Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G057800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q9G0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045249
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G046800 DEFL43 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
2 Sobic.004G015150 - -
3 Sobic.005G189600 expressed protein -
4 Sobic.005G097201 - -
5 Sobic.010G121900 expressed protein -
6 Sobic.004G015050 - -
7 Sobic.010G059400 exostosin family protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G029601 - -
9 Sobic.008G135901 - K01051: pectinesterase
10 Sobic.002G080500 OsMADS70 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
11 Sobic.008G161201 - K16287: ubiquitin-like-specific protease 1C/D
12 Sobic.004G314300 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
13 Sobic.004G321500 expressed protein -
14 Sobic.004G285300 MYB family transcription factor, putative, expressed -
15 Sobic.010G039600 - -
16 Sobic.006G118100 ZOS6-03 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
17 Sobic.003G404700 regulatory protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G538200 - -
19 Sobic.003G245401 - -
20 Sobic.010G052450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G057800 Sobic002G057800 Sobic007G046800 Sobic007G046800 Sobic002G057800--Sobic007G046800 Sobic004G015150 Sobic004G015150 Sobic002G057800--Sobic004G015150 Sobic005G189600 Sobic005G189600 Sobic002G057800--Sobic005G189600 Sobic005G097201 Sobic005G097201 Sobic002G057800--Sobic005G097201 Sobic010G121900 Sobic010G121900 Sobic002G057800--Sobic010G121900 Sobic004G015050 Sobic004G015050 Sobic002G057800--Sobic004G015050 Sobic010G059400 Sobic010G059400 Sobic002G057800--Sobic010G059400 Sobic004G029601 Sobic004G029601 Sobic002G057800--Sobic004G029601 Sobic008G135901 Sobic008G135901 Sobic002G057800--Sobic008G135901 Sobic007G046800--Sobic002G057800 Sobic010G064800 Sobic010G064800 Sobic007G046800--Sobic010G064800 Sobic007G046800--Sobic010G059400 Sobic007G046800--Sobic005G097201 Sobic007G046800--Sobic005G189600 Sobic007G046800--Sobic004G015050 Sobic007G046800--Sobic004G015150 Sobic004G285300 Sobic004G285300 Sobic007G046800--Sobic004G285300 Sobic002G080500 Sobic002G080500 Sobic007G046800--Sobic002G080500 Sobic004G015150--Sobic005G189600 Sobic004G015150--Sobic010G121900 Sobic004G015150--Sobic004G015050 Sobic004G015150--Sobic005G097201 Sobic004G015150--Sobic004G029601 Sobic004G015150--Sobic002G080500 Sobic004G015150--Sobic008G135901 Sobic004G015150--Sobic002G057800 Sobic008G161201 Sobic008G161201 Sobic004G015150--Sobic008G161201 Sobic005G189600--Sobic004G015150 Sobic005G189600--Sobic010G121900 Sobic005G189600--Sobic004G015050 Sobic005G189600--Sobic005G097201 Sobic005G189600--Sobic002G080500 Sobic005G189600--Sobic004G029601 Sobic010G052450 Sobic010G052450 Sobic005G189600--Sobic010G052450 Sobic005G189600--Sobic008G161201 Sobic005G189600--Sobic002G057800 Sobic005G097201--Sobic004G015150 Sobic005G097201--Sobic005G189600 Sobic005G097201--Sobic004G015050 Sobic005G097201--Sobic002G080500 Sobic005G097201--Sobic010G052450 Sobic005G097201--Sobic010G121900 Sobic005G181400 Sobic005G181400 Sobic005G097201--Sobic005G181400 Sobic003G197700 Sobic003G197700 Sobic005G097201--Sobic003G197700 Sobic005G097201--Sobic004G285300 Sobic010G121900--Sobic004G015050 Sobic010G121900--Sobic005G189600 Sobic010G121900--Sobic004G015150 Sobic010G121900--Sobic004G029601 Sobic010G121900--Sobic002G080500 Sobic010G121900--Sobic008G161201 Sobic010G121900--Sobic005G097201 Sobic004G321500 Sobic004G321500 Sobic010G121900--Sobic004G321500 Sobic010G121900--Sobic008G135901 Sobic004G015050--Sobic010G121900 Sobic004G015050--Sobic002G080500 Sobic004G015050--Sobic005G189600 Sobic004G015050--Sobic004G015150 Sobic004G015050--Sobic005G097201 Sobic004G015050--Sobic010G052450 Sobic004G015050--Sobic004G285300 Sobic004G015050--Sobic004G029601 Sobic004G015050--Sobic005G181400 Sobic006G087800 Sobic006G087800 Sobic010G059400--Sobic006G087800 Sobic010G059400--Sobic010G064800 Sobic010G059400--Sobic007G046800 Sobic010G059400--Sobic002G057800 Sobic010G059400--Sobic004G285300 Sobic010G059400--Sobic004G015050 Sobic010G059400--Sobic010G121900 Sobic010G059400--Sobic005G189600 Sobic010G059400--Sobic002G080500 Sobic004G029601--Sobic008G161201 Sobic010G039600 Sobic010G039600 Sobic004G029601--Sobic010G039600 Sobic004G029601--Sobic008G135901 Sobic004G029601--Sobic010G121900 Sobic005G064300 Sobic005G064300 Sobic004G029601--Sobic005G064300 Sobic004G029601--Sobic004G321500 Sobic008G181600 Sobic008G181600 Sobic004G029601--Sobic008G181600 Sobic001G345700 Sobic001G345700 Sobic004G029601--Sobic001G345700 Sobic004G029601--Sobic004G015150 Sobic004G314300 Sobic004G314300 Sobic008G135901--Sobic004G314300 Sobic003G404700 Sobic003G404700 Sobic008G135901--Sobic003G404700 Sobic008G135901--Sobic010G039600 Sobic008G135901--Sobic008G161201 Sobic008G135901--Sobic004G029601 Sobic008G135901--Sobic005G064300 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic008G135901--Sobic008G188300 Sobic008G135901--Sobic008G181600 Sobic008G135901--Sobic001G345700
Octagon: transcription factors


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