Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G118100.1
Synonym Sb06g019920
Functional annotation ZOS6-03 - C2H2 zinc finger protein, expressed
UniProt A0A1Z5REG3
Pfam PF13912
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17180 : C2H2-like zinc finger protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g39520.1 : ZOS4-08 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G314300 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
2 Sobic.008G135901 - K01051: pectinesterase
3 Sobic.003G404700 regulatory protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G027100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
5 Sobic.008G188300 - -
6 Sobic.002G352501 - -
7 Sobic.006G194900 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G227100 leucoanthocyanidin reductase, putative, expressed K08695: anthocyanidin reductase
9 Sobic.002G345500 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
10 Sobic.010G039600 - -
11 Sobic.004G316400 - -
12 Sobic.005G098300 OsIAA29 - Auxin-responsive Aux/IAA gene family member, expressed K14484: auxin-responsive protein IAA
13 Sobic.009G039200 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
14 Sobic.001G324600 cysteine proteinase inhibitor 8 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.004G090400 - -
16 Sobic.008G135800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
17 Sobic.009G019900 - -
18 Sobic.004G309200 alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase
19 Sobic.002G151700 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed K07407: E3.2.1.22B, galA, alpha-galactosidase
20 Sobic.004G029601 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G118100 Sobic006G118100 Sobic004G314300 Sobic004G314300 Sobic006G118100--Sobic004G314300 Sobic008G135901 Sobic008G135901 Sobic006G118100--Sobic008G135901 Sobic003G404700 Sobic003G404700 Sobic006G118100--Sobic003G404700 Sobic005G027100 Sobic005G027100 Sobic006G118100--Sobic005G027100 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic006G118100--Sobic008G188300 Sobic002G352501 Sobic002G352501 Sobic006G118100--Sobic002G352501 Sobic006G194900 Sobic006G194900 Sobic006G118100--Sobic006G194900 Sobic006G227100 Sobic006G227100 Sobic006G118100--Sobic006G227100 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic006G118100--Sobic002G345500 Sobic004G314300--Sobic008G135901 Sobic004G314300--Sobic005G027100 Sobic004G314300--Sobic002G352501 Sobic004G314300--Sobic006G194900 Sobic004G314300--Sobic002G345500 Sobic001G324600 Sobic001G324600 Sobic004G314300--Sobic001G324600 Sobic004G314300--Sobic003G404700 Sobic005G200400 Sobic005G200400 Sobic004G314300--Sobic005G200400 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic004G314300--Sobic006G144101 Sobic008G135901--Sobic004G314300 Sobic008G135901--Sobic003G404700 Sobic010G039600 Sobic010G039600 Sobic008G135901--Sobic010G039600 Sobic008G161201 Sobic008G161201 Sobic008G135901--Sobic008G161201 Sobic004G029601 Sobic004G029601 Sobic008G135901--Sobic004G029601 Sobic005G064300 Sobic005G064300 Sobic008G135901--Sobic005G064300 Sobic008G135901--Sobic008G188300 Sobic008G181600 Sobic008G181600 Sobic008G135901--Sobic008G181600 Sobic001G345700 Sobic001G345700 Sobic008G135901--Sobic001G345700 Sobic009G039200 Sobic009G039200 Sobic003G404700--Sobic009G039200 Sobic003G404700--Sobic008G188300 Sobic003G404700--Sobic008G135901 Sobic003G404700--Sobic005G027100 Sobic005G098300 Sobic005G098300 Sobic003G404700--Sobic005G098300 Sobic006G022900 Sobic006G022900 Sobic003G404700--Sobic006G022900 Sobic003G404700--Sobic006G227100 Sobic003G404700--Sobic004G314300 Sobic003G404700--Sobic010G039600 Sobic005G027100--Sobic002G352501 Sobic004G221700 Sobic004G221700 Sobic005G027100--Sobic004G221700 Sobic005G179700 Sobic005G179700 Sobic005G027100--Sobic005G179700 Sobic005G027100--Sobic006G194900 Sobic005G027100--Sobic002G345500 Sobic004G090400 Sobic004G090400 Sobic005G027100--Sobic004G090400 Sobic005G027100--Sobic005G098300 Sobic004G316400 Sobic004G316400 Sobic005G027100--Sobic004G316400 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic005G027100--Sobic005G064400 Sobic008G188300--Sobic004G316400 Sobic005G153100 Sobic005G153100 Sobic008G188300--Sobic005G153100 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic008G188300--Sobic010G129300 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic008G188300--Sobic002G058100 Sobic005G154000 Sobic005G154000 Sobic008G188300--Sobic005G154000 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic008G188300--Sobic005G027200 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic008G188300--Sobic002G399700 Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic008G188300--Sobic001G312200 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic008G188300--Sobic002G095000 Sobic002G352501--Sobic005G179700 Sobic002G352501--Sobic005G200400 Sobic002G352501--Sobic005G027100 Sobic002G352501--Sobic005G064400 Sobic002G352501--Sobic006G194900 Sobic002G352501--Sobic006G144101 Sobic002G352501--Sobic002G345500 Sobic002G352401 Sobic002G352401 Sobic002G352501--Sobic002G352401 Sobic002G352501--Sobic004G090400 Sobic006G194900--Sobic004G316400 Sobic006G194900--Sobic005G064400 Sobic006G194900--Sobic002G352501 Sobic006G194900--Sobic010G129300 Sobic006G007001 Sobic006G007001 Sobic006G194900--Sobic006G007001 Sobic006G194900--Sobic008G188300 Sobic004G309200 Sobic004G309200 Sobic006G194900--Sobic004G309200 Sobic006G194900--Sobic002G352401 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic006G194900--Sobic005G081800 Sobic006G227100--Sobic009G039200 Sobic006G227100--Sobic005G098300 Sobic005G147100 Sobic005G147100 Sobic006G227100--Sobic005G147100 Sobic006G227100--Sobic008G188300 Sobic010G010500 Sobic010G010500 Sobic006G227100--Sobic010G010500 Sobic005G223000 Sobic005G223000 Sobic006G227100--Sobic005G223000 Sobic008G120200 Sobic008G120200 Sobic006G227100--Sobic008G120200 Sobic005G221100 Sobic005G221100 Sobic006G227100--Sobic005G221100 Sobic010G191500 Sobic010G191500 Sobic006G227100--Sobic010G191500 Sobic002G345500--Sobic006G144101 Sobic002G345500--Sobic004G090400 Sobic002G345500--Sobic005G200400 Sobic002G162100 Sobic002G162100 Sobic002G345500--Sobic002G162100 Sobic005G153300 Sobic005G153300 Sobic002G345500--Sobic005G153300 Sobic002G345500--Sobic002G352501 Sobic003G411100 Sobic003G411100 Sobic002G345500--Sobic003G411100 Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic002G345500--Sobic008G071200 Sobic002G162200 Sobic002G162200 Sobic002G345500--Sobic002G162200
Octagon: transcription factors


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