Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G076500.1
Synonym Sb06g016350
Functional annotation serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RCU0
Pfam PF08276 PF01453 PF00954 PF00069
Panther DB PTHR27002 PTHR27002:SF49
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G19130 : S-locus lectin protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g34330.1 : serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043273 , Zm00025a056029 , Zm00025a016057 , Zm00025a056031
Brachypodium KQK23765 , PNT61067 , KQJ82591
Barley HORVU3Hr1G117710.2 , HORVU3Hr1G117710.1 , HORVU2Hr1G002830.2 , HORVU2Hr1G002830.4 , HORVU1Hr1G077350.2 , HORVU2Hr1G002830.3 , HORVU2Hr1G002830.1 , HORVU3Hr1G090180.1 , HORVU3Hr1G090180.3 , HORVU3Hr1G090180.2 , HORVU3Hr1G090180.4 , HORVU2Hr1G121310.2 , HORVU2Hr1G121310.3 , HORVU2Hr1G121310.1
Wheat TraesCS2A02G039000 , TraesCS3B02G435200 , TraesCS3B02G435200 , TraesCS3A02G402100 , TraesCS3D02G397000 , TraesCS3D02G397000
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G185850 - -
2 Sobic.008G094900 - -
3 Sobic.002G168100 Plant PDR ABC transporter associated domain containing protein, expressed -
4 Sobic.007G031500 GEX1, putative, expressed -
5 Sobic.010G062950 - -
6 Sobic.008G079733 - -
7 Sobic.003G281700 pentatricopeptide, putative, expressed -
8 Sobic.001G299300 - -
9 Sobic.002G286500 carrier, putative, expressed -
10 Sobic.003G350850 - -
11 Sobic.006G075100 UDP-Glycosyltransferase superfamily protein(PubMedID : 26465154)@digalactosyldiacylglycerol synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K09480: digalactosyldiacylglycerol synthase
12 Sobic.007G223801 - -
13 Sobic.002G055500 Putative uncharacterized protein (Oryza sativa Indica Group)(PubMedID : 24655390)@Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@expressed protein -
14 Sobic.006G146150 - -
15 Sobic.004G238000 - -
16 Sobic.004G212250 - -
17 Sobic.001G075950 - -
18 Sobic.008G020600 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
19 Sobic.005G208275 - -
20 Sobic.003G023901 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G076500 Sobic006G076500 Sobic010G185850 Sobic010G185850 Sobic006G076500--Sobic010G185850 Sobic008G094900 Sobic008G094900 Sobic006G076500--Sobic008G094900 Sobic002G168100 Sobic002G168100 Sobic006G076500--Sobic002G168100 Sobic007G031500 Sobic007G031500 Sobic006G076500--Sobic007G031500 Sobic010G062950 Sobic010G062950 Sobic006G076500--Sobic010G062950 Sobic008G079733 Sobic008G079733 Sobic006G076500--Sobic008G079733 Sobic003G281700 Sobic003G281700 Sobic006G076500--Sobic003G281700 Sobic001G299300 Sobic001G299300 Sobic006G076500--Sobic001G299300 Sobic002G286500 Sobic002G286500 Sobic006G076500--Sobic002G286500 Sobic006G075100 Sobic006G075100 Sobic010G185850--Sobic006G075100 Sobic010G185850--Sobic002G168100 Sobic010G185850--Sobic010G062950 Sobic010G185850--Sobic007G031500 Sobic010G185850--Sobic008G079733 Sobic010G185850--Sobic008G094900 Sobic010G243800 Sobic010G243800 Sobic010G185850--Sobic010G243800 Sobic010G185850--Sobic006G076500 Sobic006G138850 Sobic006G138850 Sobic010G185850--Sobic006G138850 Sobic008G111150 Sobic008G111150 Sobic008G094900--Sobic008G111150 Sobic003G358000 Sobic003G358000 Sobic008G094900--Sobic003G358000 Sobic001G061300 Sobic001G061300 Sobic008G094900--Sobic001G061300 Sobic004G212250 Sobic004G212250 Sobic008G094900--Sobic004G212250 Sobic002G228300 Sobic002G228300 Sobic008G094900--Sobic002G228300 Sobic008G094900--Sobic008G079733 Sobic002G345900 Sobic002G345900 Sobic008G094900--Sobic002G345900 Sobic003G268500 Sobic003G268500 Sobic008G094900--Sobic003G268500 Sobic002G127300 Sobic002G127300 Sobic008G094900--Sobic002G127300 Sobic001G543000 Sobic001G543000 Sobic002G168100--Sobic001G543000 Sobic002G168100--Sobic010G062950 Sobic002G231700 Sobic002G231700 Sobic002G168100--Sobic002G231700 Sobic006G201350 Sobic006G201350 Sobic002G168100--Sobic006G201350 Sobic009G235801 Sobic009G235801 Sobic002G168100--Sobic009G235801 Sobic002G168100--Sobic007G031500 Sobic010G212900 Sobic010G212900 Sobic002G168100--Sobic010G212900 Sobic001G452400 Sobic001G452400 Sobic002G168100--Sobic001G452400 Sobic007G100275 Sobic007G100275 Sobic002G168100--Sobic007G100275 Sobic007G031500--Sobic010G062950 Sobic007G031500--Sobic002G168100 Sobic007G031500--Sobic006G138850 Sobic007G031500--Sobic006G075100 Sobic007G031500--Sobic006G201350 Sobic005G141900 Sobic005G141900 Sobic007G031500--Sobic005G141900 Sobic007G031500--Sobic001G543000 Sobic007G031500--Sobic008G079733 Sobic003G347480 Sobic003G347480 Sobic007G031500--Sobic003G347480 Sobic010G062950--Sobic007G031500 Sobic010G062950--Sobic002G168100 Sobic010G062950--Sobic006G201350 Sobic010G062950--Sobic006G138850 Sobic010G062950--Sobic001G543000 Sobic010G062950--Sobic005G141900 Sobic010G062950--Sobic006G075100 Sobic010G062950--Sobic004G212250 Sobic010G062950--Sobic002G231700 Sobic008G139250 Sobic008G139250 Sobic008G079733--Sobic008G139250 Sobic004G358200 Sobic004G358200 Sobic008G079733--Sobic004G358200 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic008G079733--Sobic005G031901 Sobic003G126750 Sobic003G126750 Sobic008G079733--Sobic003G126750 Sobic006G109600 Sobic006G109600 Sobic008G079733--Sobic006G109600 Sobic001G261464 Sobic001G261464 Sobic008G079733--Sobic001G261464 Sobic010G147300 Sobic010G147300 Sobic008G079733--Sobic010G147300 Sobic002G100100 Sobic002G100100 Sobic008G079733--Sobic002G100100 Sobic002G026150 Sobic002G026150 Sobic008G079733--Sobic002G026150 Sobic007G064000 Sobic007G064000 Sobic003G281700--Sobic007G064000 Sobic003G281700--Sobic003G126750 Sobic003G281700--Sobic005G031901 Sobic004G358301 Sobic004G358301 Sobic003G281700--Sobic004G358301 Sobic003G281700--Sobic010G147300 Sobic003G281700--Sobic006G109600 Sobic003G281700--Sobic001G261464 Sobic003G281700--Sobic002G100100 Sobic003G281700--Sobic004G358200 Sobic004G238000 Sobic004G238000 Sobic001G299300--Sobic004G238000 Sobic001G299300--Sobic004G212250 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic001G299300--Sobic003G076300 Sobic010G028366 Sobic010G028366 Sobic001G299300--Sobic010G028366 Sobic003G177350 Sobic003G177350 Sobic001G299300--Sobic003G177350 Sobic003G350850 Sobic003G350850 Sobic001G299300--Sobic003G350850 Sobic007G206900 Sobic007G206900 Sobic001G299300--Sobic007G206900 Sobic005G208275 Sobic005G208275 Sobic001G299300--Sobic005G208275 Sobic010G174000 Sobic010G174000 Sobic001G299300--Sobic010G174000 Sobic006G171801 Sobic006G171801 Sobic002G286500--Sobic006G171801 Sobic001G074900 Sobic001G074900 Sobic002G286500--Sobic001G074900 Sobic002G109900 Sobic002G109900 Sobic002G286500--Sobic002G109900 Sobic007G223801 Sobic007G223801 Sobic002G286500--Sobic007G223801 Sobic010G157600 Sobic010G157600 Sobic002G286500--Sobic010G157600 Sobic001G248900 Sobic001G248900 Sobic002G286500--Sobic001G248900 Sobic001G315300 Sobic001G315300 Sobic002G286500--Sobic001G315300 Sobic002G286500--Sobic010G028366 Sobic003G023901 Sobic003G023901 Sobic002G286500--Sobic003G023901
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.