Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G189600.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PTG2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g07495.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G015150 - -
2 Sobic.010G121900 expressed protein -
3 Sobic.004G015050 - -
4 Sobic.005G097201 - -
5 Sobic.002G080500 OsMADS70 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
6 Sobic.004G029601 - -
7 Sobic.010G052450 - -
8 Sobic.008G161201 - K16287: ubiquitin-like-specific protease 1C/D
9 Sobic.002G057800 - -
10 Sobic.008G135901 - K01051: pectinesterase
11 Sobic.004G285300 MYB family transcription factor, putative, expressed -
12 Sobic.010G237300 - -
13 Sobic.004G321500 expressed protein -
14 Sobic.004G099000 - -
15 Sobic.005G133133 - -
16 Sobic.010G039600 - -
17 Sobic.005G181400 - -
18 Sobic.004G108300 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.003G197700 OsFBX12 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G349200 expressed protein K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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