Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G032000.1
Synonym UPL4
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PJR9
Pfam -
Panther DB PTHR11254 PTHR11254:SF345
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G02880 : ubiquitin-protein ligase 4
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037745
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS1B02G298000 , TraesCS1B02G298000 , TraesCS1B02G298000 , TraesCS1A02G288600 , TraesCS1A02G288600 , TraesCS1D02G287600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G098400 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
2 Sobic.005G214700 - -
3 Sobic.004G187400 SKP1-like protein 1B, putative, expressed K03094: SKP1, S-phase kinase-associated protein 1
4 Sobic.010G271600 exo70 exocyst complex subunit family protein, putative, expressed -
5 Sobic.010G190500 - -
6 Sobic.008G102850 - -
7 Sobic.002G417401 - -
8 Sobic.006G022700 OsFBD9 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G090400 - -
10 Sobic.002G157900 - -
11 Sobic.007G222200 - -
12 Sobic.003G009600 POEI21 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
13 Sobic.001G024300 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
14 Sobic.005G122100 expressed protein -
15 Sobic.001G332200 cysteine proteinase EP-B 1 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.006G136700 GPI-anchored protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G304300 integral membrane protein DUF6 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.009G116100 conserved hypothetical protein -
19 Sobic.007G103000 FGGY family of carbohydrate kinases, putative, expressed K00864: glpK, glycerol kinase
20 Sobic.006G270800 EF hand family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G032000 Sobic006G032000 Sobic009G098400 Sobic009G098400 Sobic006G032000--Sobic009G098400 Sobic005G214700 Sobic005G214700 Sobic006G032000--Sobic005G214700 Sobic004G187400 Sobic004G187400 Sobic006G032000--Sobic004G187400 Sobic010G271600 Sobic010G271600 Sobic006G032000--Sobic010G271600 Sobic010G190500 Sobic010G190500 Sobic006G032000--Sobic010G190500 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic006G032000--Sobic008G102850 Sobic002G417401 Sobic002G417401 Sobic006G032000--Sobic002G417401 Sobic006G022700 Sobic006G022700 Sobic006G032000--Sobic006G022700 Sobic009G090400 Sobic009G090400 Sobic006G032000--Sobic009G090400 Sobic009G098400--Sobic004G187400 Sobic009G098400--Sobic010G271600 Sobic009G098400--Sobic005G214700 Sobic009G098400--Sobic010G190500 Sobic009G098400--Sobic006G022700 Sobic009G098400--Sobic008G102850 Sobic002G304300 Sobic002G304300 Sobic009G098400--Sobic002G304300 Sobic003G009600 Sobic003G009600 Sobic009G098400--Sobic003G009600 Sobic006G215500 Sobic006G215500 Sobic009G098400--Sobic006G215500 Sobic005G214700--Sobic009G090400 Sobic002G157900 Sobic002G157900 Sobic005G214700--Sobic002G157900 Sobic005G214700--Sobic008G102850 Sobic005G214700--Sobic010G190500 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic005G214700--Sobic005G122100 Sobic007G222200 Sobic007G222200 Sobic005G214700--Sobic007G222200 Sobic005G214700--Sobic009G098400 Sobic005G214700--Sobic003G009600 Sobic001G024300 Sobic001G024300 Sobic005G214700--Sobic001G024300 Sobic004G187400--Sobic009G098400 Sobic004G187400--Sobic010G271600 Sobic004G187400--Sobic005G214700 Sobic004G187400--Sobic006G022700 Sobic004G187400--Sobic010G190500 Sobic004G187400--Sobic008G102850 Sobic004G187400--Sobic002G304300 Sobic003G405800 Sobic003G405800 Sobic004G187400--Sobic003G405800 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic004G187400--Sobic006G173400 Sobic010G271600--Sobic009G098400 Sobic010G271600--Sobic004G187400 Sobic010G271600--Sobic005G214700 Sobic010G271600--Sobic010G190500 Sobic010G271600--Sobic008G102850 Sobic010G271600--Sobic006G173400 Sobic005G065300 Sobic005G065300 Sobic010G271600--Sobic005G065300 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic010G271600--Sobic007G103000 Sobic010G271600--Sobic002G304300 Sobic010G190500--Sobic005G214700 Sobic010G190500--Sobic007G222200 Sobic010G190500--Sobic005G122100 Sobic010G190500--Sobic009G090400 Sobic010G190500--Sobic003G009600 Sobic010G190500--Sobic007G103000 Sobic010G190500--Sobic010G271600 Sobic010G190500--Sobic002G417401 Sobic010G190500--Sobic008G102850 Sobic008G102850--Sobic007G103000 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic008G102850--Sobic007G134260 Sobic008G102850--Sobic005G214700 Sobic008G102850--Sobic005G122100 Sobic008G102850--Sobic005G065300 Sobic003G147700 Sobic003G147700 Sobic008G102850--Sobic003G147700 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic008G102850--Sobic004G091000 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic008G102850--Sobic003G114800 Sobic003G232100 Sobic003G232100 Sobic008G102850--Sobic003G232100 Sobic002G417401--Sobic007G222200 Sobic002G417401--Sobic001G024300 Sobic001G332200 Sobic001G332200 Sobic002G417401--Sobic001G332200 Sobic002G417401--Sobic002G157900 Sobic002G417401--Sobic009G090400 Sobic006G136700 Sobic006G136700 Sobic002G417401--Sobic006G136700 Sobic009G116100 Sobic009G116100 Sobic002G417401--Sobic009G116100 Sobic002G417401--Sobic003G009600 Sobic002G091300 Sobic002G091300 Sobic002G417401--Sobic002G091300 Sobic006G022700--Sobic006G215500 Sobic001G220800 Sobic001G220800 Sobic006G022700--Sobic001G220800 Sobic004G071900 Sobic004G071900 Sobic006G022700--Sobic004G071900 Sobic006G022700--Sobic009G098400 Sobic003G313200 Sobic003G313200 Sobic006G022700--Sobic003G313200 Sobic004G350400 Sobic004G350400 Sobic006G022700--Sobic004G350400 Sobic002G279900 Sobic002G279900 Sobic006G022700--Sobic002G279900 Sobic006G022700--Sobic004G187400 Sobic001G135950 Sobic001G135950 Sobic006G022700--Sobic001G135950 Sobic009G090400--Sobic002G157900 Sobic009G090400--Sobic007G222200 Sobic009G090400--Sobic005G122100 Sobic009G090400--Sobic001G024300 Sobic009G090400--Sobic002G417401 Sobic009G090400--Sobic003G009600 Sobic009G090400--Sobic006G136700 Sobic009G090400--Sobic001G332200 Sobic009G090400--Sobic009G116100
Octagon: transcription factors


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