Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G077500.1
Synonym Sb06g016460
Functional annotation integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PKV2
Pfam PF00892
Panther DB PTHR31218 PTHR31218:SF22
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane GO:0016020membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G25270 : nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g34530.1 : integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ82597
Barley HORVU2Hr1G074250.2 , HORVU2Hr1G074250.3 , HORVU2Hr1G074250.1 , HORVU4Hr1G070930.1 , HORVU4Hr1G070930.2
Wheat TraesCS4A02G041500 , TraesCS4D02G262600 , TraesCS2A02G300300 , TraesCS2D02G298200 , TraesCS2B02G316600
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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11 Sobic.010G035000 - -
12 Sobic.005G185400 - -
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14 Sobic.005G189000 - -
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16 Sobic.005G083220 - -
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18 Sobic.005G227151 - -
19 Sobic.009G256500 OsFtsH5 FtsH protease, homologue of AtFtsH4, expressed K08955: ATP-dependent metalloprotease
20 Sobic.008G082300 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G077500 Sobic006G077500 Sobic002G101500 Sobic002G101500 Sobic006G077500--Sobic002G101500 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic006G077500--Sobic007G049000 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic006G077500--Sobic005G184600 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic006G077500--Sobic005G184400 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic006G077500--Sobic005G186250 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic006G077500--Sobic006G142850 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic006G077500--Sobic009G007100 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic006G077500--Sobic004G207500 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic006G077500--Sobic005G184500 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic002G101500--Sobic005G227151 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic002G101500--Sobic002G105900 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic002G101500--Sobic003G319050 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic002G101500--Sobic004G029700 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic002G101500--Sobic008G184500 Sobic002G101500--Sobic006G142850 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic002G101500--Sobic008G184000 Sobic002G101500--Sobic004G207500 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic002G101500--Sobic003G099900 Sobic007G049000--Sobic005G184600 Sobic007G049000--Sobic005G184400 Sobic007G049000--Sobic006G142850 Sobic007G049000--Sobic005G186250 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic007G049000--Sobic006G105300 Sobic007G049000--Sobic009G007100 Sobic007G049000--Sobic005G184500 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic007G049000--Sobic010G035000 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic007G049000--Sobic005G185400 Sobic005G184600--Sobic005G184400 Sobic005G184600--Sobic007G049000 Sobic005G184600--Sobic006G142850 Sobic005G184600--Sobic006G105300 Sobic005G184600--Sobic005G184500 Sobic005G184600--Sobic005G186250 Sobic005G184600--Sobic010G035000 Sobic005G184600--Sobic009G007100 Sobic005G184600--Sobic005G185400 Sobic005G184400--Sobic005G184600 Sobic005G184400--Sobic007G049000 Sobic005G184400--Sobic006G142850 Sobic005G184400--Sobic006G105300 Sobic005G184400--Sobic005G184500 Sobic005G184400--Sobic010G035000 Sobic005G184400--Sobic005G186250 Sobic005G184400--Sobic009G007100 Sobic005G184400--Sobic005G185400 Sobic005G186250--Sobic009G007100 Sobic005G186250--Sobic007G049000 Sobic005G186250--Sobic006G142850 Sobic005G186250--Sobic004G207500 Sobic005G186250--Sobic005G184400 Sobic005G186250--Sobic005G184600 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic005G186250--Sobic005G189000 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic005G186250--Sobic005G083220 Sobic005G186250--Sobic006G105300 Sobic006G142850--Sobic007G049000 Sobic006G142850--Sobic005G184600 Sobic006G142850--Sobic005G184400 Sobic006G142850--Sobic005G186250 Sobic006G142850--Sobic006G105300 Sobic006G142850--Sobic009G007100 Sobic006G142850--Sobic010G035000 Sobic006G142850--Sobic004G207500 Sobic006G142850--Sobic005G184500 Sobic009G007100--Sobic005G186250 Sobic009G007100--Sobic007G049000 Sobic009G007100--Sobic005G184400 Sobic009G007100--Sobic006G142850 Sobic009G007100--Sobic005G184600 Sobic009G007100--Sobic004G207500 Sobic009G007100--Sobic005G189000 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic009G007100--Sobic002G358000 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic009G007100--Sobic008G082300 Sobic004G207500--Sobic005G186250 Sobic004G207500--Sobic009G007100 Sobic004G207500--Sobic005G189000 Sobic004G207500--Sobic005G227151 Sobic004G207500--Sobic006G142850 Sobic004G207500--Sobic005G083220 Sobic004G207500--Sobic002G105900 Sobic004G207500--Sobic007G049000 Sobic004G207500--Sobic003G099900 Sobic005G184500--Sobic005G185400 Sobic005G184500--Sobic006G105300 Sobic005G184500--Sobic005G184600 Sobic005G184500--Sobic005G184400 Sobic005G184500--Sobic007G049000 Sobic005G184500--Sobic010G035000 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic005G184500--Sobic001G297700 Sobic005G184500--Sobic006G142850 Sobic010G031400 Sobic010G031400 Sobic005G184500--Sobic010G031400
Octagon: transcription factors


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