Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G046800.1
Synonym
Functional annotation DEFL43 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
UniProt A0A1B6PFL0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g12230.1 : DEFL43 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G057800 - -
2 Sobic.010G064800 histidine kinase, putative, expressed -
3 Sobic.010G059400 exostosin family protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G097201 - -
5 Sobic.005G189600 expressed protein -
6 Sobic.004G015050 - -
7 Sobic.004G015150 - -
8 Sobic.004G285300 MYB family transcription factor, putative, expressed -
9 Sobic.002G080500 OsMADS70 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
10 Sobic.010G121900 expressed protein -
11 Sobic.010G052450 - -
12 Sobic.003G031600 expressed protein -
13 Sobic.007G052201 - K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
14 Sobic.001G538200 - -
15 Sobic.001G197901 - -
16 Sobic.003G066600 expressed protein -
17 Sobic.010G017600 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
18 Sobic.005G181400 - -
19 Sobic.003G197700 OsFBX12 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.004G175800 chalcone synthase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G046800 Sobic007G046800 Sobic002G057800 Sobic002G057800 Sobic007G046800--Sobic002G057800 Sobic010G064800 Sobic010G064800 Sobic007G046800--Sobic010G064800 Sobic010G059400 Sobic010G059400 Sobic007G046800--Sobic010G059400 Sobic005G097201 Sobic005G097201 Sobic007G046800--Sobic005G097201 Sobic005G189600 Sobic005G189600 Sobic007G046800--Sobic005G189600 Sobic004G015050 Sobic004G015050 Sobic007G046800--Sobic004G015050 Sobic004G015150 Sobic004G015150 Sobic007G046800--Sobic004G015150 Sobic004G285300 Sobic004G285300 Sobic007G046800--Sobic004G285300 Sobic002G080500 Sobic002G080500 Sobic007G046800--Sobic002G080500 Sobic002G057800--Sobic007G046800 Sobic002G057800--Sobic004G015150 Sobic002G057800--Sobic005G189600 Sobic002G057800--Sobic005G097201 Sobic010G121900 Sobic010G121900 Sobic002G057800--Sobic010G121900 Sobic002G057800--Sobic004G015050 Sobic002G057800--Sobic010G059400 Sobic004G029601 Sobic004G029601 Sobic002G057800--Sobic004G029601 Sobic008G135901 Sobic008G135901 Sobic002G057800--Sobic008G135901 Sobic010G064800--Sobic010G059400 Sobic010G064800--Sobic007G046800 Sobic006G033601 Sobic006G033601 Sobic010G064800--Sobic006G033601 Sobic010G237500 Sobic010G237500 Sobic010G064800--Sobic010G237500 Sobic006G087800 Sobic006G087800 Sobic010G064800--Sobic006G087800 Sobic002G314100 Sobic002G314100 Sobic010G064800--Sobic002G314100 Sobic003G388201 Sobic003G388201 Sobic010G064800--Sobic003G388201 SobicK004201 SobicK004201 Sobic010G064800--SobicK004201 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic010G064800--Sobic004G143550 Sobic010G059400--Sobic006G087800 Sobic010G059400--Sobic010G064800 Sobic010G059400--Sobic007G046800 Sobic010G059400--Sobic002G057800 Sobic010G059400--Sobic004G285300 Sobic010G059400--Sobic004G015050 Sobic010G059400--Sobic010G121900 Sobic010G059400--Sobic005G189600 Sobic010G059400--Sobic002G080500 Sobic005G097201--Sobic004G015150 Sobic005G097201--Sobic005G189600 Sobic005G097201--Sobic004G015050 Sobic005G097201--Sobic002G080500 Sobic010G052450 Sobic010G052450 Sobic005G097201--Sobic010G052450 Sobic005G097201--Sobic010G121900 Sobic005G181400 Sobic005G181400 Sobic005G097201--Sobic005G181400 Sobic003G197700 Sobic003G197700 Sobic005G097201--Sobic003G197700 Sobic005G097201--Sobic004G285300 Sobic005G189600--Sobic004G015150 Sobic005G189600--Sobic010G121900 Sobic005G189600--Sobic004G015050 Sobic005G189600--Sobic005G097201 Sobic005G189600--Sobic002G080500 Sobic005G189600--Sobic004G029601 Sobic005G189600--Sobic010G052450 Sobic008G161201 Sobic008G161201 Sobic005G189600--Sobic008G161201 Sobic005G189600--Sobic002G057800 Sobic004G015050--Sobic010G121900 Sobic004G015050--Sobic002G080500 Sobic004G015050--Sobic005G189600 Sobic004G015050--Sobic004G015150 Sobic004G015050--Sobic005G097201 Sobic004G015050--Sobic010G052450 Sobic004G015050--Sobic004G285300 Sobic004G015050--Sobic004G029601 Sobic004G015050--Sobic005G181400 Sobic004G015150--Sobic005G189600 Sobic004G015150--Sobic010G121900 Sobic004G015150--Sobic004G015050 Sobic004G015150--Sobic005G097201 Sobic004G015150--Sobic004G029601 Sobic004G015150--Sobic002G080500 Sobic004G015150--Sobic008G135901 Sobic004G015150--Sobic002G057800 Sobic004G015150--Sobic008G161201 Sobic004G285300--Sobic010G052450 Sobic010G017600 Sobic010G017600 Sobic004G285300--Sobic010G017600 Sobic004G285300--Sobic005G181400 Sobic004G285300--Sobic003G197700 Sobic004G285300--Sobic002G080500 Sobic002G026600 Sobic002G026600 Sobic004G285300--Sobic002G026600 Sobic001G538200 Sobic001G538200 Sobic004G285300--Sobic001G538200 Sobic004G285300--Sobic004G015050 Sobic004G285300--Sobic005G097201 Sobic002G080500--Sobic004G015050 Sobic002G080500--Sobic010G052450 Sobic002G080500--Sobic005G189600 Sobic002G080500--Sobic010G121900 Sobic002G080500--Sobic005G097201 Sobic002G080500--Sobic005G181400 Sobic002G080500--Sobic003G197700 Sobic002G080500--Sobic004G285300 Sobic002G080500--Sobic004G015150
Octagon: transcription factors


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