Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G149650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PU63
Pfam PF04195
Panther DB PTHR31099
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G20400 : Protein of unknown function (DUF1204)
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g06950.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G050700 two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
2 Sobic.005G143800 expressed protein -
3 Sobic.005G229232 - -
4 Sobic.002G269800 - -
5 Sobic.003G126700 NB-ARC domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G223700 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G031600 F-box protein interaction domain containing protein, expressed -
8 Sobic.007G193000 expressed protein -
9 Sobic.008G154200 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G156700 protein transport protein, putative, expressed -
11 Sobic.009G197350 - -
12 Sobic.006G110500 expressed protein -
13 Sobic.007G003300 - -
14 Sobic.007G145300 zinc knuckle family protein, expressed -
15 Sobic.001G443850 - -
16 Sobic.003G064000 expressed protein -
17 Sobic.003G372950 - -
18 Sobic.003G318350 - -
19 Sobic.002G124766 - -
20 Sobic.004G286450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G149650 Sobic005G149650 Sobic005G050700 Sobic005G050700 Sobic005G149650--Sobic005G050700 Sobic005G143800 Sobic005G143800 Sobic005G149650--Sobic005G143800 Sobic005G229232 Sobic005G229232 Sobic005G149650--Sobic005G229232 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic005G149650--Sobic002G269800 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic005G149650--Sobic003G126700 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic005G149650--Sobic006G223700 Sobic005G031600 Sobic005G031600 Sobic005G149650--Sobic005G031600 Sobic007G193000 Sobic007G193000 Sobic005G149650--Sobic007G193000 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic005G149650--Sobic008G154200 Sobic005G050700--Sobic005G143800 Sobic007G121800 Sobic007G121800 Sobic005G050700--Sobic007G121800 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic005G050700--Sobic002G082350 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic005G050700--Sobic007G145300 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic005G050700--Sobic010G064050 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic005G050700--Sobic001G100650 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic005G050700--Sobic009G197350 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic005G050700--Sobic009G156700 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic005G050700--Sobic005G080075 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic005G143800--Sobic003G008400 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic005G143800--Sobic003G254400 Sobic005G143800--Sobic005G080075 Sobic005G143800--Sobic001G100650 Sobic005G143800--Sobic010G064050 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic005G143800--Sobic003G318600 Sobic003G360500 Sobic003G360500 Sobic005G143800--Sobic003G360500 Sobic005G143800--Sobic002G082350 Sobic009G073200 Sobic009G073200 Sobic005G143800--Sobic009G073200 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic005G229232--Sobic003G064000 Sobic005G229232--Sobic008G154200 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic005G229232--Sobic003G372950 Sobic001G443850 Sobic001G443850 Sobic005G229232--Sobic001G443850 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic005G229232--Sobic004G286450 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic005G229232--Sobic005G057600 Sobic005G229232--Sobic006G223700 Sobic005G229232--Sobic003G126700 Sobic006G167850 Sobic006G167850 Sobic005G229232--Sobic006G167850 Sobic002G269800--Sobic003G126700 Sobic002G269800--Sobic009G156700 Sobic002G269800--Sobic009G197350 Sobic002G269800--Sobic007G145300 Sobic002G269800--Sobic006G223700 Sobic002G124766 Sobic002G124766 Sobic002G269800--Sobic002G124766 Sobic002G269800--Sobic007G193000 Sobic007G003300 Sobic007G003300 Sobic002G269800--Sobic007G003300 Sobic002G269800--Sobic008G154200 Sobic003G126700--Sobic002G269800 Sobic003G126700--Sobic006G223700 Sobic003G126700--Sobic009G156700 Sobic003G126700--Sobic009G197350 Sobic003G126700--Sobic007G145300 Sobic003G126700--Sobic008G154200 Sobic003G126700--Sobic002G124766 Sobic003G126700--Sobic007G193000 Sobic003G126700--Sobic007G003300 Sobic006G223700--Sobic003G126700 Sobic006G223700--Sobic002G269800 Sobic006G223700--Sobic008G154200 Sobic006G223700--Sobic009G156700 Sobic006G223700--Sobic009G197350 Sobic006G223700--Sobic003G064000 Sobic006G223700--Sobic007G145300 Sobic006G223700--Sobic007G193000 Sobic006G223700--Sobic002G124766 Sobic005G031600--Sobic005G149650 Sobic005G226700 Sobic005G226700 Sobic005G031600--Sobic005G226700 Sobic006G110500 Sobic006G110500 Sobic005G031600--Sobic006G110500 Sobic004G041000 Sobic004G041000 Sobic005G031600--Sobic004G041000 Sobic002G018000 Sobic002G018000 Sobic005G031600--Sobic002G018000 Sobic003G049000 Sobic003G049000 Sobic005G031600--Sobic003G049000 Sobic010G079200 Sobic010G079200 Sobic005G031600--Sobic010G079200 Sobic002G364301 Sobic002G364301 Sobic005G031600--Sobic002G364301 Sobic005G031600--Sobic005G050700 Sobic007G193000--Sobic003G126700 Sobic007G193000--Sobic002G269800 Sobic007G193000--Sobic006G223700 Sobic007G193000--Sobic009G156700 Sobic007G193000--Sobic009G197350 Sobic007G193000--Sobic008G154200 Sobic007G193000--Sobic007G145300 Sobic007G193000--Sobic002G124766 Sobic007G193000--Sobic003G064000 Sobic008G154200--Sobic003G064000 Sobic008G154200--Sobic003G372950 Sobic008G154200--Sobic004G286450 Sobic008G154200--Sobic006G223700 Sobic008G154200--Sobic006G167850 Sobic008G154200--Sobic003G126700 Sobic008G154200--Sobic005G057600 Sobic008G154200--Sobic001G443850 Sobic008G154200--Sobic002G269800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.