009G061400--Sobic001G264400 Sobic007G050500--Sobic002G016400 Sobic007G050500--Sobic005G098400 Sobic001G267100 Sobic001G267100 Sobic007G050500--Sobic001G267100 Sobic007G050500--Sobic002G278200 Sobic007G050500--Sobic001G305300 Sobic007G050500--Sobic007G120301 Sobic005G025900 Sobic005G025900 Sobic007G050500--Sobic005G025900 Sobic007G050500--Sobic001G345200 Sobic007G050500--Sobic007G111700 Sobic004G170900 Sobic004G170900 Sobic007G225400--Sobic004G170900 Sobic007G225400--Sobic005G098400 Sobic010G216600 Sobic010G216600 Sobic007G225400--Sobic010G216600 Sobic005G047100 Sobic005G047100 Sobic007G225400--Sobic005G047100 Sobic007G225400--Sobic002G226500 Sobic007G225400--Sobic005G121700 Sobic007G225400--Sobic002G016400 Sobic007G225400--Sobic001G305300 Sobic007G225400--Sobic001G264400 Sobic001G514300--Sobic005G231300 Sobic008G099100 Sobic008G099100 Sobic001G514300--Sobic008G099100 Sobic003G083600 Sobic003G083600 Sobic001G514300--Sobic003G083600 Sobic001G314000 Sobic001G314000 Sobic001G514300--Sobic001G314000 Sobic009G079900 Sobic009G079900 Sobic001G514300--Sobic009G079900 Sobic001G514300--Sobic008G077300 Sobic008G135300 Sobic008G135300 Sobic001G514300--Sobic008G135300 Sobic003G151900 Sobic003G151900 Sobic001G514300--Sobic003G151900 Sobic003G269100 Sobic003G269100 Sobic001G514300--Sobic003G269100 Sobic005G231300--Sobic001G514300 Sobic005G231300--Sobic003G083600 Sobic005G231300--Sobic009G079900 Sobic005G231300--Sobic008G099100 Sobic005G231300--Sobic007G208100 Sobic006G030200 Sobic006G030200 Sobic005G231300--Sobic006G030200 Sobic005G231300--Sobic001G314000 Sobic005G231300--Sobic008G077300 Sobic005G231300--Sobic003G151900
Octagon: transcription factors


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