Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G129501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIB1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G64940 : ABC2 homolog 13
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g36570.1 : ABC1 family domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G355700 BBTI13 - Bowman-Birk type bran trypsin inhibitor precursor, expressed -
2 Sobic.003G325800 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G139900 CSLA1 - cellulose synthase-like family A@ mannan synthase, expressed K13680: beta-mannan synthase
4 Sobic.003G414000 OsFBX1 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.004G256400 glycosyltransferase, putative, expressed -
6 Sobic.003G189466 - -
7 Sobic.003G159850 - -
8 Sobic.002G192600 no apical meristem protein, putative, expressed -
9 Sobic.005G186300 - -
10 Sobic.008G125400 expressed protein -
11 Sobic.002G078800 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
12 Sobic.006G015750 - -
13 Sobic.003G091400 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G381600 uncharacterized glycosyl hydrolase Rv2006/MT2062, putative, expressed K01087: trehalose 6-phosphate phosphatase
15 Sobic.001G200900 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
16 Sobic.002G409250 - -
17 Sobic.009G052400 inorganic H+ pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase
18 Sobic.007G187100 terpene synthase, putative, expressed -
19 Sobic.001G129900 indole-3-acetate beta-glucosyltransferase, putative, expressed K13692: UDP-glucose:(indol-3-yl)acetate beta-D-glucosyltransferase
20 Sobic.007G205400 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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