Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G245401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q542
Pfam PF03478 PF12937
Panther DB PTHR33110 PTHR33110:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g47130.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G022900 cytochrome P450, putative, expressed -
2 Sobic.003G285200 expressed protein -
3 Sobic.006G020700 homeobox and START domains containing protein, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
4 Sobic.006G227100 leucoanthocyanidin reductase, putative, expressed K08695: anthocyanidin reductase
5 Sobic.004G029601 - -
6 Sobic.010G039600 - -
7 Sobic.008G181600 thaumatin, putative, expressed -
8 Sobic.008G135901 - K01051: pectinesterase
9 Sobic.008G161201 - K16287: ubiquitin-like-specific protease 1C/D
10 Sobic.010G191450 - -
11 Sobic.009G019900 - -
12 Sobic.005G064300 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G345700 zinc-binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G404700 regulatory protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G096400 expressed protein -
16 Sobic.009G242250 - -
17 Sobic.004G314300 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
18 Sobic.001G345600 zinc-binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G321500 expressed protein -
20 Sobic.010G059400 exostosin family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G245401 Sobic003G245401 Sobic006G022900 Sobic006G022900 Sobic003G245401--Sobic006G022900 Sobic003G285200 Sobic003G285200 Sobic003G245401--Sobic003G285200 Sobic006G020700 Sobic006G020700 Sobic003G245401--Sobic006G020700 Sobic006G227100 Sobic006G227100 Sobic003G245401--Sobic006G227100 Sobic004G029601 Sobic004G029601 Sobic003G245401--Sobic004G029601 Sobic010G039600 Sobic010G039600 Sobic003G245401--Sobic010G039600 Sobic008G181600 Sobic008G181600 Sobic003G245401--Sobic008G181600 Sobic008G135901 Sobic008G135901 Sobic003G245401--Sobic008G135901 Sobic008G161201 Sobic008G161201 Sobic003G245401--Sobic008G161201 Sobic006G022900--Sobic008G181600 Sobic009G039200 Sobic009G039200 Sobic006G022900--Sobic009G039200 Sobic005G064300 Sobic005G064300 Sobic006G022900--Sobic005G064300 Sobic001G345700 Sobic001G345700 Sobic006G022900--Sobic001G345700 Sobic009G019900 Sobic009G019900 Sobic006G022900--Sobic009G019900 Sobic001G345600 Sobic001G345600 Sobic006G022900--Sobic001G345600 Sobic006G022900--Sobic010G039600 Sobic006G022900--Sobic006G227100 Sobic002G096400 Sobic002G096400 Sobic006G022900--Sobic002G096400 Sobic003G285200--Sobic006G020700 Sobic010G191450 Sobic010G191450 Sobic003G285200--Sobic010G191450 Sobic003G285200--Sobic006G022900 Sobic003G285200--Sobic008G181600 Sobic004G221600 Sobic004G221600 Sobic003G285200--Sobic004G221600 Sobic003G285200--Sobic009G019900 Sobic003G285200--Sobic001G345600 Sobic006G194800 Sobic006G194800 Sobic003G285200--Sobic006G194800 Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic003G285200--Sobic001G312200 Sobic006G020700--Sobic010G191450 Sobic006G020700--Sobic004G221600 Sobic006G020700--Sobic006G194800 Sobic005G223300 Sobic005G223300 Sobic006G020700--Sobic005G223300 Sobic006G020700--Sobic003G285200 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic006G020700--Sobic001G209701 Sobic006G227100--Sobic009G039200 Sobic005G098300 Sobic005G098300 Sobic006G227100--Sobic005G098300 Sobic005G147100 Sobic005G147100 Sobic006G227100--Sobic005G147100 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic006G227100--Sobic008G188300 Sobic010G010500 Sobic010G010500 Sobic006G227100--Sobic010G010500 Sobic005G223000 Sobic005G223000 Sobic006G227100--Sobic005G223000 Sobic008G120200 Sobic008G120200 Sobic006G227100--Sobic008G120200 Sobic005G221100 Sobic005G221100 Sobic006G227100--Sobic005G221100 Sobic010G191500 Sobic010G191500 Sobic006G227100--Sobic010G191500 Sobic004G029601--Sobic008G161201 Sobic004G029601--Sobic010G039600 Sobic004G029601--Sobic008G135901 Sobic010G121900 Sobic010G121900 Sobic004G029601--Sobic010G121900 Sobic004G029601--Sobic005G064300 Sobic004G321500 Sobic004G321500 Sobic004G029601--Sobic004G321500 Sobic004G029601--Sobic008G181600 Sobic004G029601--Sobic001G345700 Sobic004G015150 Sobic004G015150 Sobic004G029601--Sobic004G015150 Sobic010G039600--Sobic005G064300 Sobic010G039600--Sobic008G181600 Sobic010G039600--Sobic008G161201 Sobic010G039600--Sobic001G345700 Sobic010G039600--Sobic002G096400 Sobic010G039600--Sobic004G029601 Sobic010G039600--Sobic001G345600 Sobic010G039600--Sobic008G135901 Sobic010G039600--Sobic009G019900 Sobic008G181600--Sobic005G064300 Sobic008G181600--Sobic001G345700 Sobic008G181600--Sobic001G345600 Sobic008G181600--Sobic002G096400 Sobic008G181600--Sobic001G312200 Sobic005G152400 Sobic005G152400 Sobic008G181600--Sobic005G152400 Sobic008G122300 Sobic008G122300 Sobic008G181600--Sobic008G122300 Sobic008G181600--Sobic010G039600 Sobic005G131100 Sobic005G131100 Sobic008G181600--Sobic005G131100 Sobic004G314300 Sobic004G314300 Sobic008G135901--Sobic004G314300 Sobic003G404700 Sobic003G404700 Sobic008G135901--Sobic003G404700 Sobic008G135901--Sobic010G039600 Sobic008G135901--Sobic008G161201 Sobic008G135901--Sobic004G029601 Sobic008G135901--Sobic005G064300 Sobic008G135901--Sobic008G188300 Sobic008G135901--Sobic008G181600 Sobic008G135901--Sobic001G345700 Sobic008G161201--Sobic004G029601 Sobic008G161201--Sobic010G039600 Sobic008G161201--Sobic005G064300 Sobic008G161201--Sobic008G135901 Sobic008G161201--Sobic008G181600 Sobic008G161201--Sobic002G096400 Sobic008G161201--Sobic001G345700 Sobic008G161201--Sobic004G321500 Sobic008G161201--Sobic003G404700
Octagon: transcription factors


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