Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G052201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R856
Pfam PF00097
Panther DB PTHR12313 PTHR12313:SF16
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10666; E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G42030 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g06510.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036085 , Zm00025a024328
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G379450 - -
2 Sobic.007G046800 DEFL43 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
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17 Sobic.001G395600 proteins of unknown function domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G056200 - -
19 Sobic.003G172966 - K05582: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K
20 Sobic.001G143850 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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